MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 5541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011987	ACA	2	6	384506	384511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102325
5502	NC_011987	AAC	2	6	384517	384522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102325
5503	NC_011987	GCA	2	6	384576	384581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102325
5504	NC_011987	TCA	2	6	384629	384634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102325
5505	NC_011987	ATC	2	6	384722	384727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102325
5506	NC_011987	CAT	2	6	384794	384799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102325
5507	NC_011987	GAG	2	6	384979	384984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102326
5508	NC_011987	ACT	2	6	385040	385045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102326
5509	NC_011987	TCA	2	6	385188	385193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102326
5510	NC_011987	CCA	2	6	385269	385274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102326
5511	NC_011987	CCA	2	6	385351	385356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102326
5512	NC_011987	GTG	2	6	385422	385427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102326
5513	NC_011987	CCT	2	6	385441	385446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102326
5514	NC_011987	AGC	2	6	385539	385544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102326
5515	NC_011987	GCG	2	6	385581	385586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102326
5516	NC_011987	TCG	2	6	385745	385750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_011987	ACA	2	6	385848	385853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011987	TAA	2	6	385968	385973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011987	GCC	2	6	385998	386003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_011987	AGC	2	6	386011	386016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_011987	AGC	2	6	386087	386092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5522	NC_011987	CGA	2	6	386307	386312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5523	NC_011987	CAA	2	6	386322	386327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102327
5524	NC_011987	ATG	2	6	386489	386494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102327
5525	NC_011987	TCG	2	6	386614	386619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5526	NC_011987	ATC	2	6	386623	386628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102327
5527	NC_011987	CCG	2	6	386662	386667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102327
5528	NC_011987	GAA	2	6	386755	386760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102327
5529	NC_011987	GGT	2	6	386847	386852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102327
5530	NC_011987	CGA	2	6	386888	386893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5531	NC_011987	CGT	2	6	386901	386906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5532	NC_011987	GTC	2	6	386940	386945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102327
5533	NC_011987	GAC	2	6	387392	387397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_011987	CAC	2	6	387432	387437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_011987	CGA	2	6	387524	387529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102328
5536	NC_011987	AGG	2	6	387800	387805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102328
5537	NC_011987	CGC	2	6	387884	387889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102328
5538	NC_011987	TCA	2	6	388064	388069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_011987	GTC	2	6	388121	388126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011987	GCA	3	9	388151	388159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011987	ACC	2	6	388161	388166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.