MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 53560

< Previous12...96979899100101102103104105106107108Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_011989	CCA	2	6	3720492	3720497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150245
53502	NC_011989	CTT	2	6	3720513	3720518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150245
53503	NC_011989	TCA	2	6	3720983	3720988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150245
53504	NC_011989	GCC	2	6	3720989	3720994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150245
53505	NC_011989	GAT	2	6	3721285	3721290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150245
53506	NC_011989	GAT	2	6	3721302	3721307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150245
53507	NC_011989	CCG	2	6	3721374	3721379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150245
53508	NC_011989	CCG	2	6	3721445	3721450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150245
53509	NC_011989	CGC	2	6	3721631	3721636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150245
53510	NC_011989	CAT	2	6	3721639	3721644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150245
53511	NC_011989	ACC	2	6	3721655	3721660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53512	NC_011989	CAT	2	6	3721942	3721947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150246
53513	NC_011989	TCA	2	6	3721986	3721991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150246
53514	NC_011989	TCA	2	6	3722076	3722081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150246
53515	NC_011989	CTT	2	6	3722101	3722106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150246
53516	NC_011989	CGG	2	6	3722170	3722175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150246
53517	NC_011989	AAC	2	6	3722189	3722194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150246
53518	NC_011989	GTC	2	6	3722235	3722240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150246
53519	NC_011989	TGA	2	6	3722287	3722292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150246
53520	NC_011989	AGG	2	6	3722312	3722317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222150246
53521	NC_011989	TCA	2	6	3722454	3722459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150246
53522	NC_011989	ATC	2	6	3722481	3722486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150246
53523	NC_011989	CGC	2	6	3722565	3722570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150246
53524	NC_011989	CAG	2	6	3722591	3722596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150246
53525	NC_011989	GAG	2	6	3722775	3722780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222150246
53526	NC_011989	GAA	2	6	3723153	3723158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150247
53527	NC_011989	GTT	2	6	3723214	3723219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150247
53528	NC_011989	GAA	2	6	3723242	3723247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150247
53529	NC_011989	TCT	2	6	3723254	3723259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150247
53530	NC_011989	CAG	2	6	3723279	3723284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150247
53531	NC_011989	TCT	2	6	3723286	3723291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150247
53532	NC_011989	AAT	2	6	3723444	3723449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150247
53533	NC_011989	ACC	2	6	3723459	3723464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150247
53534	NC_011989	TTC	2	6	3723465	3723470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150247
53535	NC_011989	AAG	2	6	3723490	3723495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150247
53536	NC_011989	CAC	2	6	3723527	3723532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150247
53537	NC_011989	AGA	2	6	3723549	3723554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150247
53538	NC_011989	CTT	2	6	3723746	3723751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150247
53539	NC_011989	AGA	2	6	3723769	3723774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150247
53540	NC_011989	CGG	2	6	3723852	3723857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150247
53541	NC_011989	CGA	2	6	3723860	3723865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150247
53542	NC_011989	GCG	2	6	3723890	3723895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150247
53543	NC_011989	GCG	2	6	3723977	3723982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150247
53544	NC_011989	CAG	2	6	3724050	3724055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150247
53545	NC_011989	GTC	2	6	3724158	3724163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150247
53546	NC_011989	CAG	2	6	3724347	3724352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150247
53547	NC_011989	GGC	2	6	3724543	3724548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53548	NC_011989	TCA	2	6	3724865	3724870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150248
53549	NC_011989	CAG	2	6	3724938	3724943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150248
53550	NC_011989	GAT	2	6	3724977	3724982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150248
53551	NC_011989	CCA	2	6	3725075	3725080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150248
53552	NC_011989	TGC	2	6	3725159	3725164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150249
53553	NC_011989	ACC	2	6	3725284	3725289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150249
53554	NC_011989	CGG	2	6	3725346	3725351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150249
53555	NC_011989	TGA	2	6	3725448	3725453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150249
53556	NC_011989	GAT	2	6	3725488	3725493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150249
53557	NC_011989	CAC	2	6	3725742	3725747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150249
53558	NC_011989	GCA	2	6	3725960	3725965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150249
53559	NC_011989	CGG	2	6	3725978	3725983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222150249
53560	NC_011989	GGT	2	6	3726113	3726118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150249

< Previous12...96979899100101102103104105106107108Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.