MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011984	GT	3	6	70	75	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011984	GT	3	6	90	95	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011984	CT	3	6	2407	2412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011984	CA	3	6	6009	6014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011984	AT	3	6	8715	8720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011984	CG	3	6	9874	9879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011984	CG	3	6	13645	13650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011984	CT	3	6	14314	14319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011984	AG	3	6	16296	16301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011984	AC	3	6	19467	19472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011984	CG	3	6	19875	19880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011984	CG	3	6	20421	20426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011984	GA	3	6	20570	20575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011984	GC	3	6	20654	20659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011984	GT	3	6	34202	34207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011984	AG	3	6	39789	39794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011984	CG	3	6	39836	39841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011984	GA	3	6	41716	41721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011984	CA	3	6	41926	41931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011984	GC	4	8	43711	43718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011984	GC	3	6	44742	44747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011984	GC	3	6	46368	46373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011984	GA	3	6	48843	48848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011984	CG	3	6	52811	52816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011984	AG	3	6	54009	54014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011984	TG	3	6	59638	59643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011984	GT	3	6	59920	59925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011984	CG	3	6	60225	60230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011984	GC	3	6	63917	63922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011984	CG	3	6	64159	64164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011984	CT	3	6	64243	64248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011984	GC	3	6	65310	65315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011984	GC	3	6	65433	65438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011984	CG	3	6	65617	65622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011984	GA	3	6	67801	67806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011984	CA	3	6	73937	73942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011984	AT	3	6	77670	77675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011984	TA	3	6	77830	77835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011984	AT	3	6	78418	78423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011984	CA	3	6	79889	79894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011984	CG	3	6	81628	81633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011984	AC	3	6	81671	81676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011984	CG	3	6	88190	88195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011984	GC	3	6	100429	100434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011984	CG	3	6	100556	100561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011984	CG	3	6	100592	100597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011984	TC	3	6	101173	101178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011984	TC	3	6	101290	101295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011984	TC	4	8	102509	102516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011984	GC	3	6	103155	103160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011984	TG	4	8	104047	104054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011984	AT	3	6	109728	109733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011984	CG	3	6	109816	109821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011984	AG	3	6	110943	110948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011984	TC	3	6	111962	111967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011984	TA	3	6	113015	113020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011984	CT	3	6	121433	121438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011984	TC	3	6	124681	124686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011984	CG	3	6	125766	125771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011984	GC	3	6	136360	136365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011984	AG	3	6	137405	137410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011984	CG	3	6	140731	140736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011984	TG	3	6	152613	152618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011984	AG	3	6	160959	160964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011984	CG	3	6	163343	163348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011984	AC	3	6	163508	163513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011984	CT	3	6	163755	163760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011984	CG	3	6	165347	165352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011984	CT	3	6	166140	166145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011984	GA	3	6	172284	172289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011984	CG	3	6	181512	181517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011984	GC	3	6	181589	181594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011984	CG	3	6	182493	182498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011984	CG	3	6	186675	186680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011984	CG	3	6	187348	187353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011984	GC	3	6	191100	191105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011984	TA	3	6	193494	193499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011984	CA	3	6	196516	196521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011984	AG	3	6	197016	197021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011984	TA	3	6	199586	199591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011984	TC	3	6	199757	199762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011984	TG	3	6	199774	199779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.