MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	TCG	2	6	43	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011991	AAC	2	6	208	213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011991	GCG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011991	CGT	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011991	CTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011991	TAC	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011991	TCT	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011991	GGC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011991	GTG	2	6	8811	8816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011991	CAT	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011991	CGG	2	6	8877	8882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011991	CCT	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011991	CAG	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011991	CGG	2	6	9086	9091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011991	AGT	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011991	TGG	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011991	AGT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011991	TTG	2	6	11915	11920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011991	GCT	2	6	11997	12002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011991	TCG	2	6	16025	16030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011991	GCC	2	6	16044	16049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011991	GGC	2	6	16074	16079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011991	TGA	2	6	16155	16160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011991	AGC	2	6	16395	16400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011991	CAA	2	6	16758	16763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011991	GAG	2	6	17130	17135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011991	TGC	2	6	17215	17220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011991	CGT	2	6	17251	17256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011991	TAT	2	6	18721	18726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011991	ATC	2	6	19363	19368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011991	TCA	2	6	19404	19409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011991	CGC	2	6	19501	19506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011991	AAC	2	6	19584	19589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011991	GTG	2	6	19618	19623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011991	ACG	2	6	19679	19684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011991	CTT	2	6	19692	19697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011991	GCG	2	6	22512	22517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011991	CTG	2	6	24438	24443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011991	CAG	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011991	GTT	2	6	25368	25373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011991	TCT	2	6	26637	26642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011991	GTT	2	6	27773	27778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011991	GCC	2	6	27949	27954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011991	GAA	2	6	28009	28014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011991	GCC	2	6	28019	28024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011991	CTT	2	6	33504	33509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011991	GAT	2	6	33607	33612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011991	AGG	2	6	33626	33631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011991	GCA	2	6	33714	33719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011991	TTG	2	6	35610	35615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011991	TAA	2	6	35697	35702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011991	CAA	2	6	38995	39000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011991	GAA	2	6	44220	44225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011991	ACC	2	6	44751	44756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011991	CGC	2	6	44909	44914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011991	GAT	2	6	44970	44975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011991	GCC	2	6	44982	44987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011991	TGT	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011991	GGA	2	6	45095	45100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011991	TTC	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011991	AGA	2	6	45627	45632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011991	CGG	2	6	45995	46000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011991	CGC	2	6	49040	49045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011991	CGG	3	9	49053	49061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011991	CAA	2	6	49080	49085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011991	GGA	2	6	49086	49091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011991	GTT	2	6	51709	51714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011991	TAT	2	6	52335	52340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011991	GCC	2	6	52388	52393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011991	CCG	2	6	52453	52458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011991	CGG	2	6	52733	52738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011991	GAA	2	6	52930	52935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011991	AAT	2	6	53000	53005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011991	ATC	2	6	53022	53027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011991	GAT	2	6	53100	53105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011991	GCC	2	6	53128	53133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011991	TGA	2	6	53151	53156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011991	TCC	2	6	53232	53237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011991	CGG	2	6	53269	53274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011991	CCT	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011991	GCC	2	6	53313	53318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011991	GGC	2	6	53335	53340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011991	ACG	2	6	55799	55804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011991	TGA	2	6	55806	55811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011991	CGT	2	6	55866	55871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011991	CGC	2	6	56283	56288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011991	TGG	3	9	56958	56966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011991	TCT	2	6	57097	57102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011991	TTC	2	6	57178	57183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011991	CGC	2	6	57232	57237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011991	GCA	2	6	57794	57799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011991	CGA	2	6	57961	57966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011991	ACG	2	6	58011	58016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011991	TCT	2	6	58027	58032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011991	ATT	2	6	58130	58135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011991	CGA	2	6	58170	58175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011991	TCT	2	6	59603	59608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011991	TTC	2	6	59684	59689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011991	CGC	2	6	59738	59743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011991	ACG	2	6	60328	60333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011991	CTG	2	6	60382	60387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011991	CGC	2	6	60401	60406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011991	ATT	2	6	60840	60845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011991	CGC	2	6	60950	60955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011991	CAC	2	6	61421	61426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011991	TTA	2	6	61449	61454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011991	CTG	2	6	61470	61475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011991	GGA	2	6	61510	61515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011991	CGC	2	6	61562	61567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011991	TCC	2	6	61608	61613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011991	TGC	2	6	61618	61623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011991	GCA	2	6	61637	61642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011991	CAA	2	6	61705	61710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011991	CTT	2	6	61773	61778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011991	TTC	2	6	61822	61827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011991	CTC	2	6	62674	62679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011991	GCC	2	6	62727	62732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011991	GGA	2	6	65189	65194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011991	TGC	2	6	65304	65309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011991	TTC	2	6	71242	71247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011991	TCA	2	6	71308	71313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011991	GGT	2	6	71420	71425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011991	GCA	3	9	71450	71458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011991	TCG	2	6	71503	71508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011991	GTG	2	6	72554	72559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011991	GAG	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011991	GAT	2	6	73218	73223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011991	GCC	2	6	73255	73260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011991	CGC	2	6	73345	73350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011991	AAG	2	6	73503	73508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011991	GAT	2	6	74157	74162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011991	TGC	2	6	74190	74195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011991	CGA	2	6	74285	74290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011991	GAA	2	6	74300	74305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011991	TCT	2	6	74406	74411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011991	TGA	2	6	74440	74445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011991	TCC	2	6	75142	75147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011991	TAG	2	6	75216	75221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011991	CGT	2	6	76377	76382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011991	CGT	2	6	77706	77711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.