MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	TC	3	6	74	79	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011991	TC	3	6	1019	1024	0 %	50 %	0 %	50 %	222109118
3	NC_011991	GC	3	6	1993	1998	0 %	0 %	50 %	50 %	222109119
4	NC_011991	GC	3	6	2827	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
5	NC_011991	CG	3	6	3666	3671	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
6	NC_011991	CG	3	6	3866	3871	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
7	NC_011991	GC	3	6	4140	4145	0 %	0 %	50 %	50 %	222109121
8	NC_011991	CG	3	6	4189	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	222109121
9	NC_011991	GA	3	6	4451	4456	50 %	0 %	50 %	0 %	222109121
10	NC_011991	GT	3	6	4696	4701	0 %	50 %	50 %	0 %	222109121
11	NC_011991	TG	3	6	5722	5727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011991	AT	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011991	CT	3	6	6374	6379	0 %	50 %	0 %	50 %	222109124
14	NC_011991	GC	3	6	7103	7108	0 %	0 %	50 %	50 %	222109125
15	NC_011991	GC	3	6	7861	7866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109126
16	NC_011991	CG	3	6	8914	8919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011991	GC	3	6	9501	9506	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
18	NC_011991	GC	3	6	9706	9711	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
19	NC_011991	CG	3	6	9910	9915	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
20	NC_011991	AT	3	6	10361	10366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011991	TA	4	8	10558	10565	50 %	50 %	0 %	0 %	222109129
22	NC_011991	TC	3	6	10643	10648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109129
23	NC_011991	CT	3	6	11176	11181	0 %	50 %	0 %	50 %	222109130
24	NC_011991	TC	3	6	11197	11202	0 %	50 %	0 %	50 %	222109130
25	NC_011991	GC	3	6	11275	11280	0 %	0 %	50 %	50 %	222109130
26	NC_011991	AC	3	6	12134	12139	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
27	NC_011991	CG	3	6	12450	12455	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
28	NC_011991	GC	3	6	13019	13024	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
29	NC_011991	AG	3	6	13070	13075	50 %	0 %	50 %	0 %	222109131
30	NC_011991	GA	3	6	13451	13456	50 %	0 %	50 %	0 %	222109131
31	NC_011991	CA	3	6	13537	13542	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
32	NC_011991	CG	3	6	14962	14967	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
33	NC_011991	CA	3	6	15144	15149	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
34	NC_011991	GC	3	6	15420	15425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
35	NC_011991	AC	3	6	16325	16330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011991	GC	3	6	17364	17369	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
37	NC_011991	CG	3	6	17433	17438	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
38	NC_011991	GC	5	10	18339	18348	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
39	NC_011991	GC	3	6	18469	18474	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
40	NC_011991	CT	3	6	18750	18755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011991	TC	3	6	19354	19359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011991	CG	3	6	19683	19688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011991	AT	3	6	19834	19839	50 %	50 %	0 %	0 %	222109136
44	NC_011991	TC	3	6	21136	21141	0 %	50 %	0 %	50 %	222109137
45	NC_011991	CG	3	6	21646	21651	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
46	NC_011991	GC	3	6	21758	21763	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
47	NC_011991	CG	5	10	21922	21931	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
48	NC_011991	AC	3	6	22247	22252	50 %	0 %	0 %	50 %	222109137
49	NC_011991	AG	3	6	22384	22389	50 %	0 %	50 %	0 %	222109137
50	NC_011991	TC	3	6	23141	23146	0 %	50 %	0 %	50 %	222109138
51	NC_011991	CG	4	8	23755	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	222109138
52	NC_011991	CT	3	6	26491	26496	0 %	50 %	0 %	50 %	222109140
53	NC_011991	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	222109142
54	NC_011991	GC	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	222109142
55	NC_011991	TC	3	6	29264	29269	0 %	50 %	0 %	50 %	222109142
56	NC_011991	GC	3	6	29882	29887	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
57	NC_011991	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
58	NC_011991	GA	3	6	30487	30492	50 %	0 %	50 %	0 %	222109143
59	NC_011991	CT	3	6	30643	30648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109143
60	NC_011991	GT	3	6	31315	31320	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
61	NC_011991	GC	3	6	31806	31811	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
62	NC_011991	AG	3	6	33301	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011991	GC	3	6	33465	33470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011991	CG	3	6	36112	36117	0 %	0 %	50 %	50 %	222109145
65	NC_011991	GA	3	6	36429	36434	50 %	0 %	50 %	0 %	222109146
66	NC_011991	AG	4	8	36964	36971	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
67	NC_011991	TC	3	6	37372	37377	0 %	50 %	0 %	50 %	222109148
68	NC_011991	GA	3	6	37741	37746	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
69	NC_011991	GC	3	6	37763	37768	0 %	0 %	50 %	50 %	222109148
70	NC_011991	AG	4	8	37857	37864	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
71	NC_011991	AG	3	6	37993	37998	50 %	0 %	50 %	0 %	222109149
72	NC_011991	GC	3	6	38042	38047	0 %	0 %	50 %	50 %	222109149
