MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011986	TGA	2	6	39068	39073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102369
502	NC_011986	CTT	2	6	39109	39114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102370
503	NC_011986	CGT	2	6	39144	39149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102370
504	NC_011986	CGT	2	6	39186	39191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102370
505	NC_011986	GAT	2	6	39205	39210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102370
506	NC_011986	TTC	2	6	39307	39312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102370
507	NC_011986	ATC	2	6	39410	39415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102370
508	NC_011986	CGT	2	6	39420	39425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102370
509	NC_011986	CTT	2	6	39469	39474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102370
510	NC_011986	TCG	2	6	39751	39756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102371
511	NC_011986	ACG	2	6	39781	39786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102371
512	NC_011986	TCA	2	6	39833	39838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102371
513	NC_011986	GTG	2	6	40005	40010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102371
514	NC_011986	GTC	2	6	40224	40229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102371
515	NC_011986	GAC	2	6	40236	40241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102371
516	NC_011986	ATG	2	6	40306	40311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102371
517	NC_011986	CAT	2	6	40419	40424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102371
518	NC_011986	GGT	2	6	40460	40465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102371
519	NC_011986	CCG	2	6	40543	40548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102371
520	NC_011986	TTG	2	6	40612	40617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102371
521	NC_011986	TCG	2	6	40658	40663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102371
522	NC_011986	GTT	2	6	40764	40769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102371
523	NC_011986	CGC	2	6	40911	40916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102371
524	NC_011986	TCT	2	6	40953	40958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102371
525	NC_011986	CCG	3	9	40988	40996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
526	NC_011986	CGG	2	6	41001	41006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102372
527	NC_011986	CAC	2	6	41025	41030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102372
528	NC_011986	CTG	2	6	41031	41036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102372
529	NC_011986	CGC	3	9	41043	41051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
530	NC_011986	GAG	2	6	41113	41118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102372
531	NC_011986	GAG	2	6	41188	41193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102372
532	NC_011986	TGC	2	6	41211	41216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102372
533	NC_011986	TCC	2	6	41447	41452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102372
534	NC_011986	GGT	2	6	41536	41541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102372
535	NC_011986	TTC	2	6	41816	41821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102372
536	NC_011986	CGG	3	9	41841	41849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102372
537	NC_011986	AGG	2	6	41883	41888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102372
538	NC_011986	CCG	2	6	41919	41924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
539	NC_011986	GCA	2	6	41945	41950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102372
540	NC_011986	TGG	2	6	42024	42029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102372
541	NC_011986	CCG	2	6	42135	42140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
542	NC_011986	GCC	2	6	42164	42169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
543	NC_011986	TTG	3	9	42179	42187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102372
544	NC_011986	CCG	2	6	42204	42209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
545	NC_011986	GAG	2	6	42235	42240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102372
546	NC_011986	CGG	2	6	42345	42350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102372
547	NC_011986	GAT	2	6	42371	42376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102372
548	NC_011986	AGG	2	6	42597	42602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102373
549	NC_011986	ACC	2	6	42643	42648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102373
550	NC_011986	AGG	2	6	42680	42685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102373
551	NC_011986	GCG	2	6	42691	42696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102373
552	NC_011986	ACG	2	6	42834	42839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102374
553	NC_011986	GCA	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102374
554	NC_011986	GCT	2	6	43038	43043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102374
555	NC_011986	GAT	2	6	43118	43123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102374
556	NC_011986	CAA	2	6	43174	43179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011986	GAC	2	6	43215	43220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011986	GCA	2	6	43420	43425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102375
559	NC_011986	TGC	2	6	43578	43583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
560	NC_011986	CCA	2	6	43585	43590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102375
561	NC_011986	TGC	2	6	43596	43601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
562	NC_011986	TGG	2	6	43628	43633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102375
563	NC_011986	TGT	2	6	43652	43657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102375
564	NC_011986	TCG	2	6	43660	43665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
565	NC_011986	AAC	2	6	43672	43677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102375
566	NC_011986	TTC	2	6	43693	43698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102375
567	NC_011986	ATG	2	6	43941	43946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
568	NC_011986	ATG	2	6	43998	44003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
569	NC_011986	ATG	2	6	44010	44015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
570	NC_011986	AAG	2	6	44016	44021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102376
571	NC_011986	GAT	2	6	44048	44053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
572	NC_011986	AGA	2	6	44134	44139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102376
573	NC_011986	GCG	2	6	44320	44325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102377
574	NC_011986	ATG	2	6	44355	44360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102377
575	NC_011986	GAT	2	6	44466	44471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102377
576	NC_011986	GGC	2	6	44543	44548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102377
577	NC_011986	AGC	2	6	44626	44631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011986	CTC	2	6	44664	44669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102378
579	NC_011986	CGA	2	6	44699	44704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
580	NC_011986	GAT	2	6	44726	44731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
581	NC_011986	CGG	2	6	44770	44775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102378
582	NC_011986	CAG	2	6	44891	44896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
583	NC_011986	CGT	2	6	44977	44982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
584	NC_011986	CGA	2	6	45004	45009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
585	NC_011986	CTT	2	6	45016	45021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102378
586	NC_011986	GCG	2	6	45105	45110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102378
587	NC_011986	CGT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
588	NC_011986	TTG	2	6	45120	45125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102378
589	NC_011986	GTC	3	9	45186	45194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
590	NC_011986	GCC	2	6	45221	45226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
591	NC_011986	TCC	2	6	45321	45326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102378
592	NC_011986	ATG	2	6	45327	45332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
593	NC_011986	ATG	2	6	45345	45350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
594	NC_011986	CGC	2	6	45440	45445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
595	NC_011986	GCC	2	6	45495	45500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
596	NC_011986	GCA	2	6	45505	45510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
597	NC_011986	CGA	2	6	45589	45594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
598	NC_011986	GAT	2	6	45725	45730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
599	NC_011986	ATC	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
600	NC_011986	TGC	2	6	45794	45799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
601	NC_011986	CGA	2	6	45805	45810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
602	NC_011986	CAC	2	6	45824	45829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102378
603	NC_011986	TCG	2	6	45852	45857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
604	NC_011986	ATC	2	6	46038	46043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
605	NC_011986	TCA	2	6	46047	46052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
606	NC_011986	CGA	2	6	46126	46131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
607	NC_011986	TCG	2	6	46155	46160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
608	NC_011986	AAG	2	6	46202	46207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102378
609	NC_011986	TGA	2	6	46279	46284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
610	NC_011986	CAA	2	6	46366	46371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102378
611	NC_011986	GAA	2	6	46460	46465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102378
612	NC_011986	GAC	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
613	NC_011986	TGA	3	9	46821	46829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
614	NC_011986	TTG	2	6	46876	46881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011986	GCA	2	6	46910	46915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011986	CGG	2	6	46916	46921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011986	CCG	2	6	46983	46988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_011986	CTG	2	6	47060	47065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102379
619	NC_011986	TGG	2	6	47181	47186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102379
620	NC_011986	ATC	2	6	47189	47194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102379
621	NC_011986	CTT	2	6	47203	47208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102379
622	NC_011986	AGC	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102379
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624	NC_011986	TCG	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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