MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011984	GC	3	6	220	225	0 %	0 %	50 %	50 %	222083146
2	NC_011984	CG	4	8	1214	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	222083146
3	NC_011984	GC	3	6	1735	1740	0 %	0 %	50 %	50 %	222083147
4	NC_011984	AG	3	6	3167	3172	50 %	0 %	50 %	0 %	222083148
5	NC_011984	CG	3	6	4115	4120	0 %	0 %	50 %	50 %	222083149
6	NC_011984	CG	3	6	4385	4390	0 %	0 %	50 %	50 %	222083149
7	NC_011984	TC	3	6	4487	4492	0 %	50 %	0 %	50 %	222083149
8	NC_011984	CG	3	6	7716	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	222083151
9	NC_011984	GA	3	6	8571	8576	50 %	0 %	50 %	0 %	222083151
10	NC_011984	CG	3	6	10030	10035	0 %	0 %	50 %	50 %	222083153
11	NC_011984	CG	3	6	10124	10129	0 %	0 %	50 %	50 %	222083153
12	NC_011984	GC	3	6	10232	10237	0 %	0 %	50 %	50 %	222083153
13	NC_011984	GA	3	6	11373	11378	50 %	0 %	50 %	0 %	222083156
14	NC_011984	GA	3	6	11426	11431	50 %	0 %	50 %	0 %	222083156
15	NC_011984	AC	3	6	11654	11659	50 %	0 %	0 %	50 %	222083156
16	NC_011984	GT	4	8	11763	11770	0 %	50 %	50 %	0 %	222083156
17	NC_011984	CG	3	6	14838	14843	0 %	0 %	50 %	50 %	222083158
18	NC_011984	GC	3	6	17447	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	222083159
19	NC_011984	CG	3	6	19233	19238	0 %	0 %	50 %	50 %	222083161
20	NC_011984	GC	3	6	23184	23189	0 %	0 %	50 %	50 %	222083164
21	NC_011984	TC	3	6	23895	23900	0 %	50 %	0 %	50 %	222083164
22	NC_011984	CA	3	6	23944	23949	50 %	0 %	0 %	50 %	222083164
23	NC_011984	CG	3	6	24026	24031	0 %	0 %	50 %	50 %	222083164
24	NC_011984	GC	3	6	24513	24518	0 %	0 %	50 %	50 %	222083164
25	NC_011984	AG	3	6	25164	25169	50 %	0 %	50 %	0 %	222083165
26	NC_011984	GA	3	6	25476	25481	50 %	0 %	50 %	0 %	222083166
27	NC_011984	GC	3	6	25828	25833	0 %	0 %	50 %	50 %	222083166
28	NC_011984	CG	3	6	25991	25996	0 %	0 %	50 %	50 %	222083166
29	NC_011984	GC	3	6	26452	26457	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
30	NC_011984	TC	3	6	27188	27193	0 %	50 %	0 %	50 %	222083167
31	NC_011984	CG	3	6	27612	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
32	NC_011984	AG	4	8	27933	27940	50 %	0 %	50 %	0 %	222083167
33	NC_011984	GC	3	6	28165	28170	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
34	NC_011984	GC	3	6	29060	29065	0 %	0 %	50 %	50 %	222083168
35	NC_011984	GA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	50 %	0 %	222083168
36	NC_011984	GC	3	6	29632	29637	0 %	0 %	50 %	50 %	222083169
37	NC_011984	CG	3	6	30944	30949	0 %	0 %	50 %	50 %	222083170
38	NC_011984	CG	3	6	31055	31060	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
39	NC_011984	CG	3	6	31332	31337	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
40	NC_011984	GC	3	6	31365	31370	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
41	NC_011984	CG	3	6	32365	32370	0 %	0 %	50 %	50 %	222083172
42	NC_011984	GC	3	6	33314	33319	0 %	0 %	50 %	50 %	222083174
43	NC_011984	CG	3	6	35693	35698	0 %	0 %	50 %	50 %	222083176
44	NC_011984	GC	3	6	36513	36518	0 %	0 %	50 %	50 %	222083176
45	NC_011984	GC	3	6	36611	36616	0 %	0 %	50 %	50 %	222083176
46	NC_011984	TC	3	6	36831	36836	0 %	50 %	0 %	50 %	222083176
47	NC_011984	GC	3	6	37700	37705	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
48	NC_011984	GC	4	8	37767	37774	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
49	NC_011984	GC	3	6	38624	38629	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
50	NC_011984	GT	3	6	39419	39424	0 %	50 %	50 %	0 %	222083178
51	NC_011984	TC	3	6	40287	40292	0 %	50 %	0 %	50 %	222083179
52	NC_011984	TC	3	6	40340	40345	0 %	50 %	0 %	50 %	222083179
53	NC_011984	CG	4	8	42298	42305	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
54	NC_011984	GC	3	6	42497	42502	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
55	NC_011984	GC	3	6	42873	42878	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
56	NC_011984	CG	3	6	42991	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
57	NC_011984	GA	3	6	48646	48651	50 %	0 %	50 %	0 %	222083189
58	NC_011984	CG	3	6	48667	48672	0 %	0 %	50 %	50 %	222083189
59	NC_011984	CT	4	8	50692	50699	0 %	50 %	0 %	50 %	222083191
60	NC_011984	CG	3	6	50766	50771	0 %	0 %	50 %	50 %	222083191
