MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 1

Total Repeats: 2375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011985	GCCGT	2	10	2075	2084	0 %	20 %	40 %	40 %	222084203
2	NC_011985	GGCGC	2	10	3492	3501	0 %	0 %	60 %	40 %	222084205
3	NC_011985	TGGCG	2	10	4437	4446	0 %	20 %	60 %	20 %	222084206
4	NC_011985	GCCGC	2	10	6132	6141	0 %	0 %	40 %	60 %	222084209
5	NC_011985	CGTGC	2	10	8234	8243	0 %	20 %	40 %	40 %	222084211
6	NC_011985	AATGA	2	10	9329	9338	60 %	20 %	20 %	0 %	222084213
7	NC_011985	CATCG	2	10	17529	17538	20 %	20 %	20 %	40 %	222084220
8	NC_011985	CCTGC	2	10	19159	19168	0 %	20 %	20 %	60 %	222084222
9	NC_011985	GAGCC	2	10	19826	19835	20 %	0 %	40 %	40 %	222084222
10	NC_011985	GCCGC	2	10	21802	21811	0 %	0 %	40 %	60 %	222084224
11	NC_011985	GCTGC	2	10	22533	22542	0 %	20 %	40 %	40 %	222084225
12	NC_011985	GCCGG	2	10	22644	22653	0 %	0 %	60 %	40 %	222084225
13	NC_011985	GGCCG	2	10	22754	22763	0 %	0 %	60 %	40 %	222084225
14	NC_011985	GGCGC	2	10	23324	23333	0 %	0 %	60 %	40 %	222084226
15	NC_011985	GCGCC	2	10	25495	25504	0 %	0 %	40 %	60 %	222084227
16	NC_011985	TCGAA	2	10	25533	25542	40 %	20 %	20 %	20 %	222084227
17	NC_011985	CGGTG	2	10	25681	25690	0 %	20 %	60 %	20 %	222084227
18	NC_011985	GCCCG	2	10	28728	28737	0 %	0 %	40 %	60 %	222084228
19	NC_011985	GCCGG	2	10	29827	29836	0 %	0 %	60 %	40 %	222084228
20	NC_011985	TCTCG	2	10	31166	31175	0 %	40 %	20 %	40 %	222084229
21	NC_011985	TGCGC	2	10	31410	31419	0 %	20 %	40 %	40 %	222084230
22	NC_011985	GCCAG	2	10	35155	35164	20 %	0 %	40 %	40 %	222084231
23	NC_011985	GATCG	2	10	36097	36106	20 %	20 %	40 %	20 %	222084232
24	NC_011985	ACCGC	2	10	39521	39530	20 %	0 %	20 %	60 %	222084236
25	NC_011985	GCCAA	2	10	40226	40235	40 %	0 %	20 %	40 %	222084236
26	NC_011985	ACTCG	2	10	41540	41549	20 %	20 %	20 %	40 %	222084238
27	NC_011985	AGCCG	2	10	42353	42362	20 %	0 %	40 %	40 %	222084238
28	NC_011985	GTCCG	2	10	48959	48968	0 %	20 %	40 %	40 %	222084246
29	NC_011985	TCGTC	2	10	50212	50221	0 %	40 %	20 %	40 %	222084248
30	NC_011985	TGGCC	2	10	50284	50293	0 %	20 %	40 %	40 %	222084248
31	NC_011985	TGCGC	2	10	51405	51414	0 %	20 %	40 %	40 %	222084250
32	NC_011985	TCGCC	2	10	51522	51531	0 %	20 %	20 %	60 %	222084250
33	NC_011985	CGATC	2	10	53053	53062	20 %	20 %	20 %	40 %	222084251
34	NC_011985	GATCC	2	10	55598	55607	20 %	20 %	20 %	40 %	222084253
35	NC_011985	TCCGG	2	10	56023	56032	0 %	20 %	40 %	40 %	222084253
36	NC_011985	GCCGC	2	10	56277	56286	0 %	0 %	40 %	60 %	222084253
37	NC_011985	CGTGC	2	10	59782	59791	0 %	20 %	40 %	40 %	222084255
38	NC_011985	CAGGG	2	10	62522	62531	20 %	0 %	60 %	20 %	222084258
39	NC_011985	AGGCA	2	10	62787	62796	40 %	0 %	40 %	20 %	222084258
40	NC_011985	CGGCC	2	10	63803	63812	0 %	0 %	40 %	60 %	222084259
41	NC_011985	TCGCT	2	10	66286	66295	0 %	40 %	20 %	40 %	222084260
