MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	CT	3	6	2374	2379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011982	TC	3	6	2384	2389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011982	GA	3	6	2478	2483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011982	CG	3	6	3922	3927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011982	TC	4	8	9457	9464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011982	GC	3	6	13792	13797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011982	CT	3	6	18459	18464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011982	CT	3	6	23041	23046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011982	TC	3	6	24184	24189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011982	GC	3	6	24332	24337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011982	GC	3	6	28933	28938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011982	GA	3	6	29081	29086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011982	GA	3	6	31691	31696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011982	GC	3	6	37083	37088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011982	GC	3	6	37791	37796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011982	CG	3	6	38600	38605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011982	GC	3	6	38760	38765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011982	GC	3	6	38940	38945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011982	GC	3	6	39248	39253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011982	GA	3	6	39582	39587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011982	TG	3	6	39677	39682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011982	CG	3	6	40630	40635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011982	CT	3	6	41299	41304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011982	GC	3	6	42515	42520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011982	AG	3	6	47430	47435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011982	TG	3	6	48933	48938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011982	GC	3	6	49684	49689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011982	CT	3	6	51310	51315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011982	AT	3	6	52416	52421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011982	GC	3	6	56694	56699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011982	GC	3	6	66784	66789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011982	GA	3	6	68208	68213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011982	CT	3	6	73245	73250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011982	GC	3	6	76990	76995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011982	GC	3	6	77656	77661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011982	AC	3	6	91576	91581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011982	GC	3	6	91603	91608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011982	GA	3	6	104611	104616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011982	AC	3	6	106463	106468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011982	TC	3	6	110536	110541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011982	GC	3	6	131575	131580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011982	TC	3	6	134761	134766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011982	CG	3	6	134859	134864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011982	GT	3	6	135031	135036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011982	CT	3	6	136235	136240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011982	AT	3	6	136802	136807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011982	GT	3	6	136810	136815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011982	AC	3	6	138087	138092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011982	CA	3	6	138112	138117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011982	GA	3	6	139407	139412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011982	TA	3	6	139824	139829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011982	AT	3	6	140039	140044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011982	GC	3	6	140346	140351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011982	CG	3	6	147041	147046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011982	AT	4	8	157352	157359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011982	CT	3	6	169322	169327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011982	CG	3	6	170206	170211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011982	GC	3	6	173871	173876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011982	CG	3	6	174048	174053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011982	GC	4	8	180231	180238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011982	CG	3	6	181615	181620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011982	GC	3	6	186975	186980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011982	AG	3	6	188542	188547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011982	CT	3	6	190944	190949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011982	AC	3	6	191021	191026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011982	AT	3	6	199730	199735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011982	CT	3	6	201079	201084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011982	TA	3	6	201111	201116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011982	GT	3	6	201138	201143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011982	AC	3	6	201474	201479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011982	AT	3	6	201503	201508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011982	GC	3	6	204778	204783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011982	GA	3	6	204956	204961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011982	GA	3	6	205014	205019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011982	AT	3	6	207179	207184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011982	AT	3	6	207254	207259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011982	AT	3	6	207262	207267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011982	AG	3	6	208034	208039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011982	GA	3	6	211586	211591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011982	GC	3	6	211754	211759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011982	GC	3	6	211822	211827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011982	GC	3	6	212712	212717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011982	AT	3	6	213431	213436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011982	TA	3	6	213524	213529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011982	AT	3	6	217962	217967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011982	GC	3	6	218339	218344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011982	AT	3	6	220489	220494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011982	AT	3	6	221100	221105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011982	GA	3	6	221493	221498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011982	TA	3	6	222410	222415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011982	GT	3	6	222435	222440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011982	AC	3	6	222790	222795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011982	AT	3	6	222819	222824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011982	GA	3	6	222841	222846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011982	GT	3	6	224536	224541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011982	GC	3	6	227569	227574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011982	AC	3	6	227691	227696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011982	GC	3	6	227723	227728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011982	AG	3	6	237835	237840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011982	TG	3	6	246009	246014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011982	GA	3	6	258538	258543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.