MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 5138

< Previous1234567891011Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011983	TA	3	6	2578487	2578492	50 %	50 %	0 %	0 %	222083122
5002	NC_011983	GC	3	6	2579306	2579311	0 %	0 %	50 %	50 %	222083123
5003	NC_011983	CG	3	6	2580652	2580657	0 %	0 %	50 %	50 %	222083124
5004	NC_011983	CT	3	6	2581288	2581293	0 %	50 %	0 %	50 %	222083124
5005	NC_011983	AC	3	6	2581351	2581356	50 %	0 %	0 %	50 %	222083124
5006	NC_011983	AT	3	6	2581614	2581619	50 %	50 %	0 %	0 %	222083124
5007	NC_011983	AC	3	6	2582373	2582378	50 %	0 %	0 %	50 %	222083125
5008	NC_011983	GC	3	6	2584279	2584284	0 %	0 %	50 %	50 %	222083125
5009	NC_011983	TC	3	6	2585184	2585189	0 %	50 %	0 %	50 %	222083126
5010	NC_011983	GC	3	6	2585325	2585330	0 %	0 %	50 %	50 %	222083126
5011	NC_011983	GT	3	6	2585478	2585483	0 %	50 %	50 %	0 %	222083126
5012	NC_011983	CT	3	6	2585609	2585614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_011983	GA	3	6	2585663	2585668	50 %	0 %	50 %	0 %	222083127
5014	NC_011983	GC	3	6	2585911	2585916	0 %	0 %	50 %	50 %	222083127
5015	NC_011983	AG	3	6	2586416	2586421	50 %	0 %	50 %	0 %	222083127
5016	NC_011983	CG	3	6	2586542	2586547	0 %	0 %	50 %	50 %	222083127
5017	NC_011983	CT	3	6	2586989	2586994	0 %	50 %	0 %	50 %	222083127
5018	NC_011983	GC	3	6	2587625	2587630	0 %	0 %	50 %	50 %	222083127
5019	NC_011983	CG	3	6	2587662	2587667	0 %	0 %	50 %	50 %	222083127
5020	NC_011983	GC	4	8	2587721	2587728	0 %	0 %	50 %	50 %	222083127
5021	NC_011983	CG	3	6	2588221	2588226	0 %	0 %	50 %	50 %	222083128
5022	NC_011983	TC	3	6	2588425	2588430	0 %	50 %	0 %	50 %	222083128
5023	NC_011983	CG	3	6	2588582	2588587	0 %	0 %	50 %	50 %	222083128
5024	NC_011983	GA	3	6	2589203	2589208	50 %	0 %	50 %	0 %	222083128
5025	NC_011983	CG	3	6	2589717	2589722	0 %	0 %	50 %	50 %	222083128
5026	NC_011983	CG	3	6	2591223	2591228	0 %	0 %	50 %	50 %	222083130
5027	NC_011983	GC	3	6	2593393	2593398	0 %	0 %	50 %	50 %	222083131
5028	NC_011983	AG	3	6	2593875	2593880	50 %	0 %	50 %	0 %	222083132
5029	NC_011983	GC	3	6	2594299	2594304	0 %	0 %	50 %	50 %	222083132
5030	NC_011983	GC	3	6	2595269	2595274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_011983	GC	3	6	2595798	2595803	0 %	0 %	50 %	50 %	222083133
5032	NC_011983	AG	3	6	2597034	2597039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011983	TC	3	6	2597799	2597804	0 %	50 %	0 %	50 %	222083135
5034	NC_011983	AT	3	6	2598036	2598041	50 %	50 %	0 %	0 %	222083135
5035	NC_011983	AG	3	6	2598271	2598276	50 %	0 %	50 %	0 %	222083135
5036	NC_011983	CA	3	6	2599040	2599045	50 %	0 %	0 %	50 %	222083136
5037	NC_011983	GC	3	6	2599300	2599305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_011983	TG	3	6	2600070	2600075	0 %	50 %	50 %	0 %	222083137
5039	NC_011983	CG	3	6	2600672	2600677	0 %	0 %	50 %	50 %	222083137
5040	NC_011983	GC	3	6	2601467	2601472	0 %	0 %	50 %	50 %	222083137
5041	NC_011983	GC	3	6	2601858	2601863	0 %	0 %	50 %	50 %	222083137
5042	NC_011983	CG	3	6	2602628	2602633	0 %	0 %	50 %	50 %	222083138
5043	NC_011983	GC	3	6	2603177	2603182	0 %	0 %	50 %	50 %	222083138
5044	NC_011983	GC	3	6	2603593	2603598	0 %	0 %	50 %	50 %	222083138
5045	NC_011983	CA	3	6	2603739	2603744	50 %	0 %	0 %	50 %	222083138
5046	NC_011983	GC	3	6	2605309	2605314	0 %	0 %	50 %	50 %	222083140
5047	NC_011983	GC	3	6	2605352	2605357	0 %	0 %	50 %	50 %	222083140