42	NC_011985	GGCCA	2	10	66384	66393	20 %	0 %	40 %	40 %	222084260
43	NC_011985	ACTGG	2	10	76244	76253	20 %	20 %	40 %	20 %	222084263
44	NC_011985	TCATC	2	10	78559	78568	20 %	40 %	0 %	40 %	222084265
45	NC_011985	GATCA	2	10	79795	79804	40 %	20 %	20 %	20 %	222084266
46	NC_011985	TCTGG	2	10	80682	80691	0 %	40 %	40 %	20 %	222084266
47	NC_011985	CGGTG	2	10	80939	80948	0 %	20 %	60 %	20 %	222084266
48	NC_011985	GCGGT	2	10	83397	83406	0 %	20 %	60 %	20 %	222084267
49	NC_011985	GCCTT	2	10	86166	86175	0 %	40 %	20 %	40 %	222084267
50	NC_011985	GCTCA	2	10	86625	86634	20 %	20 %	20 %	40 %	222084267
51	NC_011985	ACAGC	2	10	88059	88068	40 %	0 %	20 %	40 %	222084267
52	NC_011985	GCGAG	2	10	89202	89211	20 %	0 %	60 %	20 %	222084267
53	NC_011985	AATCA	2	10	90881	90890	60 %	20 %	0 %	20 %	222084267
54	NC_011985	GTTTG	2	10	96044	96053	0 %	60 %	40 %	0 %	222087939
55	NC_011985	AGACG	2	10	96256	96265	40 %	0 %	40 %	20 %	222087939
56	NC_011985	CTGTT	2	10	102760	102769	0 %	60 %	20 %	20 %	222084276
57	NC_011985	GATCG	2	10	104227	104236	20 %	20 %	40 %	20 %	222084277
58	NC_011985	CGGCC	2	10	104304	104313	0 %	0 %	40 %	60 %	222084277
59	NC_011985	TTGGC	2	10	104318	104327	0 %	40 %	40 %	20 %	222084277
60	NC_011985	TCGGC	2	10	106952	106961	0 %	20 %	40 %	40 %	222084279
61	NC_011985	ATCAT	2	10	108305	108314	40 %	40 %	0 %	20 %	222084280
62	NC_011985	ATCTC	2	10	108604	108613	20 %	40 %	0 %	40 %	222084281
63	NC_011985	TTTCG	2	10	110481	110490	0 %	60 %	20 %	20 %	222084282
64	NC_011985	TGCCG	2	10	111131	111140	0 %	20 %	40 %	40 %	222084283
65	NC_011985	CGGTC	2	10	116301	116310	0 %	20 %	40 %	40 %	222084287
66	NC_011985	GGCGC	2	10	117400	117409	0 %	0 %	60 %	40 %	222084289
67	NC_011985	CCCGG	2	10	117853	117862	0 %	0 %	40 %	60 %	222084289
68	NC_011985	GCCAT	2	10	119199	119208	20 %	20 %	20 %	40 %	222084290
69	NC_011985	GATCG	2	10	119794	119803	20 %	20 %	40 %	20 %	222084291
70	NC_011985	GCGAC	2	10	124898	124907	20 %	0 %	40 %	40 %	222084295
71	NC_011985	GCCGA	2	10	126953	126962	20 %	0 %	40 %	40 %	222084297
72	NC_011985	AGGTC	2	10	128646	128655	20 %	20 %	40 %	20 %	222084298
73	NC_011985	ATACG	2	10	129054	129063	40 %	20 %	20 %	20 %	222084299
74	NC_011985	CGGCC	2	10	129259	129268	0 %	0 %	40 %	60 %	222084299
75	NC_011985	CGACG	2	10	129409	129418	20 %	0 %	40 %	40 %	222084299
76	NC_011985	CGGCC	2	10	131847	131856	0 %	0 %	40 %	60 %	222084301
77	NC_011985	TGCGC	2	10	134270	134279	0 %	20 %	40 %	40 %	222084303
78	NC_011985	CATGT	2	10	134650	134659	20 %	40 %	20 %	20 %	222084304
79	NC_011985	CGAAC	2	10	136503	136512	40 %	0 %	20 %	40 %	222084305
80	NC_011985	CGGCG	2	10	136667	136676	0 %	0 %	60 %	40 %	222084305
81	NC_011985	GCCAT	2	10	137447	137456	20 %	20 %	20 %	40 %	222084305
82	NC_011985	CGGCC	2	10	138439	138448	0 %	0 %	40 %	60 %	222084306
83	NC_011985	GCACG	2	10	138739	138748	20 %	0 %	40 %	40 %	222084306
