MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	ACCGA	2	10	671210	671219	40 %	0 %	20 %	40 %	222106659
502	NC_011988	TCGGG	2	10	671368	671377	0 %	20 %	60 %	20 %	222106659
503	NC_011988	GCGCG	2	10	671907	671916	0 %	0 %	60 %	40 %	222106660
504	NC_011988	CCAGG	2	10	673351	673360	20 %	0 %	40 %	40 %	222106661
505	NC_011988	GGGCA	2	10	673379	673388	20 %	0 %	60 %	20 %	222106661
506	NC_011988	CGGCA	2	10	673685	673694	20 %	0 %	40 %	40 %	222106661
507	NC_011988	TTGCG	2	10	674500	674509	0 %	40 %	40 %	20 %	222106661
508	NC_011988	GGCGA	2	10	677223	677232	20 %	0 %	60 %	20 %	222106664
509	NC_011988	CAGCC	2	10	679437	679446	20 %	0 %	20 %	60 %	222106667
510	NC_011988	CGGCG	2	10	682234	682243	0 %	0 %	60 %	40 %	222106669
511	NC_011988	GGTCG	2	10	684592	684601	0 %	20 %	60 %	20 %	222106672
512	NC_011988	CCGGT	2	10	686435	686444	0 %	20 %	40 %	40 %	222106673
513	NC_011988	CATCG	2	10	686667	686676	20 %	20 %	20 %	40 %	222106673
514	NC_011988	GGCAT	2	10	687450	687459	20 %	20 %	40 %	20 %	222106674
515	NC_011988	TCAGC	2	10	687730	687739	20 %	20 %	20 %	40 %	222106674
516	NC_011988	GCCCA	2	10	688802	688811	20 %	0 %	20 %	60 %	222106675
517	NC_011988	GTGAA	2	10	689944	689953	40 %	20 %	40 %	0 %	222106676
518	NC_011988	CCGAG	2	10	691966	691975	20 %	0 %	40 %	40 %	222106677
519	NC_011988	GGATG	2	10	695209	695218	20 %	20 %	60 %	0 %	222106680
520	NC_011988	TTTTC	2	10	695841	695850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_011988	GGTGG	2	10	696118	696127	0 %	20 %	80 %	0 %	222106682
522	NC_011988	GGGCA	2	10	697324	697333	20 %	0 %	60 %	20 %	222106682
523	NC_011988	GCCTT	2	10	698363	698372	0 %	40 %	20 %	40 %	222106684
524	NC_011988	GGAAG	2	10	698842	698851	40 %	0 %	60 %	0 %	222106684
525	NC_011988	CAAGC	2	10	698977	698986	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
526	NC_011988	AGCCG	2	10	699499	699508	20 %	0 %	40 %	40 %	222106685
527	NC_011988	CCTTT	2	10	699913	699922	0 %	60 %	0 %	40 %	222106686
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529	NC_011988	ATTGA	2	10	700517	700526	40 %	40 %	20 %	0 %	222106686
530	NC_011988	TGGCT	2	10	704132	704141	0 %	40 %	40 %	20 %	222106687
531	NC_011988	CCGGC	2	10	705222	705231	0 %	0 %	40 %	60 %	222106688
532	NC_011988	CGATG	2	10	708065	708074	20 %	20 %	40 %	20 %	222106691
533	NC_011988	GCAGA	2	10	708363	708372	40 %	0 %	40 %	20 %	222106691
534	NC_011988	GTTTC	2	10	713508	713517	0 %	60 %	20 %	20 %	222106696
535	NC_011988	CTTTC	2	10	714598	714607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
536	NC_011988	CCGGT	2	10	714787	714796	0 %	20 %	40 %	40 %	222106697
537	NC_011988	TGTTC	2	10	714842	714851	0 %	60 %	20 %	20 %	222106697
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539	NC_011988	TCGGC	2	10	721094	721103	0 %	20 %	40 %	40 %	222106703
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541	NC_011988	TCGCT	2	10	726649	726658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_011988	GAGTT	2	10	730657	730666	20 %	40 %	40 %	0 %	222106710
543	NC_011988	TTTCG	2	10	731462	731471	0 %	60 %	20 %	20 %	222106711
544	NC_011988	TCACG	2	10	733681	733690	20 %	20 %	20 %	40 %	222106712
545	NC_011988	CAGAT	2	10	739033	739042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
546	NC_011988	CGGTT	2	10	739200	739209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
547	NC_011988	TGCCG	2	10	740269	740278	0 %	20 %	40 %	40 %	222106719
548	NC_011988	TTGCG	2	10	740436	740445	0 %	40 %	40 %	20 %	222106719
549	NC_011988	GCGCC	2	10	742032	742041	0 %	0 %	40 %	60 %	222106720
550	NC_011988	AACGC	2	10	746497	746506	40 %	0 %	20 %	40 %	222106725
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552	NC_011988	CGGCA	2	10	751196	751205	20 %	0 %	40 %	40 %	222106728
553	NC_011988	AATTT	2	10	752792	752801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011988	GGCGC	2	10	754022	754031	0 %	0 %	60 %	40 %	222106730
555	NC_011988	GCGCG	2	10	754149	754158	0 %	0 %	60 %	40 %	222106730
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559	NC_011988	CTGGG	2	10	757351	757360	0 %	20 %	60 %	20 %	222106731
560	NC_011988	CGACG	2	10	757704	757713	20 %	0 %	40 %	40 %	222106731
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565	NC_011988	GCTGA	2	10	766921	766930	20 %	20 %	40 %	20 %	222106739