61	NC_011984	GC	3	6	50985	50990	0 %	0 %	50 %	50 %	222083191
62	NC_011984	CG	3	6	51294	51299	0 %	0 %	50 %	50 %	222083191
63	NC_011984	CG	3	6	52096	52101	0 %	0 %	50 %	50 %	222083191
64	NC_011984	CT	3	6	53576	53581	0 %	50 %	0 %	50 %	222083192
65	NC_011984	CG	3	6	57375	57380	0 %	0 %	50 %	50 %	222083194
66	NC_011984	GA	3	6	58115	58120	50 %	0 %	50 %	0 %	222083194
67	NC_011984	GA	3	6	58654	58659	50 %	0 %	50 %	0 %	222083195
68	NC_011984	CG	3	6	58889	58894	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
69	NC_011984	CG	3	6	58906	58911	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
70	NC_011984	GC	3	6	59290	59295	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
71	NC_011984	CA	3	6	60371	60376	50 %	0 %	0 %	50 %	222083196
72	NC_011984	CG	3	6	61400	61405	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
73	NC_011984	GC	3	6	61436	61441	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
74	NC_011984	GC	3	6	61636	61641	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
75	NC_011984	CG	3	6	62268	62273	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
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80	NC_011984	CG	3	6	69183	69188	0 %	0 %	50 %	50 %	222083201
81	NC_011984	GC	3	6	69614	69619	0 %	0 %	50 %	50 %	222083201
82	NC_011984	CG	3	6	69803	69808	0 %	0 %	50 %	50 %	222083202
83	NC_011984	CG	3	6	70363	70368	0 %	0 %	50 %	50 %	222083202
84	NC_011984	GA	3	6	71153	71158	50 %	0 %	50 %	0 %	222083203
85	NC_011984	GC	3	6	71802	71807	0 %	0 %	50 %	50 %	222083203
86	NC_011984	AG	3	6	74250	74255	50 %	0 %	50 %	0 %	222083204
87	NC_011984	CG	3	6	74354	74359	0 %	0 %	50 %	50 %	222083204
88	NC_011984	CG	3	6	74684	74689	0 %	0 %	50 %	50 %	222083205
89	NC_011984	GA	3	6	75457	75462	50 %	0 %	50 %	0 %	222083206
90	NC_011984	CG	3	6	75530	75535	0 %	0 %	50 %	50 %	222083206
91	NC_011984	GC	3	6	76530	76535	0 %	0 %	50 %	50 %	222083208
92	NC_011984	CG	3	6	76567	76572	0 %	0 %	50 %	50 %	222083208
93	NC_011984	GC	3	6	79950	79955	0 %	0 %	50 %	50 %	222083211
94	NC_011984	GC	3	6	80249	80254	0 %	0 %	50 %	50 %	222083211
95	NC_011984	GA	3	6	81169	81174	50 %	0 %	50 %	0 %	222083212
96	NC_011984	CG	3	6	81317	81322	0 %	0 %	50 %	50 %	222083212
97	NC_011984	GC	3	6	81397	81402	0 %	0 %	50 %	50 %	222083212
98	NC_011984	GA	3	6	83457	83462	50 %	0 %	50 %	0 %	222083214
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101	NC_011984	CG	4	8	83749	83756	0 %	0 %	50 %	50 %	222083214
102	NC_011984	CG	3	6	86772	86777	0 %	0 %	50 %	50 %	222083216
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106	NC_011984	CG	3	6	90439	90444	0 %	0 %	50 %	50 %	222083220
107	NC_011984	CG	3	6	91200	91205	0 %	0 %	50 %	50 %	222083221
108	NC_011984	CG	3	6	92629	92634	0 %	0 %	50 %	50 %	222083222
109	NC_011984	TG	3	6	93897	93902	0 %	50 %	50 %	0 %	222083223
110	NC_011984	TC	3	6	94584	94589	0 %	50 %	0 %	50 %	222083223
111	NC_011984	GC	3	6	95084	95089	0 %	0 %	50 %	50 %	222083223
112	NC_011984	GC	3	6	95492	95497	0 %	0 %	50 %	50 %	222083223
113	NC_011984	CA	3	6	95519	95524	50 %	0 %	0 %	50 %	222083223
114	NC_011984	GC	3	6	96059	96064	0 %	0 %	50 %	50 %	222083224
115	NC_011984	GC	3	6	96352	96357	0 %	0 %	50 %	50 %	222083224
116	NC_011984	GC	3	6	96806	96811	0 %	0 %	50 %	50 %	222083224
117	NC_011984	GC	3	6	97192	97197	0 %	0 %	50 %	50 %	222083224
118	NC_011984	GC	3	6	97732	97737	0 %	0 %	50 %	50 %	222083224
119	NC_011984	GC	3	6	98260	98265	0 %	0 %	50 %	50 %	222083225
120	NC_011984	GC	3	6	98294	98299	0 %	0 %	50 %	50 %	222083225
121	NC_011984	CG	3	6	100249	100254	0 %	0 %	50 %	50 %	222083226
122	NC_011984	GC	3	6	101443	101448	0 %	0 %	50 %	50 %	222083228
123	NC_011984	TC	3	6	102624	102629	0 %	50 %	0 %	50 %	222083229
124	NC_011984	CG	3	6	102784	102789	0 %	0 %	50 %	50 %	222083229
125	NC_011984	AC	3	6	105705	105710	50 %	0 %	0 %	50 %	222083231
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128	NC_011984	AC	3	6	107285	107290	50 %	0 %	0 %	50 %	222083232
129	NC_011984	GC	3	6	110471	110476	0 %	0 %	50 %	50 %	222083234
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280	NC_011984	CG	3	6	211287	211292	0 %	0 %	50 %	50 %	222083323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.