MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011988	GGCG	2	8	1203847	1203854	0 %	0 %	75 %	25 %	222107110
2502	NC_011988	ACCA	2	8	1204035	1204042	50 %	0 %	0 %	50 %	222107110
2503	NC_011988	TGGT	2	8	1204234	1204241	0 %	50 %	50 %	0 %	222107110
2504	NC_011988	GGAA	2	8	1204527	1204534	50 %	0 %	50 %	0 %	222107110
2505	NC_011988	GATG	2	8	1204817	1204824	25 %	25 %	50 %	0 %	222107110
2506	NC_011988	GCTG	2	8	1205873	1205880	0 %	25 %	50 %	25 %	222107111
2507	NC_011988	GATC	2	8	1205980	1205987	25 %	25 %	25 %	25 %	222107111
2508	NC_011988	TGTT	2	8	1206182	1206189	0 %	75 %	25 %	0 %	222107111
2509	NC_011988	GTTT	2	8	1206203	1206210	0 %	75 %	25 %	0 %	222107111
2510	NC_011988	CGCC	2	8	1206264	1206271	0 %	0 %	25 %	75 %	222107111
2511	NC_011988	AGGC	2	8	1207264	1207271	25 %	0 %	50 %	25 %	222107112
2512	NC_011988	GGAC	2	8	1207757	1207764	25 %	0 %	50 %	25 %	222107113
2513	NC_011988	ATGC	2	8	1208058	1208065	25 %	25 %	25 %	25 %	222107114
2514	NC_011988	GATT	2	8	1208464	1208471	25 %	50 %	25 %	0 %	222107115
2515	NC_011988	GAAA	2	8	1208641	1208648	75 %	0 %	25 %	0 %	222107115
2516	NC_011988	GCCA	2	8	1210175	1210182	25 %	0 %	25 %	50 %	222107117
2517	NC_011988	TGGC	2	8	1210287	1210294	0 %	25 %	50 %	25 %	222107117
2518	NC_011988	TGCG	2	8	1210340	1210347	0 %	25 %	50 %	25 %	222107117
2519	NC_011988	GTAG	2	8	1210374	1210381	25 %	25 %	50 %	0 %	222107118
2520	NC_011988	CCAG	2	8	1210503	1210510	25 %	0 %	25 %	50 %	222107118
2521	NC_011988	GAAC	2	8	1210611	1210618	50 %	0 %	25 %	25 %	222107118
2522	NC_011988	CCAG	2	8	1210668	1210675	25 %	0 %	25 %	50 %	222107118
2523	NC_011988	CCTT	2	8	1210984	1210991	0 %	50 %	0 %	50 %	222107119
2524	NC_011988	GAAG	2	8	1211417	1211424	50 %	0 %	50 %	0 %	222107119
2525	NC_011988	CAGG	2	8	1211441	1211448	25 %	0 %	50 %	25 %	222107119
2526	NC_011988	CCAG	2	8	1211569	1211576	25 %	0 %	25 %	50 %	222107119
2527	NC_011988	AGCC	2	8	1212441	1212448	25 %	0 %	25 %	50 %	222107119
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2529	NC_011988	CATT	2	8	1212810	1212817	25 %	50 %	0 %	25 %	222107119
2530	NC_011988	CCTT	2	8	1213585	1213592	0 %	50 %	0 %	50 %	222107120
2531	NC_011988	GCGG	2	8	1213856	1213863	0 %	0 %	75 %	25 %	222107120
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2533	NC_011988	ATGC	2	8	1215420	1215427	25 %	25 %	25 %	25 %	222107122
2534	NC_011988	CGCT	2	8	1215859	1215866	0 %	25 %	25 %	50 %	222107122
2535	NC_011988	TCCT	2	8	1216529	1216536	0 %	50 %	0 %	50 %	222107123
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2537	NC_011988	GGCG	2	8	1216999	1217006	0 %	0 %	75 %	25 %	222107124
2538	NC_011988	TGGA	2	8	1217854	1217861	25 %	25 %	50 %	0 %	222107125
2539	NC_011988	GGCA	2	8	1217870	1217877	25 %	0 %	50 %	25 %	222107125
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2543	NC_011988	TTGG	2	8	1221769	1221776	0 %	50 %	50 %	0 %	222107128
2544	NC_011988	AGCA	2	8	1221815	1221822	50 %	0 %	25 %	25 %	222107128
2545	NC_011988	GCGG	2	8	1221855	1221862	0 %	0 %	75 %	25 %	222107128
2546	NC_011988	GCGG	2	8	1222272	1222279	0 %	0 %	75 %	25 %	222107128
2547	NC_011988	CCGA	2	8	1222570	1222577	25 %	0 %	25 %	50 %	222107128
2548	NC_011988	GAAC	2	8	1222741	1222748	50 %	0 %	25 %	25 %	222107128
2549	NC_011988	GGCT	2	8	1222856	1222863	0 %	25 %	50 %	25 %	222107128
2550	NC_011988	CCAT	2	8	1223495	1223502	25 %	25 %	0 %	50 %	222107128
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2554	NC_011988	CCTG	2	8	1224707	1224714	0 %	25 %	25 %	50 %	222107129
2555	NC_011988	CGGT	2	8	1225003	1225010	0 %	25 %	50 %	25 %	222107130
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2557	NC_011988	CGCC	2	8	1227978	1227985	0 %	0 %	25 %	75 %	222107133
2558	NC_011988	GGCT	2	8	1228659	1228666	0 %	25 %	50 %	25 %	222107134
2559	NC_011988	CAAT	2	8	1228724	1228731	50 %	25 %	0 %	25 %	222107134
2560	NC_011988	TGGG	2	8	1229107	1229114	0 %	25 %	75 %	0 %	222107134
2561	NC_011988	GCGT	2	8	1229139	1229146	0 %	25 %	50 %	25 %	222107134
2562	NC_011988	CGAG	2	8	1229435	1229442	25 %	0 %	50 %	25 %	222107134
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2569	NC_011988	CCTG	2	8	1231999	1232006	0 %	25 %	25 %	50 %	222107136
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.