MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	A	6	6	787	792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011987	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	222101967
3	NC_011987	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011987	A	6	6	5934	5939	100 %	0 %	0 %	0 %	222101969
5	NC_011987	A	7	7	7012	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	222101970
6	NC_011987	C	6	6	11149	11154	0 %	0 %	0 %	100 %	222101975
7	NC_011987	G	6	6	11938	11943	0 %	0 %	100 %	0 %	222101975
8	NC_011987	T	6	6	14920	14925	0 %	100 %	0 %	0 %	222101979
9	NC_011987	G	6	6	15136	15141	0 %	0 %	100 %	0 %	222101979
10	NC_011987	A	6	6	15591	15596	100 %	0 %	0 %	0 %	222101980
11	NC_011987	T	8	8	16562	16569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011987	A	6	6	21313	21318	100 %	0 %	0 %	0 %	222101984
13	NC_011987	T	6	6	21983	21988	0 %	100 %	0 %	0 %	222101986
14	NC_011987	G	6	6	26153	26158	0 %	0 %	100 %	0 %	222101993
15	NC_011987	C	6	6	26527	26532	0 %	0 %	0 %	100 %	222101993
16	NC_011987	A	6	6	30092	30097	100 %	0 %	0 %	0 %	222101996
17	NC_011987	T	6	6	31772	31777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011987	C	8	8	32073	32080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_011987	A	6	6	37309	37314	100 %	0 %	0 %	0 %	222102002
20	NC_011987	T	7	7	38999	39005	0 %	100 %	0 %	0 %	222102002
21	NC_011987	A	7	7	39100	39106	100 %	0 %	0 %	0 %	222102002
22	NC_011987	A	6	6	41549	41554	100 %	0 %	0 %	0 %	222102007
23	NC_011987	C	6	6	56935	56940	0 %	0 %	0 %	100 %	222102023
24	NC_011987	A	6	6	59172	59177	100 %	0 %	0 %	0 %	222102026
25	NC_011987	T	6	6	59687	59692	0 %	100 %	0 %	0 %	222102026
26	NC_011987	T	7	7	59875	59881	0 %	100 %	0 %	0 %	222102026
27	NC_011987	A	6	6	65229	65234	100 %	0 %	0 %	0 %	222102031
28	NC_011987	G	6	6	66738	66743	0 %	0 %	100 %	0 %	222102032
29	NC_011987	A	6	6	68187	68192	100 %	0 %	0 %	0 %	222102033
30	NC_011987	T	6	6	69494	69499	0 %	100 %	0 %	0 %	222102034
31	NC_011987	T	6	6	69796	69801	0 %	100 %	0 %	0 %	222102034
32	NC_011987	A	8	8	77255	77262	100 %	0 %	0 %	0 %	222102040
33	NC_011987	A	6	6	83511	83516	100 %	0 %	0 %	0 %	222102046
34	NC_011987	T	6	6	83897	83902	0 %	100 %	0 %	0 %	222102046
35	NC_011987	A	6	6	85225	85230	100 %	0 %	0 %	0 %	222102047
36	NC_011987	C	6	6	88792	88797	0 %	0 %	0 %	100 %	222102050
37	NC_011987	T	6	6	95114	95119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011987	T	6	6	95507	95512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011987	C	6	6	96785	96790	0 %	0 %	0 %	100 %	222102057
40	NC_011987	T	6	6	97819	97824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011987	G	6	6	107584	107589	0 %	0 %	100 %	0 %	222102069
42	NC_011987	T	6	6	118928	118933	0 %	100 %	0 %	0 %	222102080
43	NC_011987	C	6	6	120242	120247	0 %	0 %	0 %	100 %	222102081
44	NC_011987	C	7	7	127259	127265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_011987	A	6	6	131550	131555	100 %	0 %	0 %	0 %	222102092
46	NC_011987	T	6	6	134976	134981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011987	T	6	6	138143	138148	0 %	100 %	0 %	0 %	222102098
48	NC_011987	G	6	6	139194	139199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011987	T	6	6	148237	148242	0 %	100 %	0 %	0 %	222102106
50	NC_011987	C	6	6	150734	150739	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_011987	G	6	6	152247	152252	0 %	0 %	100 %	0 %	222102110
52	NC_011987	A	6	6	157351	157356	100 %	0 %	0 %	0 %	222102116
53	NC_011987	G	6	6	160138	160143	0 %	0 %	100 %	0 %	222102118
54	NC_011987	G	6	6	161728	161733	0 %	0 %	100 %	0 %	222102119
55	NC_011987	C	6	6	165366	165371	0 %	0 %	0 %	100 %	222102122
56	NC_011987	C	6	6	169190	169195	0 %	0 %	0 %	100 %	222102125
57	NC_011987	A	6	6	173213	173218	100 %	0 %	0 %	0 %	222102129
58	NC_011987	T	6	6	173986	173991	0 %	100 %	0 %	0 %	222102130
59	NC_011987	T	6	6	176231	176236	0 %	100 %	0 %	0 %	222102132
60	NC_011987	T	7	7	184572	184578	0 %	100 %	0 %	0 %	222102141
61	NC_011987	G	6	6	187069	187074	0 %	0 %	100 %	0 %	222102142
62	NC_011987	A	6	6	187424	187429	100 %	0 %	0 %	0 %	222102143
63	NC_011987	T	6	6	188860	188865	0 %	100 %	0 %	0 %	222102144
64	NC_011987	C	6	6	202394	202399	0 %	0 %	0 %	100 %	222102156
65	NC_011987	C	6	6	216248	216253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_011987	G	6	6	216839	216844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011987	T	7	7	217766	217772	0 %	100 %	0 %	0 %	222102171