73	NC_011991	CG	3	6	39391	39396	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
74	NC_011991	GC	3	6	39553	39558	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
75	NC_011991	CG	3	6	39747	39752	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
76	NC_011991	TC	3	6	40346	40351	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
77	NC_011991	TC	3	6	41091	41096	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
78	NC_011991	GC	3	6	41509	41514	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
79	NC_011991	GC	3	6	41934	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
80	NC_011991	CG	3	6	41953	41958	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
81	NC_011991	TC	3	6	43345	43350	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
82	NC_011991	GC	3	6	43384	43389	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
83	NC_011991	GC	3	6	44420	44425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109152
84	NC_011991	GC	3	6	44913	44918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011991	CG	3	6	45486	45491	0 %	0 %	50 %	50 %	222109153
86	NC_011991	TC	3	6	46285	46290	0 %	50 %	0 %	50 %	222109155
87	NC_011991	CG	3	6	46471	46476	0 %	0 %	50 %	50 %	222109155
88	NC_011991	GC	3	6	46490	46495	0 %	0 %	50 %	50 %	222109155
89	NC_011991	TA	3	6	46905	46910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011991	CG	3	6	47235	47240	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
91	NC_011991	GC	3	6	47946	47951	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
92	NC_011991	CG	3	6	48296	48301	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
93	NC_011991	CG	3	6	48544	48549	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
94	NC_011991	CG	3	6	48692	48697	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
95	NC_011991	AC	3	6	48853	48858	50 %	0 %	0 %	50 %	222109158
96	NC_011991	CG	3	6	49270	49275	0 %	0 %	50 %	50 %	222109159
97	NC_011991	GC	3	6	49705	49710	0 %	0 %	50 %	50 %	222109160
98	NC_011991	GC	3	6	50590	50595	0 %	0 %	50 %	50 %	222109162
99	NC_011991	CT	3	6	50876	50881	0 %	50 %	0 %	50 %	222109162
100	NC_011991	CG	3	6	51997	52002	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
101	NC_011991	GC	3	6	52043	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
102	NC_011991	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
103	NC_011991	TC	3	6	52467	52472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011991	AG	3	6	52746	52751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011991	GC	3	6	53387	53392	0 %	0 %	50 %	50 %	222109165
106	NC_011991	AG	3	6	54272	54277	50 %	0 %	50 %	0 %	222109165
107	NC_011991	GC	3	6	54646	54651	0 %	0 %	50 %	50 %	222109166
108	NC_011991	GA	3	6	55326	55331	50 %	0 %	50 %	0 %	222109167
109	NC_011991	GC	3	6	55575	55580	0 %	0 %	50 %	50 %	222109167
110	NC_011991	TG	3	6	55687	55692	0 %	50 %	50 %	0 %	222109167
111	NC_011991	CG	3	6	55812	55817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011991	GC	3	6	56243	56248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011991	GC	3	6	56516	56521	0 %	0 %	50 %	50 %	222109169
114	NC_011991	CG	3	6	57245	57250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011991	CG	3	6	59068	59073	0 %	0 %	50 %	50 %	222109171
116	NC_011991	GC	3	6	59420	59425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109171
117	NC_011991	TC	3	6	60658	60663	0 %	50 %	0 %	50 %	222109173
118	NC_011991	TC	3	6	62507	62512	0 %	50 %	0 %	50 %	222109176
119	NC_011991	TC	3	6	63510	63515	0 %	50 %	0 %	50 %	222109177
120	NC_011991	CG	3	6	63753	63758	0 %	0 %	50 %	50 %	222109177
121	NC_011991	GA	3	6	64495	64500	50 %	0 %	50 %	0 %	222109177
122	NC_011991	CG	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109178
123	NC_011991	TC	3	6	64907	64912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011991	CG	3	6	65072	65077	0 %	0 %	50 %	50 %	222109179
125	NC_011991	CT	3	6	65363	65368	0 %	50 %	0 %	50 %	222109180
126	NC_011991	GC	3	6	65740	65745	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
127	NC_011991	CG	3	6	66165	66170	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
128	NC_011991	CG	3	6	66479	66484	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
129	NC_011991	GC	3	6	67009	67014	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
130	NC_011991	AC	3	6	67718	67723	50 %	0 %	0 %	50 %	222109180
131	NC_011991	GC	3	6	68255	68260	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
132	NC_011991	TG	3	6	68268	68273	0 %	50 %	50 %	0 %	222109180
133	NC_011991	CG	3	6	69784	69789	0 %	0 %	50 %	50 %	222109181
134	NC_011991	CG	3	6	69938	69943	0 %	0 %	50 %	50 %	222109181
135	NC_011991	TC	3	6	69958	69963	0 %	50 %	0 %	50 %	222109181
136	NC_011991	CG	3	6	70154	70159	0 %	0 %	50 %	50 %	222109182
137	NC_011991	GC	3	6	71192	71197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011991	GC	3	6	71743	71748	0 %	0 %	50 %	50 %	222109183
139	NC_011991	AT	3	6	71751	71756	50 %	50 %	0 %	0 %	222109183
140	NC_011991	GC	3	6	72525	72530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011991	CG	4	8	72712	72719	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
142	NC_011991	CG	4	8	72860	72867	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
143	NC_011991	TC	3	6	72912	72917	0 %	50 %	0 %	50 %	222109184
144	NC_011991	TG	3	6	73261	73266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011991	GT	3	6	74026	74031	0 %	50 %	50 %	0 %	222109186
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.