84	NC_011985	CGGGT	2	10	139505	139514	0 %	20 %	60 %	20 %	222084307
85	NC_011985	GAGGC	2	10	140201	140210	20 %	0 %	60 %	20 %	222084307
86	NC_011985	TGTGA	2	10	145139	145148	20 %	40 %	40 %	0 %	222084313
87	NC_011985	GTCGG	2	10	145516	145525	0 %	20 %	60 %	20 %	222084314
88	NC_011985	TCCTG	2	10	145915	145924	0 %	40 %	20 %	40 %	222084315
89	NC_011985	GAAGT	2	10	146208	146217	40 %	20 %	40 %	0 %	222084315
90	NC_011985	GCGAG	2	10	150638	150647	20 %	0 %	60 %	20 %	222084320
91	NC_011985	AGCGT	2	10	152617	152626	20 %	20 %	40 %	20 %	222084321
92	NC_011985	GAACG	2	10	152983	152992	40 %	0 %	40 %	20 %	222084321
93	NC_011985	GCGGT	2	10	157593	157602	0 %	20 %	60 %	20 %	222084326
94	NC_011985	CGGCG	2	10	158800	158809	0 %	0 %	60 %	40 %	222084326
95	NC_011985	CGTCC	2	10	159988	159997	0 %	20 %	20 %	60 %	222084327
96	NC_011985	TTTCG	2	10	160281	160290	0 %	60 %	20 %	20 %	222084328
97	NC_011985	CTTGT	2	10	162641	162650	0 %	60 %	20 %	20 %	222084330
98	NC_011985	CGGGC	2	10	163408	163417	0 %	0 %	60 %	40 %	222084330
99	NC_011985	GCGAT	2	10	164823	164832	20 %	20 %	40 %	20 %	222084332
100	NC_011985	TGGCG	2	10	165587	165596	0 %	20 %	60 %	20 %	222084333
101	NC_011985	TGCCT	2	10	166751	166760	0 %	40 %	20 %	40 %	222084335
102	NC_011985	ATTGA	2	10	167395	167404	40 %	40 %	20 %	0 %	222084336
103	NC_011985	CCGGC	2	10	169194	169203	0 %	0 %	40 %	60 %	222084337
104	NC_011985	TGGAA	2	10	170422	170431	40 %	20 %	40 %	0 %	222084338
105	NC_011985	GCGCG	2	10	173093	173102	0 %	0 %	60 %	40 %	222084342
106	NC_011985	CCGGA	2	10	175148	175157	20 %	0 %	40 %	40 %	222084344
107	NC_011985	TCGCC	2	10	176620	176629	0 %	20 %	20 %	60 %	222084345
108	NC_011985	ACGAG	2	10	177430	177439	40 %	0 %	40 %	20 %	222084346
109	NC_011985	TGCCG	2	10	179983	179992	0 %	20 %	40 %	40 %	222084349
110	NC_011985	CGGCG	2	10	180312	180321	0 %	0 %	60 %	40 %	222084349
111	NC_011985	TGACG	2	10	181181	181190	20 %	20 %	40 %	20 %	222084350
112	NC_011985	CGAGG	2	10	181403	181412	20 %	0 %	60 %	20 %	222084350
113	NC_011985	GCGCG	2	10	184849	184858	0 %	0 %	60 %	40 %	222084354
114	NC_011985	ATTGC	2	10	185302	185311	20 %	40 %	20 %	20 %	222084354
115	NC_011985	ACTTC	2	10	186756	186765	20 %	40 %	0 %	40 %	222084355
116	NC_011985	TCACG	2	10	189272	189281	20 %	20 %	20 %	40 %	222084356
117	NC_011985	GATCG	2	10	189549	189558	20 %	20 %	40 %	20 %	222084356
118	NC_011985	TCCCG	2	10	189940	189949	0 %	20 %	20 %	60 %	222084356
119	NC_011985	TGCCG	2	10	191225	191234	0 %	20 %	40 %	40 %	222084358
120	NC_011985	GCGGG	2	10	195190	195199	0 %	0 %	80 %	20 %	222084361
121	NC_011985	TCGGG	2	10	195674	195683	0 %	20 %	60 %	20 %	222084361
122	NC_011985	CTGTC	2	10	196057	196066	0 %	40 %	20 %	40 %	222084362
123	NC_011985	GATCG	2	10	197085	197094	20 %	20 %	40 %	20 %	222084363
124	NC_011985	GCCGG	2	10	198238	198247	0 %	0 %	60 %	40 %	222084364