68	NC_011987	T	6	6	218767	218772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011987	A	6	6	225654	225659	100 %	0 %	0 %	0 %	222102179
70	NC_011987	T	6	6	226203	226208	0 %	100 %	0 %	0 %	222102180
71	NC_011987	T	6	6	228199	228204	0 %	100 %	0 %	0 %	222102182
72	NC_011987	C	6	6	230023	230028	0 %	0 %	0 %	100 %	222102184
73	NC_011987	C	6	6	231173	231178	0 %	0 %	0 %	100 %	222102185
74	NC_011987	A	6	6	237037	237042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011987	C	6	6	243535	243540	0 %	0 %	0 %	100 %	222102198
76	NC_011987	T	6	6	243997	244002	0 %	100 %	0 %	0 %	222102198
77	NC_011987	A	6	6	244071	244076	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
78	NC_011987	A	6	6	244597	244602	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
79	NC_011987	A	7	7	244835	244841	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
80	NC_011987	T	7	7	245362	245368	0 %	100 %	0 %	0 %	222102199
81	NC_011987	C	6	6	246331	246336	0 %	0 %	0 %	100 %	222102200
82	NC_011987	A	6	6	248158	248163	100 %	0 %	0 %	0 %	222102202
83	NC_011987	G	6	6	249877	249882	0 %	0 %	100 %	0 %	222102205
84	NC_011987	G	6	6	256009	256014	0 %	0 %	100 %	0 %	222102211
85	NC_011987	A	6	6	262720	262725	100 %	0 %	0 %	0 %	222102216
86	NC_011987	C	7	7	265021	265027	0 %	0 %	0 %	100 %	222102218
87	NC_011987	A	6	6	265048	265053	100 %	0 %	0 %	0 %	222102218
88	NC_011987	T	6	6	273678	273683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011987	T	6	6	276872	276877	0 %	100 %	0 %	0 %	222102227
90	NC_011987	A	6	6	277277	277282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011987	A	7	7	280838	280844	100 %	0 %	0 %	0 %	222102230
92	NC_011987	C	6	6	282837	282842	0 %	0 %	0 %	100 %	222102233
93	NC_011987	C	6	6	288086	288091	0 %	0 %	0 %	100 %	222102237
94	NC_011987	G	6	6	291852	291857	0 %	0 %	100 %	0 %	222102242
95	NC_011987	C	6	6	295862	295867	0 %	0 %	0 %	100 %	222102246
96	NC_011987	T	6	6	304222	304227	0 %	100 %	0 %	0 %	222102253
97	NC_011987	C	6	6	308565	308570	0 %	0 %	0 %	100 %	222102257
98	NC_011987	T	6	6	309274	309279	0 %	100 %	0 %	0 %	222102257
99	NC_011987	G	7	7	311071	311077	0 %	0 %	100 %	0 %	222102258
100	NC_011987	T	6	6	320730	320735	0 %	100 %	0 %	0 %	222102267
101	NC_011987	A	6	6	324246	324251	100 %	0 %	0 %	0 %	222102270
102	NC_011987	A	6	6	325316	325321	100 %	0 %	0 %	0 %	222102271
103	NC_011987	T	6	6	331397	331402	0 %	100 %	0 %	0 %	222102275
104	NC_011987	G	6	6	332956	332961	0 %	0 %	100 %	0 %	222102277
105	NC_011987	G	6	6	333808	333813	0 %	0 %	100 %	0 %	222102277
106	NC_011987	A	6	6	337968	337973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011987	A	6	6	338024	338029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011987	T	7	7	338103	338109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011987	C	6	6	340225	340230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_011987	T	6	6	340238	340243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011987	A	6	6	349022	349027	100 %	0 %	0 %	0 %	222102293
112	NC_011987	G	6	6	350235	350240	0 %	0 %	100 %	0 %	222102293
113	NC_011987	A	6	6	351953	351958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011987	A	6	6	354259	354264	100 %	0 %	0 %	0 %	222102295
115	NC_011987	T	6	6	355991	355996	0 %	100 %	0 %	0 %	222102297
116	NC_011987	A	6	6	356458	356463	100 %	0 %	0 %	0 %	222102297
117	NC_011987	A	6	6	360003	360008	100 %	0 %	0 %	0 %	222102301
118	NC_011987	A	6	6	365907	365912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011987	G	6	6	368799	368804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011987	A	6	6	370315	370320	100 %	0 %	0 %	0 %	222102311
121	NC_011987	T	7	7	371547	371553	0 %	100 %	0 %	0 %	222102311
122	NC_011987	A	6	6	371650	371655	100 %	0 %	0 %	0 %	222102311
123	NC_011987	A	6	6	373596	373601	100 %	0 %	0 %	0 %	222102313
124	NC_011987	A	6	6	374278	374283	100 %	0 %	0 %	0 %	222102313
125	NC_011987	C	6	6	374342	374347	0 %	0 %	0 %	100 %	222102313
126	NC_011987	C	6	6	375509	375514	0 %	0 %	0 %	100 %	222102314
127	NC_011987	T	6	6	376369	376374	0 %	100 %	0 %	0 %	222102315
128	NC_011987	A	6	6	376439	376444	100 %	0 %	0 %	0 %	222102315
129	NC_011987	T	6	6	378256	378261	0 %	100 %	0 %	0 %	222102318
130	NC_011987	G	6	6	384456	384461	0 %	0 %	100 %	0 %	222102325
131	NC_011987	A	6	6	386326	386331	100 %	0 %	0 %	0 %	222102327
132	NC_011987	G	6	6	387607	387612	0 %	0 %	100 %	0 %	222102328

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.