5048	NC_011983	GC	3	6	2605609	2605614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_011983	GC	3	6	2606057	2606062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_011983	GC	3	6	2606356	2606361	0 %	0 %	50 %	50 %	222083141
5051	NC_011983	AG	5	10	2606735	2606744	50 %	0 %	50 %	0 %	222083142
5052	NC_011983	GC	3	6	2607532	2607537	0 %	0 %	50 %	50 %	222083143
5053	NC_011983	GA	3	6	2607709	2607714	50 %	0 %	50 %	0 %	222083143
5054	NC_011983	GC	4	8	2607864	2607871	0 %	0 %	50 %	50 %	222083143
5055	NC_011983	GC	3	6	2608168	2608173	0 %	0 %	50 %	50 %	222083143
5056	NC_011983	GC	3	6	2608204	2608209	0 %	0 %	50 %	50 %	222083143
5057	NC_011983	CG	3	6	2608367	2608372	0 %	0 %	50 %	50 %	222083144
5058	NC_011983	GC	4	8	2609873	2609880	0 %	0 %	50 %	50 %	222083144
5059	NC_011983	CG	4	8	2612267	2612274	0 %	0 %	50 %	50 %	222080785
5060	NC_011983	TG	3	6	2613063	2613068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011983	TG	3	6	2613251	2613256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011983	TC	3	6	2613482	2613487	0 %	50 %	0 %	50 %	222080786
5063	NC_011983	CG	3	6	2613489	2613494	0 %	0 %	50 %	50 %	222080786
5064	NC_011983	GC	3	6	2616038	2616043	0 %	0 %	50 %	50 %	222080789
5065	NC_011983	TC	3	6	2616064	2616069	0 %	50 %	0 %	50 %	222080789
5066	NC_011983	GC	3	6	2617202	2617207	0 %	0 %	50 %	50 %	222080790
5067	NC_011983	AC	3	6	2618177	2618182	50 %	0 %	0 %	50 %	222080791
5068	NC_011983	GA	3	6	2618613	2618618	50 %	0 %	50 %	0 %	222080791
5069	NC_011983	CG	3	6	2620053	2620058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_011983	GC	3	6	2620116	2620121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_011983	GA	3	6	2620400	2620405	50 %	0 %	50 %	0 %	222080793
5072	NC_011983	GC	3	6	2620408	2620413	0 %	0 %	50 %	50 %	222080793
5073	NC_011983	GC	3	6	2620476	2620481	0 %	0 %	50 %	50 %	222080793
5074	NC_011983	GC	3	6	2620590	2620595	0 %	0 %	50 %	50 %	222080793
5075	NC_011983	GC	3	6	2620844	2620849	0 %	0 %	50 %	50 %	222080793
5076	NC_011983	CG	3	6	2620992	2620997	0 %	0 %	50 %	50 %	222080793
5077	NC_011983	CG	3	6	2621837	2621842	0 %	0 %	50 %	50 %	222080794
5078	NC_011983	TC	3	6	2622506	2622511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_011983	GC	3	6	2623026	2623031	0 %	0 %	50 %	50 %	222080795
5080	NC_011983	GC	3	6	2623865	2623870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_011983	CG	3	6	2624466	2624471	0 %	0 %	50 %	50 %	222080796
5082	NC_011983	CG	3	6	2625041	2625046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_011983	AT	3	6	2625138	2625143	50 %	50 %	0 %	0 %	222080797
5084	NC_011983	CG	3	6	2625369	2625374	0 %	0 %	50 %	50 %	222080797
5085	NC_011983	CT	3	6	2625457	2625462	0 %	50 %	0 %	50 %	222080797
5086	NC_011983	GT	3	6	2625901	2625906	0 %	50 %	50 %	0 %	222080798
5087	NC_011983	GC	3	6	2626414	2626419	0 %	0 %	50 %	50 %	222080798
5088	NC_011983	CG	3	6	2626444	2626449	0 %	0 %	50 %	50 %	222080798
5089	NC_011983	GC	4	8	2626485	2626492	0 %	0 %	50 %	50 %	222080798
5090	NC_011983	GC	3	6	2626972	2626977	0 %	0 %	50 %	50 %	222080799
5091	NC_011983	GA	3	6	2627119	2627124	50 %	0 %	50 %	0 %	222080799
5092	NC_011983	GC	3	6	2627670	2627675	0 %	0 %	50 %	50 %	222080799
5093	NC_011983	CG	3	6	2628157	2628162	0 %	0 %	50 %	50 %	222080800
5094	NC_011983	CT	3	6	2628450	2628455	0 %	50 %	0 %	50 %	222080801
