MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011988	GCAAG	2	10	2088	2097	40 %	0 %	40 %	20 %	222106129
2	NC_011988	TTTGC	2	10	4199	4208	0 %	60 %	20 %	20 %	222106130
3	NC_011988	GGATC	2	10	5118	5127	20 %	20 %	40 %	20 %	222106131
4	NC_011988	ACCGC	2	10	7379	7388	20 %	0 %	20 %	60 %	222106132
5	NC_011988	CACTT	2	10	11556	11565	20 %	40 %	0 %	40 %	222106137
6	NC_011988	CGGAC	2	10	12159	12168	20 %	0 %	40 %	40 %	222106138
7	NC_011988	GGCGC	2	10	15790	15799	0 %	0 %	60 %	40 %	222106142
8	NC_011988	AGGCA	2	10	15882	15891	40 %	0 %	40 %	20 %	222106143
9	NC_011988	CCAGC	2	10	16629	16638	20 %	0 %	20 %	60 %	222106143
10	NC_011988	AACGA	2	10	16963	16972	60 %	0 %	20 %	20 %	222106144
11	NC_011988	GCAGC	2	10	18491	18500	20 %	0 %	40 %	40 %	222106145
12	NC_011988	CCTCA	2	10	18617	18626	20 %	20 %	0 %	60 %	222106145
13	NC_011988	CCCTG	2	10	20152	20161	0 %	20 %	20 %	60 %	222106146
14	NC_011988	GCGCT	2	10	21132	21141	0 %	20 %	40 %	40 %	222106148
15	NC_011988	ATGCG	2	10	21441	21450	20 %	20 %	40 %	20 %	222106148
16	NC_011988	ACGCC	2	10	23389	23398	20 %	0 %	20 %	60 %	222106150
17	NC_011988	TCCGG	2	10	24206	24215	0 %	20 %	40 %	40 %	222106151
18	NC_011988	GGCTG	2	10	26035	26044	0 %	20 %	60 %	20 %	222106153
19	NC_011988	AAGCT	2	10	27899	27908	40 %	20 %	20 %	20 %	222106155
20	NC_011988	TGCAA	2	10	28304	28313	40 %	20 %	20 %	20 %	222106155
21	NC_011988	TCACG	2	10	30218	30227	20 %	20 %	20 %	40 %	222106158
22	NC_011988	GTCCG	2	10	32079	32088	0 %	20 %	40 %	40 %	222106160
23	NC_011988	ATCGG	2	10	32455	32464	20 %	20 %	40 %	20 %	222106160
24	NC_011988	CTGGC	2	10	32853	32862	0 %	20 %	40 %	40 %	222106161
25	NC_011988	GCTCG	2	10	33583	33592	0 %	20 %	40 %	40 %	222106161
26	NC_011988	GAAAG	2	10	34043	34052	60 %	0 %	40 %	0 %	222106162
27	NC_011988	GAAAG	2	10	36899	36908	60 %	0 %	40 %	0 %	222106163
28	NC_011988	GTCGC	2	10	49362	49371	0 %	20 %	40 %	40 %	222106173
29	NC_011988	CCGGC	2	10	50276	50285	0 %	0 %	40 %	60 %	222106174
30	NC_011988	GTCCG	2	10	52596	52605	0 %	20 %	40 %	40 %	222106176
31	NC_011988	GAACG	2	10	54316	54325	40 %	0 %	40 %	20 %	222106178
32	NC_011988	GCATG	2	10	57282	57291	20 %	20 %	40 %	20 %	222106180
33	NC_011988	GGGGC	2	10	58968	58977	0 %	0 %	80 %	20 %	222106182
34	NC_011988	ATTTC	2	10	62433	62442	20 %	60 %	0 %	20 %	222106185
35	NC_011988	CCCAA	2	10	64377	64386	40 %	0 %	0 %	60 %	222106186
36	NC_011988	GTCGA	2	10	66948	66957	20 %	20 %	40 %	20 %	222106188
37	NC_011988	GTGCC	2	10	68164	68173	0 %	20 %	40 %	40 %	222106188
38	NC_011988	CGGTT	2	10	70283	70292	0 %	40 %	40 %	20 %	222106190
39	NC_011988	CTCGG	2	10	75534	75543	0 %	20 %	40 %	40 %	222106195
