MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	ATCTTG	2	12	828	839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222102330
2	NC_011986	TCTCCG	2	12	2743	2754	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222102332
3	NC_011986	GGGTAT	2	12	3950	3961	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011986	TCTGGA	2	12	10430	10441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102338
5	NC_011986	GAAGAT	2	12	13609	13620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222102340
6	NC_011986	TCAGGG	2	12	14785	14796	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222102341
7	NC_011986	GCACGG	2	12	20003	20014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102347
8	NC_011986	ATCTTC	2	12	20098	20109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222102347
9	NC_011986	TAAATC	2	12	27465	27476	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011986	GGACGA	2	12	29654	29665	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222102359
11	NC_011986	ATGGCT	2	12	29812	29823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102359
12	NC_011986	AAAAGA	2	12	36620	36631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011986	ATCTCC	2	12	39859	39870	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222102371
14	NC_011986	TGGTCA	2	12	40187	40198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102371
15	NC_011986	TCGACG	2	12	42212	42223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222102372
16	NC_011986	AATCAG	2	12	43094	43105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222102374
17	NC_011986	CATGGG	2	12	43925	43936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222102376
18	NC_011986	GCCAAC	2	12	45668	45679	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222102378
19	NC_011986	ACCGCG	2	12	45735	45746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102378
20	NC_011986	CGCAGG	2	12	48597	48608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102382
21	NC_011986	ACGGCG	2	12	49665	49676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102382
22	NC_011986	CGAGTT	2	12	54609	54620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102387
23	NC_011986	GGCGAG	2	12	54769	54780	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222102387
24	NC_011986	ATCGCC	2	12	55117	55128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222102387
25	NC_011986	GGTTCG	2	12	57870	57881	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222102389
26	NC_011986	AGCGCG	2	12	58304	58315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102389
27	NC_011986	GACGCC	2	12	62561	62572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102395
28	NC_011986	GCTTCT	2	12	64651	64662	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222102398
29	NC_011986	GGCGAA	2	12	74041	74052	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222102406

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.