MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011984	CAAA	2	8	1176	1183	75 %	0 %	0 %	25 %	222083146
2	NC_011984	TGAT	2	8	1572	1579	25 %	50 %	25 %	0 %	222083147
3	NC_011984	TGAC	2	8	1785	1792	25 %	25 %	25 %	25 %	222083147
4	NC_011984	AGGA	2	8	1832	1839	50 %	0 %	50 %	0 %	222083147
5	NC_011984	GCAC	2	8	2079	2086	25 %	0 %	25 %	50 %	222083147
6	NC_011984	TCGC	2	8	2884	2891	0 %	25 %	25 %	50 %	222083148
7	NC_011984	GGAC	2	8	3199	3206	25 %	0 %	50 %	25 %	222083148
8	NC_011984	GCGG	2	8	3342	3349	0 %	0 %	75 %	25 %	222083148
9	NC_011984	TGCC	2	8	3419	3426	0 %	25 %	25 %	50 %	222083148
10	NC_011984	GGCC	2	8	3599	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	222083148
11	NC_011984	CGAT	2	8	3891	3898	25 %	25 %	25 %	25 %	222083149
12	NC_011984	TTCG	3	12	4365	4376	0 %	50 %	25 %	25 %	222083149
13	NC_011984	GGGC	2	8	4608	4615	0 %	0 %	75 %	25 %	222083149
14	NC_011984	GAAT	2	8	5219	5226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011984	CATT	2	8	6072	6079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011984	GACA	2	8	6115	6122	50 %	0 %	25 %	25 %	222083150
17	NC_011984	GTCA	2	8	7386	7393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011984	CGAG	2	8	7472	7479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011984	CCCG	2	8	7636	7643	0 %	0 %	25 %	75 %	222083151
20	NC_011984	GGAG	2	8	8344	8351	25 %	0 %	75 %	0 %	222083151
21	NC_011984	GAGG	2	8	8505	8512	25 %	0 %	75 %	0 %	222083151
22	NC_011984	CGGC	2	8	8554	8561	0 %	0 %	50 %	50 %	222083151
23	NC_011984	GCCA	2	8	8772	8779	25 %	0 %	25 %	50 %	222083152
24	NC_011984	CGTT	2	8	9116	9123	0 %	50 %	25 %	25 %	222083152
25	NC_011984	CCGG	2	8	9402	9409	0 %	0 %	50 %	50 %	222083152
26	NC_011984	AGCC	2	8	9413	9420	25 %	0 %	25 %	50 %	222083152
27	NC_011984	GTCG	2	8	9975	9982	0 %	25 %	50 %	25 %	222083153
28	NC_011984	CGGA	2	8	12351	12358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011984	GACA	2	8	12590	12597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011984	CGAA	2	8	12699	12706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011984	GGCA	2	8	13838	13845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011984	TGCT	2	8	14654	14661	0 %	50 %	25 %	25 %	222083158
33	NC_011984	GAAA	2	8	14855	14862	75 %	0 %	25 %	0 %	222083158
34	NC_011984	CGTC	2	8	15054	15061	0 %	25 %	25 %	50 %	222083158
35	NC_011984	AACG	2	8	16123	16130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011984	TTGC	2	8	16411	16418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011984	GATG	2	8	16635	16642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011984	AGCG	2	8	17364	17371	25 %	0 %	50 %	25 %	222083159
39	NC_011984	ATCG	2	8	17645	17652	25 %	25 %	25 %	25 %	222083159
40	NC_011984	GCTA	2	8	17948	17955	25 %	25 %	25 %	25 %	222083159
41	NC_011984	CTCA	2	8	17987	17994	25 %	25 %	0 %	50 %	222083159
42	NC_011984	GCTC	2	8	18328	18335	0 %	25 %	25 %	50 %	222083160
43	NC_011984	CCTG	2	8	18505	18512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011984	GAAT	2	8	18755	18762	50 %	25 %	25 %	0 %	222083161
45	NC_011984	TGGC	2	8	19385	19392	0 %	25 %	50 %	25 %	222083161
46	NC_011984	CCGA	2	8	19862	19869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011984	TGCT	2	8	20860	20867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011984	CGCC	2	8	20961	20968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011984	CATA	2	8	21208	21215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011984	GCGA	2	8	21332	21339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011984	TTGC	2	8	22067	22074	0 %	50 %	25 %	25 %	222083162
52	NC_011984	GTCC	2	8	22919	22926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011984	AGTC	2	8	23207	23214	25 %	25 %	25 %	25 %	222083164
