MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011990	TA	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011990	GC	3	6	452	457	0 %	0 %	50 %	50 %	222108941
3	NC_011990	GC	3	6	778	783	0 %	0 %	50 %	50 %	222108941
4	NC_011990	GC	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	222108941
5	NC_011990	GC	3	6	1387	1392	0 %	0 %	50 %	50 %	222108941
6	NC_011990	CG	5	10	1532	1541	0 %	0 %	50 %	50 %	222108942
7	NC_011990	TC	3	6	2335	2340	0 %	50 %	0 %	50 %	222108942
8	NC_011990	GC	3	6	2600	2605	0 %	0 %	50 %	50 %	222108943
9	NC_011990	CG	3	6	3041	3046	0 %	0 %	50 %	50 %	222108943
10	NC_011990	AG	3	6	3176	3181	50 %	0 %	50 %	0 %	222108943
11	NC_011990	CG	3	6	3503	3508	0 %	0 %	50 %	50 %	222108944
12	NC_011990	CG	4	8	3774	3781	0 %	0 %	50 %	50 %	222108944
13	NC_011990	CA	3	6	3806	3811	50 %	0 %	0 %	50 %	222108944
14	NC_011990	GA	3	6	4671	4676	50 %	0 %	50 %	0 %	222108945
15	NC_011990	GC	3	6	4792	4797	0 %	0 %	50 %	50 %	222108945
16	NC_011990	GC	3	6	5442	5447	0 %	0 %	50 %	50 %	222108946
17	NC_011990	GC	3	6	5516	5521	0 %	0 %	50 %	50 %	222108946
18	NC_011990	TC	3	6	5601	5606	0 %	50 %	0 %	50 %	222108946
19	NC_011990	GC	4	8	5766	5773	0 %	0 %	50 %	50 %	222108946
20	NC_011990	GC	4	8	6266	6273	0 %	0 %	50 %	50 %	222108946
21	NC_011990	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	222108946
22	NC_011990	GA	5	10	7088	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	222108947
23	NC_011990	GC	3	6	7751	7756	0 %	0 %	50 %	50 %	222108948
24	NC_011990	TG	3	6	7883	7888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011990	AC	3	6	8763	8768	50 %	0 %	0 %	50 %	222108949
26	NC_011990	GC	3	6	8810	8815	0 %	0 %	50 %	50 %	222108949
27	NC_011990	AG	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011990	AT	3	6	10458	10463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011990	TG	3	6	10536	10541	0 %	50 %	50 %	0 %	222108952
30	NC_011990	GT	3	6	10699	10704	0 %	50 %	50 %	0 %	222108952
31	NC_011990	GC	3	6	11162	11167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011990	AG	3	6	11463	11468	50 %	0 %	50 %	0 %	222108953
33	NC_011990	CG	3	6	12009	12014	0 %	0 %	50 %	50 %	222108954
34	NC_011990	AC	3	6	12445	12450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011990	CT	3	6	12542	12547	0 %	50 %	0 %	50 %	222108955
36	NC_011990	GC	3	6	13166	13171	0 %	0 %	50 %	50 %	222108957
37	NC_011990	GC	3	6	13251	13256	0 %	0 %	50 %	50 %	222108957
38	NC_011990	CT	3	6	13545	13550	0 %	50 %	0 %	50 %	222108957
39	NC_011990	TC	4	8	13814	13821	0 %	50 %	0 %	50 %	222108958
40	NC_011990	CG	3	6	14118	14123	0 %	0 %	50 %	50 %	222108959
41	NC_011990	GC	3	6	14820	14825	0 %	0 %	50 %	50 %	222108959
42	NC_011990	CT	4	8	16509	16516	0 %	50 %	0 %	50 %	222108961
43	NC_011990	CG	3	6	16603	16608	0 %	0 %	50 %	50 %	222108961
44	NC_011990	TC	3	6	16761	16766	0 %	50 %	0 %	50 %	222108961
45	NC_011990	TC	3	6	17298	17303	0 %	50 %	0 %	50 %	222108962
46	NC_011990	AT	3	6	17688	17693	50 %	50 %	0 %	0 %	222108962
47	NC_011990	CG	4	8	18123	18130	0 %	0 %	50 %	50 %	222108963
48	NC_011990	GC	3	6	19146	19151	0 %	0 %	50 %	50 %	222108964
49	NC_011990	AC	3	6	19517	19522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011990	GC	3	6	19650	19655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011990	GC	3	6	20335	20340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011990	GC	3	6	21190	21195	0 %	0 %	50 %	50 %	222108965