40	NC_011988	GGATT	2	10	80308	80317	20 %	40 %	40 %	0 %	222106199
41	NC_011988	TGCGG	2	10	80637	80646	0 %	20 %	60 %	20 %	222106199
42	NC_011988	TGGCT	2	10	81811	81820	0 %	40 %	40 %	20 %	222106200
43	NC_011988	GCGCT	2	10	83938	83947	0 %	20 %	40 %	40 %	222106202
44	NC_011988	ACCCA	2	10	86768	86777	40 %	0 %	0 %	60 %	222106205
45	NC_011988	GGTTG	2	10	87634	87643	0 %	40 %	60 %	0 %	222106206
46	NC_011988	TGCTC	2	10	87907	87916	0 %	40 %	20 %	40 %	222106206
47	NC_011988	TTGCG	2	10	89484	89493	0 %	40 %	40 %	20 %	222106207
48	NC_011988	ATCAC	2	10	90721	90730	40 %	20 %	0 %	40 %	222106208
49	NC_011988	CCAAT	2	10	93975	93984	40 %	20 %	0 %	40 %	222106212
50	NC_011988	TGCTT	2	10	97012	97021	0 %	60 %	20 %	20 %	222106213
51	NC_011988	GCGCG	2	10	98499	98508	0 %	0 %	60 %	40 %	222106214
52	NC_011988	TTGCC	2	10	98825	98834	0 %	40 %	20 %	40 %	222106214
53	NC_011988	GCGAC	2	10	100525	100534	20 %	0 %	40 %	40 %	222106216
54	NC_011988	CGATC	2	10	102508	102517	20 %	20 %	20 %	40 %	222106218
55	NC_011988	TATCG	2	10	102584	102593	20 %	40 %	20 %	20 %	222106218
56	NC_011988	GTGTT	2	10	105158	105167	0 %	60 %	40 %	0 %	222106220
57	NC_011988	ATGTC	2	10	108567	108576	20 %	40 %	20 %	20 %	222106223
58	NC_011988	AAGGC	2	10	109112	109121	40 %	0 %	40 %	20 %	222106223
59	NC_011988	GCTGC	2	10	109137	109146	0 %	20 %	40 %	40 %	222106223
60	NC_011988	GGGCC	2	10	109467	109476	0 %	0 %	60 %	40 %	222106223
61	NC_011988	ACATC	2	10	109656	109665	40 %	20 %	0 %	40 %	222106223
62	NC_011988	ACCGA	2	10	110728	110737	40 %	0 %	20 %	40 %	222106224
63	NC_011988	TCTGC	2	10	111285	111294	0 %	40 %	20 %	40 %	222106224
64	NC_011988	CCGGT	2	10	113713	113722	0 %	20 %	40 %	40 %	222106227
65	NC_011988	CTCAC	2	10	115233	115242	20 %	20 %	0 %	60 %	222106229
66	NC_011988	TGGCC	2	10	118689	118698	0 %	20 %	40 %	40 %	222106232
67	NC_011988	GCCTT	2	10	118912	118921	0 %	40 %	20 %	40 %	222106232
68	NC_011988	CCAGG	2	10	119322	119331	20 %	0 %	40 %	40 %	222106232
69	NC_011988	GACGA	2	10	122875	122884	40 %	0 %	40 %	20 %	222106236
70	NC_011988	CGGTT	2	10	123024	123033	0 %	40 %	40 %	20 %	222106236
71	NC_011988	GCCCA	2	10	126386	126395	20 %	0 %	20 %	60 %	222106239
72	NC_011988	CTGAT	2	10	126570	126579	20 %	40 %	20 %	20 %	222106239
73	NC_011988	CAGGG	2	10	127209	127218	20 %	0 %	60 %	20 %	222106239
74	NC_011988	GATCG	2	10	129990	129999	20 %	20 %	40 %	20 %	222106242
75	NC_011988	TGCCT	2	10	130690	130699	0 %	40 %	20 %	40 %	222106243
76	NC_011988	TTGCC	2	10	131913	131922	0 %	40 %	20 %	40 %	222106243
77	NC_011988	GGTTT	2	10	137904	137913	0 %	60 %	40 %	0 %	222106247
78	NC_011988	GATTG	2	10	140989	140998	20 %	40 %	40 %	0 %	222106249
