MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 38180

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_011983	AAC	2	6	2637088	2637093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080809
38002	NC_011983	CGA	2	6	2637101	2637106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080809
38003	NC_011983	CAG	2	6	2637261	2637266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080810
38004	NC_011983	GTT	2	6	2637278	2637283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080810
38005	NC_011983	CCG	2	6	2637409	2637414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080810
38006	NC_011983	CTT	2	6	2637578	2637583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080810
38007	NC_011983	GCG	2	6	2637607	2637612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080810
38008	NC_011983	TCG	2	6	2637622	2637627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080810
38009	NC_011983	TGC	2	6	2637679	2637684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080810
38010	NC_011983	CAA	2	6	2637710	2637715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080810
38011	NC_011983	CGC	2	6	2637978	2637983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38012	NC_011983	CAT	2	6	2638074	2638079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080811
38013	NC_011983	ACA	2	6	2638100	2638105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080811
38014	NC_011983	GCC	2	6	2638108	2638113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38015	NC_011983	GCG	2	6	2638154	2638159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38016	NC_011983	CTG	2	6	2638183	2638188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38017	NC_011983	CGA	2	6	2638197	2638202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38018	NC_011983	GGC	4	12	2638258	2638269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38019	NC_011983	TCG	2	6	2638379	2638384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38020	NC_011983	GAG	2	6	2638492	2638497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38021	NC_011983	CGC	3	9	2638542	2638550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38022	NC_011983	TCG	2	6	2638700	2638705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38023	NC_011983	GAT	2	6	2638710	2638715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080811
38024	NC_011983	GGA	2	6	2638731	2638736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38025	NC_011983	GCC	2	6	2638774	2638779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38026	NC_011983	GCT	2	6	2638836	2638841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38027	NC_011983	CGC	2	6	2639046	2639051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38028	NC_011983	CGA	2	6	2639081	2639086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38029	NC_011983	GTC	2	6	2639119	2639124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38030	NC_011983	CGA	2	6	2639262	2639267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38031	NC_011983	TTC	2	6	2639311	2639316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080811
38032	NC_011983	CGG	2	6	2639532	2639537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38033	NC_011983	GGA	2	6	2639691	2639696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38034	NC_011983	GGC	2	6	2639800	2639805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38035	NC_011983	CGG	2	6	2639913	2639918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38036	NC_011983	CGG	2	6	2639930	2639935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38037	NC_011983	CGA	2	6	2639946	2639951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38038	NC_011983	ATC	2	6	2640073	2640078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080811
38039	NC_011983	AGC	2	6	2640082	2640087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38040	NC_011983	CGC	2	6	2640115	2640120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38041	NC_011983	CTG	2	6	2640136	2640141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38042	NC_011983	AGG	2	6	2640212	2640217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38043	NC_011983	CCG	2	6	2640340	2640345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38044	NC_011983	CCG	2	6	2640486	2640491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38045	NC_011983	CGA	2	6	2640507	2640512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38046	NC_011983	CGT	2	6	2640528	2640533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38047	NC_011983	GAC	2	6	2640624	2640629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38048	NC_011983	CGG	2	6	2640678	2640683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38049	NC_011983	CGG	2	6	2640717	2640722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38050	NC_011983	GCT	2	6	2640801	2640806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38051	NC_011983	TTC	2	6	2640811	2640816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080811
38052	NC_011983	CTT	2	6	2640828	2640833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080811
38053	NC_011983	GCC	2	6	2640868	2640873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38054	NC_011983	GGC	2	6	2640883	2640888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080811
38055	NC_011983	GAG	2	6	2640904	2640909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38056	NC_011983	GCC	2	6	2640946	2640951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38057	NC_011983	TCG	3	9	2641043	2641051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38058	NC_011983	GCT	2	6	2641094	2641099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38059	NC_011983	TCG	2	6	2641142	2641147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38060	NC_011983	CAT	2	6	2641185	2641190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080811
38061	NC_011983	GCC	2	6	2641228	2641233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080811
