MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	222101967
2	NC_011987	A	6	6	5934	5939	100 %	0 %	0 %	0 %	222101969
3	NC_011987	A	7	7	7012	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	222101970
4	NC_011987	C	6	6	11149	11154	0 %	0 %	0 %	100 %	222101975
5	NC_011987	G	6	6	11938	11943	0 %	0 %	100 %	0 %	222101975
6	NC_011987	T	6	6	14920	14925	0 %	100 %	0 %	0 %	222101979
7	NC_011987	G	6	6	15136	15141	0 %	0 %	100 %	0 %	222101979
8	NC_011987	A	6	6	15591	15596	100 %	0 %	0 %	0 %	222101980
9	NC_011987	A	6	6	21313	21318	100 %	0 %	0 %	0 %	222101984
10	NC_011987	T	6	6	21983	21988	0 %	100 %	0 %	0 %	222101986
11	NC_011987	G	6	6	26153	26158	0 %	0 %	100 %	0 %	222101993
12	NC_011987	C	6	6	26527	26532	0 %	0 %	0 %	100 %	222101993
13	NC_011987	A	6	6	30092	30097	100 %	0 %	0 %	0 %	222101996
14	NC_011987	A	6	6	37309	37314	100 %	0 %	0 %	0 %	222102002
15	NC_011987	T	7	7	38999	39005	0 %	100 %	0 %	0 %	222102002
16	NC_011987	A	7	7	39100	39106	100 %	0 %	0 %	0 %	222102002
17	NC_011987	A	6	6	41549	41554	100 %	0 %	0 %	0 %	222102007
18	NC_011987	C	6	6	56935	56940	0 %	0 %	0 %	100 %	222102023
19	NC_011987	A	6	6	59172	59177	100 %	0 %	0 %	0 %	222102026
20	NC_011987	T	6	6	59687	59692	0 %	100 %	0 %	0 %	222102026
21	NC_011987	T	7	7	59875	59881	0 %	100 %	0 %	0 %	222102026
22	NC_011987	A	6	6	65229	65234	100 %	0 %	0 %	0 %	222102031
23	NC_011987	G	6	6	66738	66743	0 %	0 %	100 %	0 %	222102032
24	NC_011987	A	6	6	68187	68192	100 %	0 %	0 %	0 %	222102033
25	NC_011987	T	6	6	69494	69499	0 %	100 %	0 %	0 %	222102034
26	NC_011987	T	6	6	69796	69801	0 %	100 %	0 %	0 %	222102034
27	NC_011987	A	8	8	77255	77262	100 %	0 %	0 %	0 %	222102040
28	NC_011987	A	6	6	83511	83516	100 %	0 %	0 %	0 %	222102046
29	NC_011987	T	6	6	83897	83902	0 %	100 %	0 %	0 %	222102046
30	NC_011987	A	6	6	85225	85230	100 %	0 %	0 %	0 %	222102047
31	NC_011987	C	6	6	88792	88797	0 %	0 %	0 %	100 %	222102050
32	NC_011987	C	6	6	96785	96790	0 %	0 %	0 %	100 %	222102057
33	NC_011987	G	6	6	107584	107589	0 %	0 %	100 %	0 %	222102069
34	NC_011987	T	6	6	118928	118933	0 %	100 %	0 %	0 %	222102080
35	NC_011987	C	6	6	120242	120247	0 %	0 %	0 %	100 %	222102081
36	NC_011987	A	6	6	131550	131555	100 %	0 %	0 %	0 %	222102092
37	NC_011987	T	6	6	138143	138148	0 %	100 %	0 %	0 %	222102098
38	NC_011987	T	6	6	148237	148242	0 %	100 %	0 %	0 %	222102106
39	NC_011987	G	6	6	152247	152252	0 %	0 %	100 %	0 %	222102110
40	NC_011987	A	6	6	157351	157356	100 %	0 %	0 %	0 %	222102116
41	NC_011987	G	6	6	160138	160143	0 %	0 %	100 %	0 %	222102118
42	NC_011987	G	6	6	161728	161733	0 %	0 %	100 %	0 %	222102119
43	NC_011987	C	6	6	165366	165371	0 %	0 %	0 %	100 %	222102122
44	NC_011987	C	6	6	169190	169195	0 %	0 %	0 %	100 %	222102125
45	NC_011987	A	6	6	173213	173218	100 %	0 %	0 %	0 %	222102129
46	NC_011987	T	6	6	173986	173991	0 %	100 %	0 %	0 %	222102130
47	NC_011987	T	6	6	176231	176236	0 %	100 %	0 %	0 %	222102132