125	NC_011985	GGCGC	2	10	198446	198455	0 %	0 %	60 %	40 %	222084364
126	NC_011985	TGCGC	2	10	199653	199662	0 %	20 %	40 %	40 %	222084365
127	NC_011985	GGCAT	2	10	207601	207610	20 %	20 %	40 %	20 %	222084367
128	NC_011985	CGCAG	2	10	208129	208138	20 %	0 %	40 %	40 %	222084367
129	NC_011985	GATCA	2	10	208753	208762	40 %	20 %	20 %	20 %	222084367
130	NC_011985	CGGTC	2	10	210853	210862	0 %	20 %	40 %	40 %	222084369
131	NC_011985	GCCGA	2	10	211397	211406	20 %	0 %	40 %	40 %	222084369
132	NC_011985	GCCCG	2	10	212053	212062	0 %	0 %	40 %	60 %	222084370
133	NC_011985	GGCCG	2	10	213013	213022	0 %	0 %	60 %	40 %	222084371
134	NC_011985	GCTGG	2	10	216167	216176	0 %	20 %	60 %	20 %	222084373
135	NC_011985	AGGAC	2	10	219266	219275	40 %	0 %	40 %	20 %	222084377
136	NC_011985	AGGTG	2	10	219362	219371	20 %	20 %	60 %	0 %	222084377
137	NC_011985	CCAGC	2	10	221939	221948	20 %	0 %	20 %	60 %	222084379
138	NC_011985	GCGCT	2	10	225367	225376	0 %	20 %	40 %	40 %	222084385
139	NC_011985	GGCAT	2	10	228383	228392	20 %	20 %	40 %	20 %	222084387
140	NC_011985	CATCG	2	10	229511	229520	20 %	20 %	20 %	40 %	222084388
141	NC_011985	CCTTT	2	10	230447	230456	0 %	60 %	0 %	40 %	222084388
142	NC_011985	AATCC	2	10	231818	231827	40 %	20 %	0 %	40 %	222084389
143	NC_011985	TGCCG	2	10	232421	232430	0 %	20 %	40 %	40 %	222084390
144	NC_011985	ACGGT	2	10	233506	233515	20 %	20 %	40 %	20 %	222084390
145	NC_011985	TCCTC	2	10	235434	235443	0 %	40 %	0 %	60 %	222084392
146	NC_011985	GCCAG	2	10	237222	237231	20 %	0 %	40 %	40 %	222084393
147	NC_011985	ATGCG	2	10	237843	237852	20 %	20 %	40 %	20 %	222084394
148	NC_011985	CGGGC	2	10	238268	238277	0 %	0 %	60 %	40 %	222084394
149	NC_011985	GATCG	2	10	239852	239861	20 %	20 %	40 %	20 %	222084395
150	NC_011985	TGGAT	2	10	240055	240064	20 %	40 %	40 %	0 %	222084395
151	NC_011985	TCGTG	2	10	242361	242370	0 %	40 %	40 %	20 %	222084396
152	NC_011985	CGAGC	2	10	242634	242643	20 %	0 %	40 %	40 %	222084396
153	NC_011985	AGCCG	2	10	243015	243024	20 %	0 %	40 %	40 %	222084397
154	NC_011985	CCTGC	2	10	243869	243878	0 %	20 %	20 %	60 %	222084398
155	NC_011985	CACCG	2	10	244652	244661	20 %	0 %	20 %	60 %	222084398
156	NC_011985	GCATG	2	10	245105	245114	20 %	20 %	40 %	20 %	222084398
157	NC_011985	CGCGC	2	10	246753	246762	0 %	0 %	40 %	60 %	222084399
158	NC_011985	GCGTC	2	10	247601	247610	0 %	20 %	40 %	40 %	222084400
159	NC_011985	CGCAG	2	10	247889	247898	20 %	0 %	40 %	40 %	222084400
160	NC_011985	GCGTG	2	10	248829	248838	0 %	20 %	60 %	20 %	222084401
161	NC_011985	TCGTC	2	10	252700	252709	0 %	40 %	20 %	40 %	222084405
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163	NC_011985	AGCGA	2	10	258734	258743	40 %	0 %	40 %	20 %	222084412
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165	NC_011985	GGCCG	2	10	260076	260085	0 %	0 %	60 %	40 %	222084414
