MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011990	CCGG	2	8	7123	7130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011990	AGGC	2	8	11228	11235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011990	GCTG	2	8	12648	12655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011990	CAAC	2	8	13099	13106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011990	CCAC	2	8	15638	15645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_011990	CTGG	2	8	19815	19822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011990	CGAC	2	8	19994	20001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011990	GTGC	2	8	27991	27998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011990	GCCG	2	8	30914	30921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011990	CCCA	2	8	32127	32134	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_011990	AAGG	2	8	37407	37414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011990	GAAT	2	8	39440	39447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011990	GCCC	2	8	42083	42090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_011990	GCCT	2	8	53377	53384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011990	GTCG	2	8	54235	54242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011990	ATCC	2	8	64968	64975	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011990	TTGC	2	8	65064	65071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011990	GATA	2	8	70500	70507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011990	GAAT	2	8	70784	70791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011990	TTGA	2	8	71456	71463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011990	CGAG	2	8	72069	72076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011990	GCTT	2	8	77554	77561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011990	CAAT	2	8	88137	88144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011990	ACCA	2	8	91071	91078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011990	GAGC	2	8	91135	91142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011990	CAGC	2	8	101202	101209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011990	AGGC	2	8	101265	101272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011990	GATT	2	8	101317	101324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011990	GCTC	2	8	101358	101365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011990	GGAA	2	8	107605	107612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011990	GATT	2	8	109285	109292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011990	CAAT	2	8	109301	109308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011990	TTCA	2	8	113555	113562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011990	GGCC	2	8	129636	129643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011990	CTAG	2	8	131209	131216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011990	GCAC	2	8	131289	131296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011990	GCTC	2	8	142915	142922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011990	GAAA	2	8	148138	148145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011990	GCGG	2	8	178866	178873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011990	GTCA	2	8	184418	184425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011990	CTTT	2	8	184618	184625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.