MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	TGGCT	2	10	8768	8777	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011982	CCCGG	2	10	8894	8903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011982	TGCAA	2	10	18295	18304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011982	GGAAA	2	10	20998	21007	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011982	ACGCC	2	10	30686	30695	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_011982	GTGAA	2	10	41788	41797	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011982	CAAAC	2	10	42234	42243	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011982	AAAAT	2	10	42675	42684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011982	CGTCG	2	10	66919	66928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011982	TTTCG	2	10	72600	72609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011982	GCCGG	2	10	72796	72805	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011982	GGCAG	2	10	72921	72930	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011982	TTTCC	2	10	75635	75644	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011982	GTCAC	2	10	75974	75983	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011982	CTGTG	2	10	78162	78171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011982	CGTGA	2	10	94815	94824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011982	GCTGC	2	10	104477	104486	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011982	GCGCG	2	10	113398	113407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011982	TAAAA	2	10	125524	125533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011982	GTGAA	2	10	135576	135585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011982	CAAAC	2	10	136022	136031	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011982	GAAAT	2	10	136405	136414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011982	ATATT	2	10	139814	139823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011982	GTTTG	2	10	140623	140632	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011982	TTCAC	2	10	141069	141078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011982	AAAAT	2	10	146612	146621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011982	AGCCT	2	10	157271	157280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011982	GTGAA	2	10	169755	169764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011982	GTGAA	2	10	181164	181173	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011982	CAAGC	2	10	186933	186942	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011982	GCCAG	2	10	197051	197060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011982	CAAGA	2	10	201457	201466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011982	TGAGG	2	10	202645	202654	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011982	CGTTA	2	10	202917	202926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011982	TGTCG	2	10	203669	203678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011982	CTGCG	2	10	203775	203784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011982	ATCTG	2	10	204794	204803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011982	TTCAC	2	10	206755	206764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011982	TTCAA	2	10	209655	209664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011982	AAAGA	2	10	212028	212037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011982	ATTTC	2	10	212484	212493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011982	TGGCG	2	10	212756	212765	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011982	ACGTT	2	10	217562	217571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011982	ATTTT	2	10	218500	218509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011982	AATAT	2	10	222704	222713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.