MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	TGAA	2	8	35	42	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011991	GAGC	2	8	16176	16183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011991	TATC	2	8	16403	16410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011991	TGTT	2	8	24372	24379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011991	TTAG	2	8	25484	25491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011991	GTCG	2	8	27863	27870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011991	GCCT	2	8	33550	33557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011991	CCGC	2	8	33783	33790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_011991	AAGT	2	8	35711	35718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011991	AAAG	2	8	36925	36932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011991	GCCG	2	8	36937	36944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011991	CATC	2	8	44766	44773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011991	TCAT	2	8	49011	49018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011991	TTTC	2	8	49019	49026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011991	GGTT	2	8	50528	50535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011991	GATC	2	8	52355	52362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011991	GATC	2	8	52969	52976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011991	CCGC	2	8	53157	53164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011991	GTCA	2	8	53205	53212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011991	CGTG	2	8	55853	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011991	ACTG	2	8	56926	56933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011991	CGAT	2	8	57052	57059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011991	ACCC	2	8	57194	57201	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_011991	GGCC	2	8	57774	57781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011991	CCAT	2	8	57825	57832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011991	ACCC	2	8	59700	59707	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011991	GACA	2	8	60362	60369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011991	CCGA	2	8	61432	61439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011991	AAGC	2	8	62651	62658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011991	TGCT	2	8	65159	65166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011991	CTTT	2	8	65168	65175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011991	CTTC	2	8	65203	65210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011991	GCTG	2	8	71215	71222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011991	GGAT	2	8	71280	71287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011991	ACCG	2	8	72444	72451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011991	TTGG	2	8	73459	73466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011991	CAAG	2	8	74115	74122	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011991	ATCG	2	8	83637	83644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011991	CTTC	2	8	95331	95338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011991	TCGC	2	8	95436	95443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011991	TGAA	2	8	95571	95578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011991	TGGC	2	8	95597	95604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011991	GGAC	2	8	95688	95695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011991	GAGC	2	8	115875	115882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011991	CTGA	2	8	117368	117375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011991	TCAA	2	8	127761	127768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011991	TTGA	2	8	127896	127903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011991	TGCG	2	8	128126	128133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.