54	NC_011984	CAAT	2	8	23768	23775	50 %	25 %	0 %	25 %	222083164
55	NC_011984	TGCG	2	8	24212	24219	0 %	25 %	50 %	25 %	222083164
56	NC_011984	CGAG	2	8	24561	24568	25 %	0 %	50 %	25 %	222083164
57	NC_011984	CCGT	2	8	25097	25104	0 %	25 %	25 %	50 %	222083165
58	NC_011984	GGTT	2	8	25126	25133	0 %	50 %	50 %	0 %	222083165
59	NC_011984	TGAA	2	8	25306	25313	50 %	25 %	25 %	0 %	222083165
60	NC_011984	TGGA	2	8	25528	25535	25 %	25 %	50 %	0 %	222083166
61	NC_011984	CATC	2	8	26174	26181	25 %	25 %	0 %	50 %	222083167
62	NC_011984	CTTC	2	8	26672	26679	0 %	50 %	0 %	50 %	222083167
63	NC_011984	CGGT	2	8	27439	27446	0 %	25 %	50 %	25 %	222083167
64	NC_011984	AAGC	2	8	27630	27637	50 %	0 %	25 %	25 %	222083167
65	NC_011984	GCCG	2	8	27828	27835	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
66	NC_011984	CGGC	2	8	28011	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
67	NC_011984	TCGA	2	8	28204	28211	25 %	25 %	25 %	25 %	222083167
68	NC_011984	CCGT	2	8	28230	28237	0 %	25 %	25 %	50 %	222083167
69	NC_011984	TGGA	2	8	28710	28717	25 %	25 %	50 %	0 %	222083168
70	NC_011984	GCGA	2	8	28872	28879	25 %	0 %	50 %	25 %	222083168
71	NC_011984	GCCG	2	8	29169	29176	0 %	0 %	50 %	50 %	222083168
72	NC_011984	CAGC	2	8	29229	29236	25 %	0 %	25 %	50 %	222083168
73	NC_011984	CCAT	2	8	31437	31444	25 %	25 %	0 %	50 %	222083171
74	NC_011984	CGGG	2	8	32250	32257	0 %	0 %	75 %	25 %	222083172
75	NC_011984	GGGC	2	8	32777	32784	0 %	0 %	75 %	25 %	222083173
76	NC_011984	TCTG	2	8	33675	33682	0 %	50 %	25 %	25 %	222083174
77	NC_011984	GCAT	2	8	33748	33755	25 %	25 %	25 %	25 %	222083174
78	NC_011984	AAGC	2	8	35628	35635	50 %	0 %	25 %	25 %	222083176
79	NC_011984	CCAG	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	222083176
80	NC_011984	CGAT	2	8	36657	36664	25 %	25 %	25 %	25 %	222083176
81	NC_011984	AGTC	2	8	36861	36868	25 %	25 %	25 %	25 %	222083176
82	NC_011984	CGCC	2	8	37039	37046	0 %	0 %	25 %	75 %	222083177
83	NC_011984	GCTC	2	8	37080	37087	0 %	25 %	25 %	50 %	222083177
84	NC_011984	AACG	2	8	37808	37815	50 %	0 %	25 %	25 %	222083178
85	NC_011984	ATTC	2	8	38441	38448	25 %	50 %	0 %	25 %	222083178
86	NC_011984	TCCT	2	8	39127	39134	0 %	50 %	0 %	50 %	222083178
87	NC_011984	TCCT	2	8	39359	39366	0 %	50 %	0 %	50 %	222083178
88	NC_011984	ATCG	2	8	39403	39410	25 %	25 %	25 %	25 %	222083178
89	NC_011984	ATCG	2	8	39915	39922	25 %	25 %	25 %	25 %	222083179
90	NC_011984	GACG	2	8	40041	40048	25 %	0 %	50 %	25 %	222083179
91	NC_011984	TCGC	2	8	41638	41645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011984	GAAC	2	8	41982	41989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011984	GAGG	2	8	42559	42566	25 %	0 %	75 %	0 %	222083182
94	NC_011984	GCGT	2	8	42638	42645	0 %	25 %	50 %	25 %	222083182
95	NC_011984	CGAC	2	8	42654	42661	25 %	0 %	25 %	50 %	222083182
96	NC_011984	CTGG	2	8	43153	43160	0 %	25 %	50 %	25 %	222083182
97	NC_011984	AGCA	2	8	44587	44594	50 %	0 %	25 %	25 %	222083184
98	NC_011984	CAAA	2	8	44645	44652	75 %	0 %	0 %	25 %	222083184
99	NC_011984	GTTT	2	8	45018	45025	0 %	75 %	25 %	0 %	222083185
100	NC_011984	TTCG	2	8	46432	46439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011984	AGCA	2	8	46612	46619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011984	TTGC	2	8	46754	46761	0 %	50 %	25 %	25 %	222083186
103	NC_011984	TGCC	2	8	48831	48838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011984	CTTC	2	8	48909	48916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011984	CGTA	2	8	49235	49242	25 %	25 %	25 %	25 %	222083190
106	NC_011984	GCAC	2	8	49262	49269	25 %	0 %	25 %	50 %	222083190
107	NC_011984	TGGC	2	8	49655	49662	0 %	25 %	50 %	25 %	222083190
108	NC_011984	GCAG	2	8	49840	49847	25 %	0 %	50 %	25 %	222083190
