MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	CGT	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011986	GCC	2	6	4015	4020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011986	TAT	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011986	GCA	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011986	CGG	2	6	4627	4632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011986	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011986	GCT	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011986	GCG	2	6	5051	5056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011986	AAG	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011986	TGG	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011986	TGG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011986	AAC	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011986	ACA	2	6	6541	6546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011986	CAT	2	6	6584	6589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011986	GTG	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011986	CTT	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011986	GAG	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011986	TGC	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011986	CTG	2	6	10246	10251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011986	GTC	2	6	10291	10296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011986	GAT	2	6	21957	21962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011986	GAT	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011986	CAC	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011986	GAA	2	6	23445	23450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011986	TGC	2	6	27364	27369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011986	GCC	2	6	27540	27545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011986	TCT	2	6	28315	28320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011986	GAA	2	6	33354	33359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011986	GAT	2	6	33389	33394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011986	AGC	2	6	33406	33411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011986	TCG	2	6	33467	33472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011986	ACG	2	6	33531	33536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011986	AGG	2	6	33619	33624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011986	CAG	2	6	33649	33654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011986	CCA	2	6	33660	33665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011986	TCG	2	6	33805	33810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011986	GTG	2	6	33811	33816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011986	GAA	2	6	36167	36172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011986	GCA	2	6	36482	36487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011986	AAT	2	6	36556	36561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011986	CCA	2	6	38685	38690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011986	TAG	2	6	38709	38714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011986	CAG	2	6	38719	38724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011986	CAA	2	6	43174	43179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011986	GAC	2	6	43215	43220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011986	AGC	2	6	44626	44631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011986	TTG	2	6	46876	46881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011986	GCA	2	6	46910	46915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011986	CGG	2	6	46916	46921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011986	CCG	2	6	46983	46988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011986	TCG	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011986	ATG	2	6	47364	47369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011986	TCG	2	6	47384	47389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011986	AGG	2	6	47501	47506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011986	ACA	2	6	51139	51144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011986	GCC	2	6	51176	51181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011986	CGA	2	6	51536	51541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011986	GCA	2	6	51560	51565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011986	CGT	2	6	52011	52016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011986	GCA	2	6	57621	57626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011986	CGC	3	9	57629	57637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011986	GCC	2	6	57638	57643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011986	TCA	2	6	57775	57780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011986	GCG	2	6	58371	58376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011986	CGC	2	6	58427	58432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011986	CGC	2	6	58492	58497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011986	GCG	2	6	59168	59173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011986	CGC	2	6	59176	59181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011986	AAT	2	6	59188	59193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011986	GGC	2	6	59334	59339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011986	CGC	2	6	59790	59795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011986	GCT	2	6	59872	59877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011986	TTC	2	6	60434	60439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011986	GCC	2	6	60449	60454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011986	CGC	2	6	60487	60492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011986	TCC	2	6	61433	61438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011986	CGG	2	6	61517	61522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011986	GCC	2	6	61527	61532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011986	CCG	2	6	61582	61587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011986	AGG	2	6	61633	61638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011986	TCG	2	6	61738	61743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011986	CGA	2	6	61766	61771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011986	CCG	2	6	61780	61785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011986	TCG	2	6	61789	61794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011986	AGG	2	6	62291	62296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011986	GAC	2	6	62804	62809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011986	GCG	2	6	63019	63024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011986	AGG	2	6	63065	63070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011986	CAG	2	6	63137	63142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011986	GCT	2	6	63205	63210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011986	ACG	2	6	63228	63233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011986	GAT	2	6	63257	63262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011986	CAT	2	6	63275	63280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011986	ACG	2	6	64241	64246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011986	AGG	2	6	64300	64305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011986	TGC	2	6	64408	64413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011986	CGA	2	6	64488	64493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011986	AAC	2	6	64838	64843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011986	TTG	2	6	67678	67683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011986	GCA	2	6	67726	67731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011986	TGG	2	6	67834	67839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011986	TGC	2	6	67855	67860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011986	CGG	2	6	67949	67954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011986	AAT	2	6	68333	68338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011986	GCG	2	6	68526	68531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011986	CGG	2	6	68546	68551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011986	CAT	2	6	68592	68597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011986	CAT	2	6	68835	68840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011986	GGA	2	6	68895	68900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011986	CCT	2	6	68938	68943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011986	GAA	2	6	68998	69003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011986	TCG	2	6	69053	69058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011986	CGA	2	6	69059	69064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011986	CCG	2	6	69345	69350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011986	CTC	2	6	69375	69380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011986	CCG	2	6	69439	69444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011986	ATA	2	6	72000	72005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011986	TGC	2	6	72125	72130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011986	AAT	2	6	73551	73556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011986	TCC	2	6	75479	75484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011986	TGT	2	6	75536	75541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011986	AAT	2	6	75558	75563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011986	TTG	3	9	75587	75595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011986	TCC	2	6	75700	75705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011986	CCT	2	6	75757	75762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011986	ACC	2	6	75825	75830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011986	ACC	2	6	75842	75847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011986	TTG	2	6	76566	76571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011986	TCC	2	6	77785	77790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.