MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011984	A	7	7	2995	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	222083148
2	NC_011984	T	6	6	7430	7435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011984	A	6	6	12654	12659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011984	T	6	6	12787	12792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011984	T	7	7	13932	13938	0 %	100 %	0 %	0 %	222083157
6	NC_011984	A	7	7	15092	15098	100 %	0 %	0 %	0 %	222083158
7	NC_011984	A	6	6	18834	18839	100 %	0 %	0 %	0 %	222083161
8	NC_011984	A	6	6	21738	21743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011984	C	6	6	26725	26730	0 %	0 %	0 %	100 %	222083167
10	NC_011984	A	6	6	30024	30029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011984	A	6	6	33016	33021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011984	G	6	6	35521	35526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011984	A	8	8	35565	35572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011984	A	6	6	52566	52571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011984	G	6	6	53710	53715	0 %	0 %	100 %	0 %	222083192
16	NC_011984	A	7	7	54390	54396	100 %	0 %	0 %	0 %	222083193
17	NC_011984	T	6	6	58877	58882	0 %	100 %	0 %	0 %	222083195
18	NC_011984	T	6	6	62982	62987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011984	T	6	6	65626	65631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011984	T	6	6	74806	74811	0 %	100 %	0 %	0 %	222083205
21	NC_011984	T	6	6	76684	76689	0 %	100 %	0 %	0 %	222083208
22	NC_011984	G	6	6	77378	77383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011984	T	6	6	80846	80851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011984	A	6	6	86614	86619	100 %	0 %	0 %	0 %	222083216
25	NC_011984	A	6	6	88680	88685	100 %	0 %	0 %	0 %	222083218
26	NC_011984	T	6	6	89501	89506	0 %	100 %	0 %	0 %	222083219
27	NC_011984	A	6	6	91622	91627	100 %	0 %	0 %	0 %	222083221
28	NC_011984	A	6	6	93697	93702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011984	T	6	6	105122	105127	0 %	100 %	0 %	0 %	222083230
30	NC_011984	T	6	6	105157	105162	0 %	100 %	0 %	0 %	222083230
31	NC_011984	A	6	6	110863	110868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011984	C	6	6	115979	115984	0 %	0 %	0 %	100 %	222083238
33	NC_011984	G	6	6	116542	116547	0 %	0 %	100 %	0 %	222083238
34	NC_011984	A	7	7	122624	122630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011984	A	8	8	131893	131900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011984	T	6	6	144789	144794	0 %	100 %	0 %	0 %	222083265
37	NC_011984	A	6	6	147794	147799	100 %	0 %	0 %	0 %	222083267
38	NC_011984	T	6	6	151718	151723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011984	T	6	6	152477	152482	0 %	100 %	0 %	0 %	222083272
40	NC_011984	C	6	6	155342	155347	0 %	0 %	0 %	100 %	222083275
41	NC_011984	T	6	6	156939	156944	0 %	100 %	0 %	0 %	222083277
42	NC_011984	T	6	6	158150	158155	0 %	100 %	0 %	0 %	222083278
43	NC_011984	G	7	7	158502	158508	0 %	0 %	100 %	0 %	222083278
44	NC_011984	T	6	6	158890	158895	0 %	100 %	0 %	0 %	222083278
45	NC_011984	T	6	6	159273	159278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011984	A	6	6	163572	163577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011984	C	6	6	168931	168936	0 %	0 %	0 %	100 %	222083285
48	NC_011984	C	6	6	173582	173587	0 %	0 %	0 %	100 %	222083287
49	NC_011984	A	6	6	176255	176260	100 %	0 %	0 %	0 %	222083290
50	NC_011984	C	7	7	178158	178164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_011984	T	6	6	178738	178743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011984	G	6	6	183513	183518	0 %	0 %	100 %	0 %	222083296
53	NC_011984	A	7	7	188165	188171	100 %	0 %	0 %	0 %	222083299
54	NC_011984	C	6	6	189469	189474	0 %	0 %	0 %	100 %	222083300
55	NC_011984	T	6	6	191215	191220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011984	T	7	7	191265	191271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011984	T	7	7	193606	193612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011984	A	6	6	193667	193672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011984	A	7	7	193678	193684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011984	T	6	6	199934	199939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011984	C	6	6	204624	204629	0 %	0 %	0 %	100 %	222083316

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.