79	NC_011988	GCCAG	2	10	142481	142490	20 %	0 %	40 %	40 %	222106251
80	NC_011988	GATTT	2	10	142730	142739	20 %	60 %	20 %	0 %	222106251
81	NC_011988	GCGAT	2	10	143715	143724	20 %	20 %	40 %	20 %	222106251
82	NC_011988	TCCGG	2	10	147256	147265	0 %	20 %	40 %	40 %	222106253
83	NC_011988	GCCGG	2	10	151988	151997	0 %	0 %	60 %	40 %	222106257
84	NC_011988	TGGTC	2	10	153439	153448	0 %	40 %	40 %	20 %	222106258
85	NC_011988	ACCGC	2	10	155047	155056	20 %	0 %	20 %	60 %	222106259
86	NC_011988	TGCGA	2	10	156022	156031	20 %	20 %	40 %	20 %	222106260
87	NC_011988	GCAAT	2	10	166280	166289	40 %	20 %	20 %	20 %	222106268
88	NC_011988	GCGCT	2	10	166968	166977	0 %	20 %	40 %	40 %	222106269
89	NC_011988	CGCAA	2	10	168604	168613	40 %	0 %	20 %	40 %	222106271
90	NC_011988	GGGCA	2	10	168777	168786	20 %	0 %	60 %	20 %	222106271
91	NC_011988	ATCCC	2	10	169851	169860	20 %	20 %	0 %	60 %	222106272
92	NC_011988	GCACG	2	10	170261	170270	20 %	0 %	40 %	40 %	222106272
93	NC_011988	GCGAG	2	10	170880	170889	20 %	0 %	60 %	20 %	222106273
94	NC_011988	GATGG	2	10	172108	172117	20 %	20 %	60 %	0 %	222106274
95	NC_011988	ATGCG	2	10	173437	173446	20 %	20 %	40 %	20 %	222106275
96	NC_011988	GCCAG	2	10	173453	173462	20 %	0 %	40 %	40 %	222106275
97	NC_011988	TGGTC	2	10	174344	174353	0 %	40 %	40 %	20 %	222106276
98	NC_011988	AAGCC	2	10	175361	175370	40 %	0 %	20 %	40 %	222106276
99	NC_011988	GACAC	2	10	184149	184158	40 %	0 %	20 %	40 %	222106281
100	NC_011988	CTGTC	2	10	184974	184983	0 %	40 %	20 %	40 %	222106282
101	NC_011988	TGGCG	2	10	185788	185797	0 %	20 %	60 %	20 %	222106283
102	NC_011988	CGGAG	2	10	185862	185871	20 %	0 %	60 %	20 %	222106283
103	NC_011988	AGATC	2	10	188077	188086	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
104	NC_011988	AACGG	2	10	188466	188475	40 %	0 %	40 %	20 %	222106285
105	NC_011988	GATCA	2	10	188534	188543	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
106	NC_011988	CAGAT	2	10	188850	188859	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
107	NC_011988	TGCCA	2	10	189837	189846	20 %	20 %	20 %	40 %	222106285
108	NC_011988	CTTGG	2	10	193824	193833	0 %	40 %	40 %	20 %	222106288
109	NC_011988	TGGGT	2	10	194439	194448	0 %	40 %	60 %	0 %	222106289
110	NC_011988	GCCTC	2	10	195254	195263	0 %	20 %	20 %	60 %	222106289
111	NC_011988	CTTGC	2	10	196039	196048	0 %	40 %	20 %	40 %	222106290
112	NC_011988	GCCGG	2	10	196251	196260	0 %	0 %	60 %	40 %	222106290
113	NC_011988	CATTC	2	10	197160	197169	20 %	40 %	0 %	40 %	222106291
114	NC_011988	GCCTG	2	10	202983	202992	0 %	20 %	40 %	40 %	222106294
