MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011983	GTAATA	2	12	116913	116924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011983	AATGCA	2	12	139680	139691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011983	GCATCG	2	12	141841	141852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011983	TTTTCA	2	12	153505	153516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011983	TGCATG	2	12	154111	154122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011983	CCGGCT	2	12	162015	162026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011983	TCAAGA	2	12	167978	167989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011983	GCGCTC	2	12	175217	175228	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011983	GAAGGT	2	12	195105	195116	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011983	CAGTTC	2	12	289739	289750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011983	TGCCCG	2	12	359702	359713	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011983	ATTTCC	2	12	386770	386781	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011983	ACGGCG	2	12	404126	404137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011983	GGTCTC	2	12	468559	468570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011983	GTGTCG	2	12	474389	474400	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011983	CGCTCT	2	12	474498	474509	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011983	GGCGGG	2	12	487487	487498	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011983	GCAGGC	2	12	513446	513457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011983	TCTCCG	2	12	588017	588028	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011983	CATAGG	2	12	605662	605673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011983	AGTTTT	2	12	615978	615989	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011983	TCAGGA	2	12	668388	668399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011983	TCGCAG	2	12	678193	678204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011983	GCCACA	2	12	708756	708767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011983	GGTCCC	2	12	709008	709019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011983	GAAATT	2	12	731898	731909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011983	ATGATT	2	12	796055	796066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011983	CGATGC	2	12	828496	828507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011983	TGGTTC	2	12	903100	903111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011983	GCAATC	2	12	912205	912216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011983	CGTCAC	2	12	925640	925651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011983	CGGCAT	2	12	925693	925704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011983	CCTTGT	2	12	985242	985253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011983	GGTCGA	2	12	985260	985271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011983	CTTGAT	2	12	997217	997228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011983	GCCGGC	2	12	997672	997683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011983	CCTGCG	2	12	1060829	1060840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011983	AGCCCC	2	12	1085540	1085551	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011983	AGGCGC	2	12	1087587	1087598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011983	CGGCCG	2	12	1106822	1106833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011983	TTTCCG	2	12	1182955	1182966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011983	ATTTTA	2	12	1217066	1217077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011983	GTTTTT	2	12	1222279	1222290	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011983	GCCGAA	2	12	1272270	1272281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011983	TCGTTC	2	12	1285097	1285108	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011983	CATGGG	2	12	1288712	1288723	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011983	ATTTTG	2	12	1304905	1304916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011983	GCGCCT	2	12	1328141	1328152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011983	CTTCGA	2	12	1344347	1344358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011983	TTCGCG	2	12	1438413	1438424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011983	TAATAT	2	12	1460890	1460901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011983	AGATGG	2	12	1506267	1506278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011983	GTTCCG	2	12	1519335	1519346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011983	TGGATA	2	12	1538825	1538836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011983	TCCGGC	2	12	1594065	1594076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011983	GACAGC	2	12	1618171	1618182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011983	CCGACA	2	12	1637108	1637119	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011983	AATGGC	2	12	1790520	1790531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011983	ACCTCC	2	12	1867156	1867167	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011983	CAGGGC	2	12	1914500	1914511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011983	GGCGCG	2	12	1947250	1947261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011983	ACAAAT	2	12	2064550	2064561	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011983	TATTCA	2	12	2078051	2078062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011983	CGATTC	2	12	2179438	2179449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011983	TGGGAT	2	12	2232758	2232769	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011983	CCTTCG	2	12	2318600	2318611	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011983	CGCCAG	2	12	2370116	2370127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011983	CCTTGT	2	12	2375530	2375541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011983	CTCGAC	2	12	2383022	2383033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011983	GAGAAG	2	12	2449420	2449431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011983	AATGAA	2	12	2456116	2456127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011983	CTCTGC	2	12	2456400	2456411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011983	AAACCG	2	12	2497140	2497151	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011983	TCAGCC	2	12	2522268	2522279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011983	GGATCA	2	12	2620031	2620042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011983	GCGCGA	2	12	2646812	2646823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011983	GGCATT	2	12	2649356	2649367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.