166	NC_011985	CATCG	2	10	262143	262152	20 %	20 %	20 %	40 %	222084416
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170	NC_011985	CCACC	2	10	266593	266602	20 %	0 %	0 %	80 %	222084420
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173	NC_011985	GTTCT	2	10	271074	271083	0 %	60 %	20 %	20 %	222084424
174	NC_011985	CGATC	2	10	274938	274947	20 %	20 %	20 %	40 %	222084427
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176	NC_011985	CGGCG	2	10	278792	278801	0 %	0 %	60 %	40 %	222084430
177	NC_011985	TGATC	2	10	279331	279340	20 %	40 %	20 %	20 %	222084430
178	NC_011985	TCCAG	2	10	280966	280975	20 %	20 %	20 %	40 %	222084431
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194	NC_011985	CGGGG	2	10	303999	304008	0 %	0 %	80 %	20 %	222084457
195	NC_011985	ATCGC	2	10	304574	304583	20 %	20 %	20 %	40 %	222084457
196	NC_011985	GGTCG	2	10	307192	307201	0 %	20 %	60 %	20 %	222084461
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223	NC_011985	CACGG	2	10	344124	344133	20 %	0 %	40 %	40 %	222084495
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246	NC_011985	TCCAC	2	10	379840	379849	20 %	20 %	0 %	60 %	222084534
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248	NC_011985	CGGCG	2	10	380891	380900	0 %	0 %	60 %	40 %	222084535
249	NC_011985	AAGGC	2	10	381094	381103	40 %	0 %	40 %	20 %	222084535
250	NC_011985	GCCGA	2	10	381193	381202	20 %	0 %	40 %	40 %	222084535
251	NC_011985	GACGA	2	10	382030	382039	40 %	0 %	40 %	20 %	222084535
252	NC_011985	GCCAT	2	10	389210	389219	20 %	20 %	20 %	40 %	222084538
253	NC_011985	CCGCG	2	10	389399	389408	0 %	0 %	40 %	60 %	222084538
254	NC_011985	GTGAG	2	10	389994	390003	20 %	20 %	60 %	0 %	222084538
255	NC_011985	CGAGA	2	10	390830	390839	40 %	0 %	40 %	20 %	222084540
256	NC_011985	CATGT	2	10	391029	391038	20 %	40 %	20 %	20 %	222084540
257	NC_011985	GGCGA	2	10	392295	392304	20 %	0 %	60 %	20 %	222084542
258	NC_011985	GGCGC	2	10	393104	393113	0 %	0 %	60 %	40 %	222084542
259	NC_011985	GAAGT	2	10	394838	394847	40 %	20 %	40 %	0 %	222084544
260	NC_011985	GCTCG	2	10	395204	395213	0 %	20 %	40 %	40 %	222084545
261	NC_011985	GCAGG	2	10	396457	396466	20 %	0 %	60 %	20 %	222084546
262	NC_011985	GCCGA	2	10	398341	398350	20 %	0 %	40 %	40 %	222084547
263	NC_011985	GCGCG	2	10	398370	398379	0 %	0 %	60 %	40 %	222084547
264	NC_011985	GCCGC	2	10	399955	399964	0 %	0 %	40 %	60 %	222084548
265	NC_011985	GCCGT	2	10	404600	404609	0 %	20 %	40 %	40 %	222084554
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389	NC_011985	CGACC	2	10	599095	599104	20 %	0 %	20 %	60 %	222084748
390	NC_011985	CGGCG	2	10	599308	599317	0 %	0 %	60 %	40 %	222084748
391	NC_011985	CGGCG	2	10	599482	599491	0 %	0 %	60 %	40 %	222084748
392	NC_011985	GAGAT	2	10	601594	601603	40 %	20 %	40 %	0 %	222084751
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