115	NC_011988	CGGGC	2	10	203720	203729	0 %	0 %	60 %	40 %	222106295
116	NC_011988	GCCTG	2	10	203982	203991	0 %	20 %	40 %	40 %	222106295
117	NC_011988	TCGGT	2	10	205964	205973	0 %	40 %	40 %	20 %	222106297
118	NC_011988	GTATC	2	10	208003	208012	20 %	40 %	20 %	20 %	222106299
119	NC_011988	GGTAA	2	10	208299	208308	40 %	20 %	40 %	0 %	222106299
120	NC_011988	GCGGA	2	10	214752	214761	20 %	0 %	60 %	20 %	222106303
121	NC_011988	TCACG	2	10	215099	215108	20 %	20 %	20 %	40 %	222106303
122	NC_011988	TTCGG	2	10	216786	216795	0 %	40 %	40 %	20 %	222106305
123	NC_011988	ACTGA	2	10	220506	220515	40 %	20 %	20 %	20 %	222106308
124	NC_011988	GATCA	2	10	222362	222371	40 %	20 %	20 %	20 %	222106309
125	NC_011988	CGGCC	2	10	224366	224375	0 %	0 %	40 %	60 %	222106311
126	NC_011988	GCCTC	2	10	224729	224738	0 %	20 %	20 %	60 %	222106311
127	NC_011988	TGCAA	2	10	226061	226070	40 %	20 %	20 %	20 %	222106312
128	NC_011988	GGCAG	2	10	226260	226269	20 %	0 %	60 %	20 %	222106312
129	NC_011988	TTGGA	2	10	228628	228637	20 %	40 %	40 %	0 %	222106314
130	NC_011988	CGGCG	2	10	235387	235396	0 %	0 %	60 %	40 %	222106320
131	NC_011988	CCGTG	2	10	237214	237223	0 %	20 %	40 %	40 %	222106322
132	NC_011988	CGGCG	2	10	238131	238140	0 %	0 %	60 %	40 %	222106322
133	NC_011988	GAAAG	2	10	238193	238202	60 %	0 %	40 %	0 %	222106323
134	NC_011988	TGCTT	2	10	240681	240690	0 %	60 %	20 %	20 %	222106325
135	NC_011988	ATCCG	2	10	240972	240981	20 %	20 %	20 %	40 %	222106326
136	NC_011988	TGGTC	2	10	244416	244425	0 %	40 %	40 %	20 %	222106328
137	NC_011988	CCGGC	2	10	245002	245011	0 %	0 %	40 %	60 %	222106329
138	NC_011988	TTGTC	2	10	245879	245888	0 %	60 %	20 %	20 %	222106329
139	NC_011988	CCGGC	2	10	247463	247472	0 %	0 %	40 %	60 %	222106331
140	NC_011988	CGCTT	2	10	249709	249718	0 %	40 %	20 %	40 %	222106333
141	NC_011988	GCTTG	2	10	250220	250229	0 %	40 %	40 %	20 %	222106333
142	NC_011988	ATCTT	2	10	251848	251857	20 %	60 %	0 %	20 %	222106335
143	NC_011988	GCCTT	2	10	252059	252068	0 %	40 %	20 %	40 %	222106335
144	NC_011988	CGAAA	2	10	252466	252475	60 %	0 %	20 %	20 %	222106335
145	NC_011988	CCATG	2	10	252933	252942	20 %	20 %	20 %	40 %	222106336
146	NC_011988	CGGTG	2	10	253630	253639	0 %	20 %	60 %	20 %	222106337
147	NC_011988	GGCCA	2	10	255948	255957	20 %	0 %	40 %	40 %	222106339
148	NC_011988	CGTTT	2	10	256502	256511	0 %	60 %	20 %	20 %	222106339
149	NC_011988	CGTTT	2	10	257312	257321	0 %	60 %	20 %	20 %	222106339
150	NC_011988	GCTAT	2	10	258802	258811	20 %	40 %	20 %	20 %	222106339
151	NC_011988	GATGC	2	10	259902	259911	20 %	20 %	40 %	20 %	222106339
152	NC_011988	TGCCG	2	10	263123	263132	0 %	20 %	40 %	40 %	222106341
