MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	G	7	7	3751	3757	0 %	0 %	100 %	0 %	222102332
2	NC_011986	T	6	6	5656	5661	0 %	100 %	0 %	0 %	222102335
3	NC_011986	T	6	6	6881	6886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011986	G	6	6	8463	8468	0 %	0 %	100 %	0 %	222102337
5	NC_011986	A	6	6	12423	12428	100 %	0 %	0 %	0 %	222102338
6	NC_011986	G	6	6	13649	13654	0 %	0 %	100 %	0 %	222102340
7	NC_011986	A	6	6	15515	15520	100 %	0 %	0 %	0 %	222102341
8	NC_011986	T	6	6	16152	16157	0 %	100 %	0 %	0 %	222102342
9	NC_011986	C	6	6	16484	16489	0 %	0 %	0 %	100 %	222102343
10	NC_011986	C	6	6	17910	17915	0 %	0 %	0 %	100 %	222102345
11	NC_011986	T	6	6	19118	19123	0 %	100 %	0 %	0 %	222102346
12	NC_011986	A	6	6	20293	20298	100 %	0 %	0 %	0 %	222102347
13	NC_011986	T	6	6	23300	23305	0 %	100 %	0 %	0 %	222102349
14	NC_011986	T	6	6	25620	25625	0 %	100 %	0 %	0 %	222102353
15	NC_011986	T	6	6	27341	27346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011986	A	7	7	27499	27505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011986	A	6	6	27705	27710	100 %	0 %	0 %	0 %	222102357
18	NC_011986	A	6	6	28194	28199	100 %	0 %	0 %	0 %	222102357
19	NC_011986	T	6	6	35159	35164	0 %	100 %	0 %	0 %	222102363
20	NC_011986	G	6	6	36057	36062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011986	C	6	6	36997	37002	0 %	0 %	0 %	100 %	222102367
22	NC_011986	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	222102367
23	NC_011986	A	6	6	43427	43432	100 %	0 %	0 %	0 %	222102375
24	NC_011986	A	6	6	44121	44126	100 %	0 %	0 %	0 %	222102376
25	NC_011986	T	6	6	46849	46854	0 %	100 %	0 %	0 %	222102378
26	NC_011986	T	6	6	52607	52612	0 %	100 %	0 %	0 %	222102386
27	NC_011986	G	6	6	52615	52620	0 %	0 %	100 %	0 %	222102386
28	NC_011986	G	6	6	57482	57487	0 %	0 %	100 %	0 %	222102388
29	NC_011986	T	6	6	58531	58536	0 %	100 %	0 %	0 %	222102390
30	NC_011986	A	6	6	59740	59745	100 %	0 %	0 %	0 %	222102391
31	NC_011986	A	6	6	63170	63175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011986	T	7	7	63184	63190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011986	T	7	7	69252	69258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011986	A	6	6	73542	73547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011986	C	6	6	73579	73584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_011986	A	7	7	74945	74951	100 %	0 %	0 %	0 %	222102407
37	NC_011986	T	6	6	74956	74961	0 %	100 %	0 %	0 %	222102407
38	NC_011986	A	6	6	76046	76051	100 %	0 %	0 %	0 %	222102408
39	NC_011986	T	6	6	77839	77844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.