MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	GCGGGC	2	12	5055	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109122
2	NC_011991	CCTGGA	2	12	5315	5326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109122
3	NC_011991	ACGGCG	2	12	15235	15246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109131
4	NC_011991	ACAACG	2	12	15358	15369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222109131
5	NC_011991	CAGTTG	2	12	20591	20602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222109136
6	NC_011991	GCCACG	2	12	23594	23605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222109138
7	NC_011991	ATGGAA	2	12	25853	25864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222109140
8	NC_011991	CGGCTG	2	12	37784	37795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222109148
9	NC_011991	CCGATC	2	12	41561	41572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222109151
10	NC_011991	AAGCGA	2	12	51903	51914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222109164
11	NC_011991	GTCGAT	2	12	55618	55629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222109167
12	NC_011991	CGGTAT	2	12	63027	63038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222109177
13	NC_011991	GCCGCG	2	12	65428	65439	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
14	NC_011991	GAGGCG	2	12	66094	66105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222109180
15	NC_011991	CTTGTC	2	12	66862	66873	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222109180
16	NC_011991	GCGCCA	2	12	66966	66977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222109180
17	NC_011991	GACCAC	2	12	68235	68246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222109180
18	NC_011991	CAGGCG	2	12	69391	69402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109180
19	NC_011991	GGTGTC	7	42	72649	72690	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222109184
20	NC_011991	TCTTCA	2	12	76488	76499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222109189
21	NC_011991	TGCGTG	2	12	82505	82516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222109194
22	NC_011991	TCATCG	2	12	88329	88340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222109201
23	NC_011991	ACGATC	2	12	89478	89489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222109202
24	NC_011991	TCGGCT	2	12	94026	94037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109206
25	NC_011991	ACGGCG	2	12	96552	96563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109207
26	NC_011991	TCGTGC	2	12	102521	102532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
27	NC_011991	CGATTA	2	12	108655	108666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222109209
28	NC_011991	CCTGCC	2	12	118851	118862	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222109213
29	NC_011991	CGGTCG	2	12	119584	119595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222109214
30	NC_011991	GCTGCA	2	12	120457	120468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109215
31	NC_011991	GTGGCG	2	12	123778	123789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222109219
32	NC_011991	CATGAA	2	12	125163	125174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222109219
33	NC_011991	CGGCGC	2	12	127320	127331	0 %	0 %	50 %	50 %	222109222

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.