109	NC_011984	CCCT	2	8	50636	50643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_011984	AGAC	2	8	51185	51192	50 %	0 %	25 %	25 %	222083191
111	NC_011984	ATCA	2	8	51811	51818	50 %	25 %	0 %	25 %	222083191
112	NC_011984	GAAA	2	8	52242	52249	75 %	0 %	25 %	0 %	222083191
113	NC_011984	CAAC	2	8	52317	52324	50 %	0 %	0 %	50 %	222083191
114	NC_011984	GCCA	2	8	52726	52733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011984	CCGA	2	8	53255	53262	25 %	0 %	25 %	50 %	222083192
116	NC_011984	CTTC	2	8	53551	53558	0 %	50 %	0 %	50 %	222083192
117	NC_011984	CGAC	2	8	53793	53800	25 %	0 %	25 %	50 %	222083192
118	NC_011984	TGGC	2	8	53853	53860	0 %	25 %	50 %	25 %	222083192
119	NC_011984	CCTG	2	8	54481	54488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011984	CGAC	2	8	56042	56049	25 %	0 %	25 %	50 %	222083194
121	NC_011984	GTTC	2	8	56396	56403	0 %	50 %	25 %	25 %	222083194
122	NC_011984	TTCC	2	8	56461	56468	0 %	50 %	0 %	50 %	222083194
123	NC_011984	TTGG	2	8	58425	58432	0 %	50 %	50 %	0 %	222083194
124	NC_011984	GTCG	2	8	58756	58763	0 %	25 %	50 %	25 %	222083195
125	NC_011984	CCGT	2	8	59121	59128	0 %	25 %	25 %	50 %	222083195
126	NC_011984	TCTG	2	8	59456	59463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011984	TGGC	2	8	59937	59944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011984	TTAT	2	8	60339	60346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011984	AAGG	2	8	60674	60681	50 %	0 %	50 %	0 %	222083196
130	NC_011984	TCGA	2	8	61706	61713	25 %	25 %	25 %	25 %	222083196
131	NC_011984	AGTC	2	8	61729	61736	25 %	25 %	25 %	25 %	222083196
132	NC_011984	GTCG	2	8	62278	62285	0 %	25 %	50 %	25 %	222083196
133	NC_011984	CGGC	2	8	62367	62374	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
134	NC_011984	GCCG	2	8	62393	62400	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
135	NC_011984	TTGC	2	8	63129	63136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011984	TTGA	2	8	63165	63172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011984	GCGG	2	8	63212	63219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011984	AGCG	2	8	63952	63959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011984	TGCC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011984	ATCA	2	8	64045	64052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011984	TGGT	2	8	64329	64336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011984	CAGA	2	8	64703	64710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011984	ATCC	2	8	64800	64807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011984	GCAT	2	8	65454	65461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011984	GATC	2	8	66041	66048	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011984	ATGC	2	8	66090	66097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011984	CTGC	2	8	66428	66435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011984	TCGC	2	8	66451	66458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011984	ATCA	2	8	66495	66502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_011984	ATCG	2	8	68365	68372	25 %	25 %	25 %	25 %	222083200
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169	NC_011984	GGTT	2	8	76212	76219	0 %	50 %	50 %	0 %	222083208
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180	NC_011984	TGCT	2	8	80614	80621	0 %	50 %	25 %	25 %	222083211
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279	NC_011984	GATA	2	8	120091	120098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011984	CAAT	2	8	120144	120151	50 %	25 %	0 %	25 %	222083242
281	NC_011984	TTGC	2	8	120451	120458	0 %	50 %	25 %	25 %	222083242
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