38062	NC_011983	TCG	2	6	2641292	2641297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080811
38063	NC_011983	GGA	2	6	2641302	2641307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080811
38064	NC_011983	GAG	2	6	2641389	2641394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080812
38065	NC_011983	ATC	2	6	2641398	2641403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080812
38066	NC_011983	CGC	2	6	2641404	2641409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080812
38067	NC_011983	CGA	2	6	2641418	2641423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38068	NC_011983	TCA	2	6	2641435	2641440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080812
38069	NC_011983	GAC	2	6	2641452	2641457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38070	NC_011983	GGT	2	6	2641622	2641627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080812
38071	NC_011983	CGC	2	6	2641711	2641716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080812
38072	NC_011983	GGC	2	6	2641758	2641763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38073	NC_011983	CGG	2	6	2641849	2641854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38074	NC_011983	CAA	2	6	2641859	2641864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080812
38075	NC_011983	TCG	2	6	2641867	2641872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38076	NC_011983	CGT	2	6	2641910	2641915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38077	NC_011983	TCA	2	6	2641939	2641944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080812
38078	NC_011983	GGC	2	6	2642030	2642035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38079	NC_011983	TTC	2	6	2642097	2642102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080812
38080	NC_011983	ATG	2	6	2642128	2642133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080812
38081	NC_011983	CCA	2	6	2642164	2642169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080812
38082	NC_011983	GGC	2	6	2642246	2642251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38083	NC_011983	CAT	2	6	2642306	2642311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080812
38084	NC_011983	ATG	2	6	2642329	2642334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080812
38085	NC_011983	AGA	2	6	2642380	2642385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080812
38086	NC_011983	TGC	2	6	2642419	2642424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38087	NC_011983	ACC	2	6	2642436	2642441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080812
38088	NC_011983	GAG	2	6	2642451	2642456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080812
38089	NC_011983	GAA	2	6	2642477	2642482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080812
38090	NC_011983	CGA	2	6	2642609	2642614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38091	NC_011983	GTC	2	6	2642742	2642747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38092	NC_011983	CTT	2	6	2642788	2642793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080812
38093	NC_011983	CGG	2	6	2642795	2642800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38094	NC_011983	CGG	2	6	2642824	2642829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38095	NC_011983	TGC	2	6	2642881	2642886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080812
38096	NC_011983	CGG	2	6	2642903	2642908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38097	NC_011983	CGC	2	6	2643047	2643052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080812
38098	NC_011983	CGG	2	6	2643080	2643085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38099	NC_011983	GGC	2	6	2643088	2643093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080812
38100	NC_011983	TCA	2	6	2643424	2643429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080813
38101	NC_011983	CGC	2	6	2643448	2643453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080813
38102	NC_011983	CCG	2	6	2643629	2643634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080813
38103	NC_011983	GGA	2	6	2643649	2643654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080813
38104	NC_011983	GGA	2	6	2643755	2643760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080813
38105	NC_011983	CCG	2	6	2643771	2643776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080813
38106	NC_011983	GTG	2	6	2644059	2644064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080813
38107	NC_011983	TCG	2	6	2644083	2644088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080813
38108	NC_011983	TTG	2	6	2644098	2644103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080813
38109	NC_011983	GCC	2	6	2644157	2644162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080813
38110	NC_011983	CCG	2	6	2644183	2644188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080813
38111	NC_011983	CGG	2	6	2644252	2644257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080813
38112	NC_011983	CAT	2	6	2644283	2644288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080813
38113	NC_011983	CAA	2	6	2644627	2644632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080814
38114	NC_011983	CGA	2	6	2644650	2644655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080814
38115	NC_011983	GTC	2	6	2644787	2644792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080814
38116	NC_011983	GTC	2	6	2644877	2644882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080814
38117	NC_011983	CCG	2	6	2644889	2644894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080814
38118	NC_011983	CCG	2	6	2645048	2645053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080815
38119	NC_011983	GCT	2	6	2645093	2645098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080815
38120	NC_011983	AAG	2	6	2645245	2645250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080815
38121	NC_011983	GAT	2	6	2645302	2645307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080815