53	NC_011990	GC	4	8	22335	22342	0 %	0 %	50 %	50 %	222108966
54	NC_011990	GC	3	6	22560	22565	0 %	0 %	50 %	50 %	222108966
55	NC_011990	CG	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
56	NC_011990	CG	3	6	23515	23520	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
57	NC_011990	CG	3	6	23936	23941	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
58	NC_011990	GC	3	6	24450	24455	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
59	NC_011990	TC	3	6	24869	24874	0 %	50 %	0 %	50 %	222108967
60	NC_011990	CG	3	6	24954	24959	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
61	NC_011990	CG	3	6	25657	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
62	NC_011990	GC	3	6	25788	25793	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
63	NC_011990	CG	3	6	26422	26427	0 %	0 %	50 %	50 %	222108967
64	NC_011990	GC	3	6	27121	27126	0 %	0 %	50 %	50 %	222108968
65	NC_011990	CG	3	6	27487	27492	0 %	0 %	50 %	50 %	222108968
66	NC_011990	CG	3	6	28024	28029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011990	GC	3	6	29057	29062	0 %	0 %	50 %	50 %	222108970
68	NC_011990	CG	3	6	29217	29222	0 %	0 %	50 %	50 %	222108970
69	NC_011990	GC	3	6	29647	29652	0 %	0 %	50 %	50 %	222108970
70	NC_011990	GC	3	6	30378	30383	0 %	0 %	50 %	50 %	222108972
71	NC_011990	GC	3	6	30666	30671	0 %	0 %	50 %	50 %	222108972
72	NC_011990	CG	3	6	31453	31458	0 %	0 %	50 %	50 %	222108973
73	NC_011990	CG	3	6	32078	32083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011990	CG	3	6	32191	32196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011990	GC	3	6	32466	32471	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
76	NC_011990	CG	3	6	32530	32535	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
77	NC_011990	GC	3	6	32943	32948	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
78	NC_011990	GC	3	6	33150	33155	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
79	NC_011990	AT	3	6	33158	33163	50 %	50 %	0 %	0 %	222108974
80	NC_011990	CG	3	6	33904	33909	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
81	NC_011990	CG	3	6	34361	34366	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
82	NC_011990	CG	4	8	35000	35007	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
83	NC_011990	GC	3	6	35075	35080	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
84	NC_011990	CG	4	8	35092	35099	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
85	NC_011990	CG	3	6	35499	35504	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
86	NC_011990	GC	3	6	36525	36530	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
87	NC_011990	CG	3	6	37186	37191	0 %	0 %	50 %	50 %	222108974
88	NC_011990	TC	3	6	38237	38242	0 %	50 %	0 %	50 %	222108975
89	NC_011990	CG	3	6	38925	38930	0 %	0 %	50 %	50 %	222108975
90	NC_011990	CG	3	6	40708	40713	0 %	0 %	50 %	50 %	222108977
91	NC_011990	GC	3	6	40806	40811	0 %	0 %	50 %	50 %	222108977
92	NC_011990	GC	3	6	41889	41894	0 %	0 %	50 %	50 %	222108981
93	NC_011990	GC	3	6	43996	44001	0 %	0 %	50 %	50 %	222108983
94	NC_011990	GC	3	6	44090	44095	0 %	0 %	50 %	50 %	222108984
95	NC_011990	TC	3	6	45012	45017	0 %	50 %	0 %	50 %	222108985
96	NC_011990	CG	3	6	45538	45543	0 %	0 %	50 %	50 %	222108986
