MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	TC	3	6	74	79	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011991	TG	3	6	5722	5727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011991	AT	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011991	CG	3	6	8914	8919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011991	AT	3	6	10361	10366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011991	AC	3	6	16325	16330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011991	CT	3	6	18750	18755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011991	TC	3	6	19354	19359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011991	CG	3	6	19683	19688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011991	AG	3	6	33301	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011991	GC	3	6	33465	33470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011991	GC	3	6	44913	44918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011991	TA	3	6	46905	46910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011991	TC	3	6	52467	52472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011991	AG	3	6	52746	52751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011991	CG	3	6	55812	55817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011991	GC	3	6	56243	56248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011991	CG	3	6	57245	57250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011991	TC	3	6	64907	64912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011991	GC	3	6	71192	71197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011991	GC	3	6	72525	72530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011991	TG	3	6	73261	73266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011991	TG	3	6	74306	74311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011991	AT	3	6	78761	78766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011991	AC	3	6	82201	82206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011991	GA	3	6	82286	82291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011991	AT	3	6	95314	95319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011991	TC	3	6	115856	115861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011991	TC	3	6	120703	120708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011991	GC	3	6	125802	125807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011991	GC	3	6	125824	125829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011991	GA	3	6	127718	127723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011991	CT	3	6	127928	127933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011991	GC	3	6	130094	130099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011991	GC	5	10	130215	130224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011991	AT	3	6	130346	130351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.