153	NC_011988	GCGAG	2	10	265910	265919	20 %	0 %	60 %	20 %	222106345
154	NC_011988	GCCGT	2	10	266248	266257	0 %	20 %	40 %	40 %	222106345
155	NC_011988	CAGCG	2	10	267407	267416	20 %	0 %	40 %	40 %	222106347
156	NC_011988	CCAGG	2	10	269812	269821	20 %	0 %	40 %	40 %	222106347
157	NC_011988	GACCC	2	10	273786	273795	20 %	0 %	20 %	60 %	222106350
158	NC_011988	CACGG	2	10	274151	274160	20 %	0 %	40 %	40 %	222106350
159	NC_011988	GCCGG	2	10	274394	274403	0 %	0 %	60 %	40 %	222106350
160	NC_011988	CGTTC	2	10	275994	276003	0 %	40 %	20 %	40 %	222106352
161	NC_011988	CCGGG	2	10	276355	276364	0 %	0 %	60 %	40 %	222106352
162	NC_011988	CGGCG	2	10	276544	276553	0 %	0 %	60 %	40 %	222106352
163	NC_011988	GGTAA	2	10	277766	277775	40 %	20 %	40 %	0 %	222106353
164	NC_011988	CGCAC	2	10	277781	277790	20 %	0 %	20 %	60 %	222106353
165	NC_011988	AGCCG	2	10	278946	278955	20 %	0 %	40 %	40 %	222106354
166	NC_011988	CCCAT	2	10	282622	282631	20 %	20 %	0 %	60 %	222106357
167	NC_011988	GCCGA	2	10	284830	284839	20 %	0 %	40 %	40 %	222106360
168	NC_011988	AGCGC	2	10	287571	287580	20 %	0 %	40 %	40 %	222106362
169	NC_011988	TGAAA	2	10	288203	288212	60 %	20 %	20 %	0 %	222106363
170	NC_011988	GCGCG	2	10	289525	289534	0 %	0 %	60 %	40 %	222106363
171	NC_011988	TCGCC	2	10	290137	290146	0 %	20 %	20 %	60 %	222106363
172	NC_011988	TGGAC	2	10	291093	291102	20 %	20 %	40 %	20 %	222106364
173	NC_011988	AAGCC	2	10	291281	291290	40 %	0 %	20 %	40 %	222106364
174	NC_011988	GACAA	2	10	296360	296369	60 %	0 %	20 %	20 %	222106368
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176	NC_011988	GGGTT	2	10	300098	300107	0 %	40 %	60 %	0 %	222106372
177	NC_011988	TGACC	2	10	301933	301942	20 %	20 %	20 %	40 %	222106373
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183	NC_011988	CGGTC	2	10	314525	314534	0 %	20 %	40 %	40 %	222106385
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192	NC_011988	GCGAT	2	10	323660	323669	20 %	20 %	40 %	20 %	222106393
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198	NC_011988	TCCGA	2	10	327240	327249	20 %	20 %	20 %	40 %	222106395
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208	NC_011988	TGTCG	2	10	337100	337109	0 %	40 %	40 %	20 %	222106402
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210	NC_011988	GACAT	2	10	338475	338484	40 %	20 %	20 %	20 %	222106402
211	NC_011988	CGCGC	2	10	339042	339051	0 %	0 %	40 %	60 %	222106403
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237	NC_011988	ATGGC	2	10	374150	374159	20 %	20 %	40 %	20 %	222106434
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244	NC_011988	TGGGC	2	10	384457	384466	0 %	20 %	60 %	20 %	222106442