97	NC_011990	TC	3	6	46052	46057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011990	GA	3	6	46317	46322	50 %	0 %	50 %	0 %	222108987
99	NC_011990	GC	3	6	46790	46795	0 %	0 %	50 %	50 %	222108988
100	NC_011990	GT	3	6	47045	47050	0 %	50 %	50 %	0 %	222108988
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102	NC_011990	AT	3	6	48089	48094	50 %	50 %	0 %	0 %	222108989
103	NC_011990	AG	3	6	48136	48141	50 %	0 %	50 %	0 %	222108989
104	NC_011990	GA	3	6	48236	48241	50 %	0 %	50 %	0 %	222108989
105	NC_011990	TC	3	6	48583	48588	0 %	50 %	0 %	50 %	222108990
106	NC_011990	GC	3	6	48671	48676	0 %	0 %	50 %	50 %	222108990
107	NC_011990	TC	3	6	48690	48695	0 %	50 %	0 %	50 %	222108990
108	NC_011990	GC	3	6	48970	48975	0 %	0 %	50 %	50 %	222108990
109	NC_011990	CG	3	6	49552	49557	0 %	0 %	50 %	50 %	222108991
110	NC_011990	CG	3	6	49790	49795	0 %	0 %	50 %	50 %	222108991
111	NC_011990	CG	3	6	49999	50004	0 %	0 %	50 %	50 %	222108991
112	NC_011990	CG	3	6	50270	50275	0 %	0 %	50 %	50 %	222108991
113	NC_011990	CA	3	6	50742	50747	50 %	0 %	0 %	50 %	222108991
114	NC_011990	GC	3	6	50779	50784	0 %	0 %	50 %	50 %	222108991
115	NC_011990	AG	3	6	51069	51074	50 %	0 %	50 %	0 %	222108991
116	NC_011990	CG	3	6	53093	53098	0 %	0 %	50 %	50 %	222108994
117	NC_011990	TC	3	6	53634	53639	0 %	50 %	0 %	50 %	222108995
118	NC_011990	GT	3	6	54992	54997	0 %	50 %	50 %	0 %	222108998
119	NC_011990	TC	3	6	55019	55024	0 %	50 %	0 %	50 %	222108998
120	NC_011990	AC	3	6	55172	55177	50 %	0 %	0 %	50 %	222108998
121	NC_011990	TC	3	6	55392	55397	0 %	50 %	0 %	50 %	222108999
122	NC_011990	AG	3	6	55509	55514	50 %	0 %	50 %	0 %	222108999
123	NC_011990	CG	3	6	55738	55743	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
124	NC_011990	CG	3	6	56219	56224	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
125	NC_011990	CG	4	8	56474	56481	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
126	NC_011990	GC	3	6	58460	58465	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
127	NC_011990	CG	3	6	58541	58546	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
128	NC_011990	CG	3	6	60961	60966	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
129	NC_011990	CG	3	6	61045	61050	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
130	NC_011990	CG	4	8	61456	61463	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
131	NC_011990	GC	3	6	62519	62524	0 %	0 %	50 %	50 %	222109005
132	NC_011990	GC	3	6	62842	62847	0 %	0 %	50 %	50 %	222109005
133	NC_011990	GA	3	6	62918	62923	50 %	0 %	50 %	0 %	222109005
134	NC_011990	CA	3	6	63593	63598	50 %	0 %	0 %	50 %	222109006
135	NC_011990	GA	3	6	64980	64985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011990	CG	3	6	66202	66207	0 %	0 %	50 %	50 %	222109009
137	NC_011990	GC	3	6	67302	67307	0 %	0 %	50 %	50 %	222109010
138	NC_011990	GC	3	6	67504	67509	0 %	0 %	50 %	50 %	222109011
139	NC_011990	TC	3	6	67746	67751	0 %	50 %	0 %	50 %	222109011
140	NC_011990	CG	4	8	68228	68235	0 %	0 %	50 %	50 %	222109011
141	NC_011990	AG	3	6	68380	68385	50 %	0 %	50 %	0 %	222109011
142	NC_011990	CA	3	6	68698	68703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011990	GC	3	6	68903	68908	0 %	0 %	50 %	50 %	222109012
144	NC_011990	GC	3	6	69195	69200	0 %	0 %	50 %	50 %	222109012
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.