5095	NC_011983	GC	3	6	2628577	2628582	0 %	0 %	50 %	50 %	222080801
5096	NC_011983	CT	3	6	2628750	2628755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_011983	GC	3	6	2629227	2629232	0 %	0 %	50 %	50 %	222080802
5098	NC_011983	CG	3	6	2629797	2629802	0 %	0 %	50 %	50 %	222080802
5099	NC_011983	CT	3	6	2629983	2629988	0 %	50 %	0 %	50 %	222080803
5100	NC_011983	CT	3	6	2630972	2630977	0 %	50 %	0 %	50 %	222080804
5101	NC_011983	GC	3	6	2631288	2631293	0 %	0 %	50 %	50 %	222080804
5102	NC_011983	CG	3	6	2632409	2632414	0 %	0 %	50 %	50 %	222080805
5103	NC_011983	GC	3	6	2634577	2634582	0 %	0 %	50 %	50 %	222080806
5104	NC_011983	GC	3	6	2634685	2634690	0 %	0 %	50 %	50 %	222080807
5105	NC_011983	TC	3	6	2634794	2634799	0 %	50 %	0 %	50 %	222080807
5106	NC_011983	CG	3	6	2635144	2635149	0 %	0 %	50 %	50 %	222080807
5107	NC_011983	TC	3	6	2635346	2635351	0 %	50 %	0 %	50 %	222080807
5108	NC_011983	CG	3	6	2635551	2635556	0 %	0 %	50 %	50 %	222080808
5109	NC_011983	GC	3	6	2635974	2635979	0 %	0 %	50 %	50 %	222080808
5110	NC_011983	CG	4	8	2636335	2636342	0 %	0 %	50 %	50 %	222080809
5111	NC_011983	GC	3	6	2636919	2636924	0 %	0 %	50 %	50 %	222080809
5112	NC_011983	CG	3	6	2637011	2637016	0 %	0 %	50 %	50 %	222080809
5113	NC_011983	GC	3	6	2638144	2638149	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5114	NC_011983	CG	4	8	2638335	2638342	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5115	NC_011983	GC	3	6	2638357	2638362	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5116	NC_011983	CG	4	8	2638528	2638535	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5117	NC_011983	GC	3	6	2638786	2638791	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5118	NC_011983	CG	3	6	2638866	2638871	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5119	NC_011983	GC	3	6	2639451	2639456	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5120	NC_011983	CG	3	6	2639504	2639509	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5121	NC_011983	GC	3	6	2641251	2641256	0 %	0 %	50 %	50 %	222080811
5122	NC_011983	GC	3	6	2641463	2641468	0 %	0 %	50 %	50 %	222080812
5123	NC_011983	GC	3	6	2641720	2641725	0 %	0 %	50 %	50 %	222080812
5124	NC_011983	GC	3	6	2642148	2642153	0 %	0 %	50 %	50 %	222080812
5125	NC_011983	GC	3	6	2643709	2643714	0 %	0 %	50 %	50 %	222080813
5126	NC_011983	GC	3	6	2644240	2644245	0 %	0 %	50 %	50 %	222080813
5127	NC_011983	GC	3	6	2644347	2644352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_011983	CA	3	6	2644528	2644533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_011983	CG	3	6	2645262	2645267	0 %	0 %	50 %	50 %	222080815
5130	NC_011983	GC	3	6	2645958	2645963	0 %	0 %	50 %	50 %	222080816
5131	NC_011983	CT	3	6	2646143	2646148	0 %	50 %	0 %	50 %	222080816
5132	NC_011983	AG	3	6	2646520	2646525	50 %	0 %	50 %	0 %	222080816
5133	NC_011983	CG	3	6	2647306	2647311	0 %	0 %	50 %	50 %	222080817
5134	NC_011983	CA	3	6	2647710	2647715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_011983	AG	3	6	2647795	2647800	50 %	0 %	50 %	0 %	222080818
5136	NC_011983	GC	3	6	2648810	2648815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_011983	CG	3	6	2649248	2649253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5138	NC_011983	GC	3	6	2649973	2649978	0 %	0 %	50 %	50 %	222080819

< Previous1234567891011Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.