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246	NC_011988	TGGCT	2	10	386013	386022	0 %	40 %	40 %	20 %	222106443
247	NC_011988	ACGCG	2	10	392032	392041	20 %	0 %	40 %	40 %	222106448
248	NC_011988	AGACC	2	10	392985	392994	40 %	0 %	20 %	40 %	222106449
249	NC_011988	GCCGA	2	10	393975	393984	20 %	0 %	40 %	40 %	222106450
250	NC_011988	GCCCA	2	10	394041	394050	20 %	0 %	20 %	60 %	222106450
251	NC_011988	CCAGA	2	10	394064	394073	40 %	0 %	20 %	40 %	222106450
252	NC_011988	AGGCC	2	10	395831	395840	20 %	0 %	40 %	40 %	222106452
253	NC_011988	GCAGG	2	10	396160	396169	20 %	0 %	60 %	20 %	222106452
254	NC_011988	GTTGC	2	10	398287	398296	0 %	40 %	40 %	20 %	222106454
255	NC_011988	ACTGG	2	10	403717	403726	20 %	20 %	40 %	20 %	222106459
256	NC_011988	CCGTC	2	10	405534	405543	0 %	20 %	20 %	60 %	222106461
257	NC_011988	CGAGG	2	10	407668	407677	20 %	0 %	60 %	20 %	222106463
258	NC_011988	CGGTT	2	10	410016	410025	0 %	40 %	40 %	20 %	222106465
259	NC_011988	GGGCA	2	10	411895	411904	20 %	0 %	60 %	20 %	222106465
260	NC_011988	GCGCG	2	10	413935	413944	0 %	0 %	60 %	40 %	222106466
261	NC_011988	CCGAG	2	10	417237	417246	20 %	0 %	40 %	40 %	222106469
262	NC_011988	ACCGC	2	10	417326	417335	20 %	0 %	20 %	60 %	222106469
263	NC_011988	GTCAC	2	10	417467	417476	20 %	20 %	20 %	40 %	222106469
264	NC_011988	GCGCC	2	10	417968	417977	0 %	0 %	40 %	60 %	222106470
265	NC_011988	CGCGC	2	10	419915	419924	0 %	0 %	40 %	60 %	222106472
266	NC_011988	GCCGC	2	10	420159	420168	0 %	0 %	40 %	60 %	222106472
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270	NC_011988	GCCGC	2	10	424158	424167	0 %	0 %	40 %	60 %	222106475
271	NC_011988	CGGCA	2	10	425901	425910	20 %	0 %	40 %	40 %	222106476
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277	NC_011988	CGCTT	2	10	434187	434196	0 %	40 %	20 %	40 %	222106482
278	NC_011988	GGGCT	2	10	435226	435235	0 %	20 %	60 %	20 %	222106482
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380	NC_011988	CGGCG	2	10	592357	592366	0 %	0 %	60 %	40 %	222106602
381	NC_011988	CGGCC	2	10	592571	592580	0 %	0 %	40 %	60 %	222106603
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383	NC_011988	GGCAG	2	10	597466	597475	20 %	0 %	60 %	20 %	222106607
384	NC_011988	AGCCT	2	10	597739	597748	20 %	20 %	20 %	40 %	222106608
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386	NC_011988	GGATC	2	10	601995	602004	20 %	20 %	40 %	20 %	222106611
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389	NC_011988	CCCGG	2	10	606975	606984	0 %	0 %	40 %	60 %	222106615
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