48	NC_011987	T	7	7	184572	184578	0 %	100 %	0 %	0 %	222102141
49	NC_011987	G	6	6	187069	187074	0 %	0 %	100 %	0 %	222102142
50	NC_011987	A	6	6	187424	187429	100 %	0 %	0 %	0 %	222102143
51	NC_011987	T	6	6	188860	188865	0 %	100 %	0 %	0 %	222102144
52	NC_011987	C	6	6	202394	202399	0 %	0 %	0 %	100 %	222102156
53	NC_011987	T	7	7	217766	217772	0 %	100 %	0 %	0 %	222102171
54	NC_011987	A	6	6	225654	225659	100 %	0 %	0 %	0 %	222102179
55	NC_011987	T	6	6	226203	226208	0 %	100 %	0 %	0 %	222102180
56	NC_011987	T	6	6	228199	228204	0 %	100 %	0 %	0 %	222102182
57	NC_011987	C	6	6	230023	230028	0 %	0 %	0 %	100 %	222102184
58	NC_011987	C	6	6	231173	231178	0 %	0 %	0 %	100 %	222102185
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60	NC_011987	T	6	6	243997	244002	0 %	100 %	0 %	0 %	222102198
61	NC_011987	A	6	6	244071	244076	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
62	NC_011987	A	6	6	244597	244602	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
63	NC_011987	A	7	7	244835	244841	100 %	0 %	0 %	0 %	222102199
64	NC_011987	T	7	7	245362	245368	0 %	100 %	0 %	0 %	222102199
65	NC_011987	C	6	6	246331	246336	0 %	0 %	0 %	100 %	222102200
66	NC_011987	A	6	6	248158	248163	100 %	0 %	0 %	0 %	222102202
67	NC_011987	G	6	6	249877	249882	0 %	0 %	100 %	0 %	222102205
68	NC_011987	G	6	6	256009	256014	0 %	0 %	100 %	0 %	222102211
69	NC_011987	A	6	6	262720	262725	100 %	0 %	0 %	0 %	222102216
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81	NC_011987	G	7	7	311071	311077	0 %	0 %	100 %	0 %	222102258
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83	NC_011987	A	6	6	324246	324251	100 %	0 %	0 %	0 %	222102270
84	NC_011987	A	6	6	325316	325321	100 %	0 %	0 %	0 %	222102271
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90	NC_011987	A	6	6	354259	354264	100 %	0 %	0 %	0 %	222102295
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92	NC_011987	A	6	6	356458	356463	100 %	0 %	0 %	0 %	222102297
93	NC_011987	A	6	6	360003	360008	100 %	0 %	0 %	0 %	222102301
94	NC_011987	A	6	6	370315	370320	100 %	0 %	0 %	0 %	222102311
95	NC_011987	T	7	7	371547	371553	0 %	100 %	0 %	0 %	222102311
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97	NC_011987	A	6	6	373596	373601	100 %	0 %	0 %	0 %	222102313
98	NC_011987	A	6	6	374278	374283	100 %	0 %	0 %	0 %	222102313
99	NC_011987	C	6	6	374342	374347	0 %	0 %	0 %	100 %	222102313
100	NC_011987	C	6	6	375509	375514	0 %	0 %	0 %	100 %	222102314
101	NC_011987	T	6	6	376369	376374	0 %	100 %	0 %	0 %	222102315
102	NC_011987	A	6	6	376439	376444	100 %	0 %	0 %	0 %	222102315
103	NC_011987	T	6	6	378256	378261	0 %	100 %	0 %	0 %	222102318
104	NC_011987	G	6	6	384456	384461	0 %	0 %	100 %	0 %	222102325
105	NC_011987	A	6	6	386326	386331	100 %	0 %	0 %	0 %	222102327
106	NC_011987	G	6	6	387607	387612	0 %	0 %	100 %	0 %	222102328

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.