38122	NC_011983	AGG	2	6	2645383	2645388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080815
38123	NC_011983	CCG	2	6	2645460	2645465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080815
38124	NC_011983	GGC	2	6	2645568	2645573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080816
38125	NC_011983	GAT	2	6	2645578	2645583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080816
38126	NC_011983	CGT	2	6	2645759	2645764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080816
38127	NC_011983	CCA	2	6	2645851	2645856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080816
38128	NC_011983	TTC	2	6	2645910	2645915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080816
38129	NC_011983	GTA	2	6	2646047	2646052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080816
38130	NC_011983	CGT	2	6	2646062	2646067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080816
38131	NC_011983	CCG	2	6	2646093	2646098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080816
38132	NC_011983	CAA	2	6	2646163	2646168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080816
38133	NC_011983	GCC	2	6	2646251	2646256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080816
38134	NC_011983	CGG	2	6	2646422	2646427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080816
38135	NC_011983	GCG	2	6	2646460	2646465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080816
38136	NC_011983	GAC	2	6	2646476	2646481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080816
38137	NC_011983	GCC	2	6	2646873	2646878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080817
38138	NC_011983	GGC	2	6	2646887	2646892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080817
38139	NC_011983	CGC	2	6	2646911	2646916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080817
38140	NC_011983	GCC	2	6	2647087	2647092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080817
38141	NC_011983	ACG	2	6	2647129	2647134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080817
38142	NC_011983	TTC	2	6	2647246	2647251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080817
38143	NC_011983	CGA	2	6	2647294	2647299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080817
38144	NC_011983	GTC	2	6	2647334	2647339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080817
38145	NC_011983	GCG	2	6	2647340	2647345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080817
38146	NC_011983	ACA	2	6	2647535	2647540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080817
38147	NC_011983	ACT	2	6	2647807	2647812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080818
38148	NC_011983	AAT	2	6	2647843	2647848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080818
38149	NC_011983	CGT	2	6	2647986	2647991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080818
38150	NC_011983	GCC	2	6	2648053	2648058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080818
38151	NC_011983	ATT	2	6	2648073	2648078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080818
38152	NC_011983	CTT	2	6	2648124	2648129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080818
38153	NC_011983	CTT	2	6	2648241	2648246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080818
38154	NC_011983	GCT	2	6	2648284	2648289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080818
38155	NC_011983	GAT	2	6	2649418	2649423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080819
38156	NC_011983	GCG	2	6	2649441	2649446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38157	NC_011983	CCT	2	6	2649447	2649452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080819
38158	NC_011983	GCC	2	6	2649472	2649477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080819
38159	NC_011983	ATC	2	6	2649482	2649487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080819
38160	NC_011983	GCG	2	6	2649540	2649545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38161	NC_011983	ATC	2	6	2649619	2649624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080819
38162	NC_011983	GCG	2	6	2649710	2649715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38163	NC_011983	CCT	2	6	2649807	2649812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080819
38164	NC_011983	ATA	2	6	2649832	2649837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080819
38165	NC_011983	ACC	2	6	2649843	2649848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080819
38166	NC_011983	CGG	2	6	2649865	2649870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38167	NC_011983	TTG	2	6	2649881	2649886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080819
38168	NC_011983	GCC	2	6	2649953	2649958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080819
38169	NC_011983	GCC	2	6	2649991	2649996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080819
38170	NC_011983	TGC	2	6	2650061	2650066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080819
38171	NC_011983	AGC	2	6	2650154	2650159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080819
38172	NC_011983	CGA	2	6	2650170	2650175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080819
38173	NC_011983	CGG	2	6	2650227	2650232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38174	NC_011983	ACG	2	6	2650293	2650298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080819
38175	NC_011983	CCG	2	6	2650317	2650322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080819
38176	NC_011983	GCG	2	6	2650391	2650396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38177	NC_011983	GCG	3	9	2650408	2650416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080819
38178	NC_011983	AGA	2	6	2650662	2650667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080820
38179	NC_011983	GAG	2	6	2650702	2650707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080820
38180	NC_011983	GCC	2	6	2650753	2650758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080820

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.