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592	NC_011988	TCGGC	2	10	806318	806327	0 %	20 %	40 %	40 %	222106771
593	NC_011988	GGCCA	2	10	806457	806466	20 %	0 %	40 %	40 %	222106771
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607	NC_011988	CGGAC	2	10	823472	823481	20 %	0 %	40 %	40 %	222106786
608	NC_011988	CTGAA	2	10	823908	823917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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611	NC_011988	CGGCG	2	10	827535	827544	0 %	0 %	60 %	40 %	222106789
612	NC_011988	ACCAG	2	10	830493	830502	40 %	0 %	20 %	40 %	222106793
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629	NC_011988	CGCGC	2	10	864104	864113	0 %	0 %	40 %	60 %	222106821
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880	NC_011988	GCTTG	2	10	1217476	1217485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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886	NC_011988	GCCCA	2	10	1227092	1227101	20 %	0 %	20 %	60 %	222107132
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890	NC_011988	TGCCA	2	10	1233535	1233544	20 %	20 %	20 %	40 %	222107138
891	NC_011988	ACCAG	2	10	1236342	1236351	40 %	0 %	20 %	40 %	222107141
892	NC_011988	CCAGC	2	10	1238701	1238710	20 %	0 %	20 %	60 %	222107142
893	NC_011988	ATGGC	2	10	1241250	1241259	20 %	20 %	40 %	20 %	222107146
894	NC_011988	CAAGA	2	10	1242406	1242415	60 %	0 %	20 %	20 %	222107147
895	NC_011988	CTGTG	2	10	1244284	1244293	0 %	40 %	40 %	20 %	222107148
896	NC_011988	GGCAT	2	10	1244793	1244802	20 %	20 %	40 %	20 %	222107148
897	NC_011988	GCGGT	2	10	1244813	1244822	0 %	20 %	60 %	20 %	222107148
898	NC_011988	CGAAC	2	10	1245448	1245457	40 %	0 %	20 %	40 %	222107149
899	NC_011988	TCTGG	2	10	1245721	1245730	0 %	40 %	40 %	20 %	222107149
900	NC_011988	TTCTG	2	10	1245966	1245975	0 %	60 %	20 %	20 %	222107149
901	NC_011988	AGAGA	2	10	1246373	1246382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
902	NC_011988	ATCGC	2	10	1246962	1246971	20 %	20 %	20 %	40 %	222107150
903	NC_011988	CAGGG	2	10	1247062	1247071	20 %	0 %	60 %	20 %	222107150
904	NC_011988	GGCGC	2	10	1247171	1247180	0 %	0 %	60 %	40 %	222107151
905	NC_011988	CCAGG	2	10	1250425	1250434	20 %	0 %	40 %	40 %	222107153
906	NC_011988	TCTGC	2	10	1251143	1251152	0 %	40 %	20 %	40 %	222107154
907	NC_011988	GCTTG	2	10	1252377	1252386	0 %	40 %	40 %	20 %	222107154
908	NC_011988	TCCGA	2	10	1252500	1252509	20 %	20 %	20 %	40 %	222107155
909	NC_011988	CGATC	2	10	1252786	1252795	20 %	20 %	20 %	40 %	222107155
910	NC_011988	GGCGC	2	10	1253650	1253659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
911	NC_011988	CCACC	2	10	1256533	1256542	20 %	0 %	0 %	80 %	222107159
912	NC_011988	CGGCG	2	10	1261073	1261082	0 %	0 %	60 %	40 %	222107162
913	NC_011988	GGGGC	2	10	1261179	1261188	0 %	0 %	80 %	20 %	222107162
914	NC_011988	AGGGC	2	10	1261252	1261261	20 %	0 %	60 %	20 %	222107162
915	NC_011988	GCCTG	2	10	1263136	1263145	0 %	20 %	40 %	40 %	222107164
916	NC_011988	TGCTG	2	10	1263394	1263403	0 %	40 %	40 %	20 %	222107164
917	NC_011988	GGCGC	2	10	1265409	1265418	0 %	0 %	60 %	40 %	222107166
918	NC_011988	GGCCG	2	10	1265703	1265712	0 %	0 %	60 %	40 %	222107167
919	NC_011988	CAAGC	2	10	1266023	1266032	40 %	0 %	20 %	40 %	222107167
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921	NC_011988	GCGGT	2	10	1267688	1267697	0 %	20 %	60 %	20 %	222107168
922	NC_011988	TGGAT	2	10	1271692	1271701	20 %	40 %	40 %	0 %	222107172
923	NC_011988	CCGCC	2	10	1272865	1272874	0 %	0 %	20 %	80 %	222107173
924	NC_011988	GGGCG	2	10	1273249	1273258	0 %	0 %	80 %	20 %	222107173
925	NC_011988	TTTGG	2	10	1276627	1276636	0 %	60 %	40 %	0 %	222107176
926	NC_011988	TCCAG	2	10	1279680	1279689	20 %	20 %	20 %	40 %	222107178
927	NC_011988	AGTGG	2	10	1280716	1280725	20 %	20 %	60 %	0 %	222107179
928	NC_011988	GGGCA	2	10	1281908	1281917	20 %	0 %	60 %	20 %	222107180
929	NC_011988	TGCCG	2	10	1282219	1282228	0 %	20 %	40 %	40 %	222107180
930	NC_011988	CGGTC	2	10	1282358	1282367	0 %	20 %	40 %	40 %	222107180
931	NC_011988	CCAAT	2	10	1282384	1282393	40 %	20 %	0 %	40 %	222107180
932	NC_011988	GCGAT	2	10	1282511	1282520	20 %	20 %	40 %	20 %	222107181

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