MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	T	6	6	21	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011982	A	6	6	346	351	100 %	0 %	0 %	0 %	222080118
3	NC_011982	A	6	6	718	723	100 %	0 %	0 %	0 %	222080118
4	NC_011982	C	6	6	810	815	0 %	0 %	0 %	100 %	222080118
5	NC_011982	T	7	7	1267	1273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011982	T	7	7	3810	3816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011982	A	6	6	4355	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	222080121
8	NC_011982	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	222080122
9	NC_011982	T	7	7	15738	15744	0 %	100 %	0 %	0 %	222080133
10	NC_011982	T	7	7	16749	16755	0 %	100 %	0 %	0 %	222080133
11	NC_011982	A	7	7	19811	19817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011982	A	6	6	24869	24874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011982	T	6	6	28433	28438	0 %	100 %	0 %	0 %	222080140
14	NC_011982	T	8	8	32380	32387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011982	T	7	7	40917	40923	0 %	100 %	0 %	0 %	222080148
16	NC_011982	T	6	6	41577	41582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011982	T	6	6	48063	48068	0 %	100 %	0 %	0 %	222080152
18	NC_011982	A	6	6	49175	49180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011982	A	6	6	52287	52292	100 %	0 %	0 %	0 %	222080156
20	NC_011982	G	6	6	52344	52349	0 %	0 %	100 %	0 %	222080156
21	NC_011982	G	6	6	54532	54537	0 %	0 %	100 %	0 %	222080159
22	NC_011982	C	6	6	64125	64130	0 %	0 %	0 %	100 %	222080163
23	NC_011982	C	7	7	64757	64763	0 %	0 %	0 %	100 %	222080164
24	NC_011982	A	6	6	65604	65609	100 %	0 %	0 %	0 %	222080165
25	NC_011982	A	6	6	66493	66498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011982	T	6	6	68561	68566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011982	G	6	6	72653	72658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011982	A	6	6	73308	73313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011982	T	7	7	83721	83727	0 %	100 %	0 %	0 %	222080182
30	NC_011982	T	6	6	95648	95653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011982	T	6	6	95771	95776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011982	A	6	6	99292	99297	100 %	0 %	0 %	0 %	222080197
33	NC_011982	A	7	7	101091	101097	100 %	0 %	0 %	0 %	222080199
34	NC_011982	A	6	6	104800	104805	100 %	0 %	0 %	0 %	222080202
35	NC_011982	T	6	6	105954	105959	0 %	100 %	0 %	0 %	222080203
36	NC_011982	A	6	6	106471	106476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011982	G	7	7	108619	108625	0 %	0 %	100 %	0 %	222080205
38	NC_011982	G	7	7	108771	108777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011982	A	6	6	109940	109945	100 %	0 %	0 %	0 %	222080206
40	NC_011982	T	7	7	110488	110494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011982	A	7	7	113556	113562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011982	T	6	6	135365	135370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011982	T	7	7	136976	136982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011982	T	6	6	138189	138194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011982	A	7	7	138764	138770	100 %	0 %	0 %	0 %	222080226
46	NC_011982	A	7	7	139840	139846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011982	A	6	6	140018	140023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011982	A	6	6	140096	140101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011982	A	6	6	141284	141289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011982	A	7	7	145054	145060	100 %	0 %	0 %	0 %	222080229
51	NC_011982	T	6	6	145513	145518	0 %	100 %	0 %	0 %	222080230
52	NC_011982	T	6	6	148343	148348	0 %	100 %	0 %	0 %	222080231
53	NC_011982	T	6	6	150124	150129	0 %	100 %	0 %	0 %	222080231
54	NC_011982	C	6	6	154090	154095	0 %	0 %	0 %	100 %	222080233
55	NC_011982	C	6	6	154315	154320	0 %	0 %	0 %	100 %	222080233
56	NC_011982	C	6	6	155616	155621	0 %	0 %	0 %	100 %	222080234
57	NC_011982	A	6	6	158390	158395	100 %	0 %	0 %	0 %	222080237
58	NC_011982	T	6	6	159687	159692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011982	T	6	6	161015	161020	0 %	100 %	0 %	0 %	222080240
60	NC_011982	G	6	6	163174	163179	0 %	0 %	100 %	0 %	222080242
61	NC_011982	T	7	7	165195	165201	0 %	100 %	0 %	0 %	222080244
62	NC_011982	C	6	6	166377	166382	0 %	0 %	0 %	100 %	222080245
63	NC_011982	A	7	7	166422	166428	100 %	0 %	0 %	0 %	222080245
64	NC_011982	T	7	7	167274	167280	0 %	100 %	0 %	0 %	222080245
65	NC_011982	T	6	6	168681	168686	0 %	100 %	0 %	0 %	222080248
66	NC_011982	G	6	6	171653	171658	0 %	0 %	100 %	0 %	222080250
67	NC_011982	A	6	6	175857	175862	100 %	0 %	0 %	0 %	222080254
68	NC_011982	T	6	6	176347	176352	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
69	NC_011982	T	6	6	176358	176363	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
70	NC_011982	T	6	6	176936	176941	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
71	NC_011982	T	7	7	177275	177281	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
72	NC_011982	A	6	6	178391	178396	100 %	0 %	0 %	0 %	222080255
73	NC_011982	G	6	6	183062	183067	0 %	0 %	100 %	0 %	222080258
74	NC_011982	A	6	6	184372	184377	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
75	NC_011982	A	7	7	184692	184698	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
76	NC_011982	A	6	6	185766	185771	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
77	NC_011982	A	6	6	186729	186734	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
78	NC_011982	A	6	6	191061	191066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011982	A	7	7	196829	196835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011982	A	7	7	199744	199750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011982	A	6	6	199799	199804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011982	C	6	6	200661	200666	0 %	0 %	0 %	100 %	222080273
83	NC_011982	T	6	6	201319	201324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011982	T	6	6	201335	201340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011982	G	6	6	202689	202694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011982	A	6	6	202814	202819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011982	A	7	7	206057	206063	100 %	0 %	0 %	0 %	222080277
88	NC_011982	A	6	6	206974	206979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011982	T	6	6	208587	208592	0 %	100 %	0 %	0 %	222080280
90	NC_011982	C	6	6	211472	211477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_011982	T	7	7	212523	212529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011982	C	6	6	213110	213115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_011982	A	6	6	213250	213255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011982	T	7	7	215038	215044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011982	T	6	6	215354	215359	0 %	100 %	0 %	0 %	222080284
96	NC_011982	A	6	6	215961	215966	100 %	0 %	0 %	0 %	222080284
97	NC_011982	C	6	6	216284	216289	0 %	0 %	0 %	100 %	222080284
98	NC_011982	T	7	7	216885	216891	0 %	100 %	0 %	0 %	222080284
99	NC_011982	T	6	6	217570	217575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011982	T	8	8	217781	217788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011982	A	7	7	220891	220897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011982	G	6	6	221912	221917	0 %	0 %	100 %	0 %	222080287
103	NC_011982	T	6	6	223009	223014	0 %	100 %	0 %	0 %	222080288
104	NC_011982	C	6	6	225252	225257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_011982	A	6	6	226118	226123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011982	A	6	6	228702	228707	100 %	0 %	0 %	0 %	222080293
107	NC_011982	T	7	7	232882	232888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011982	A	6	6	237637	237642	100 %	0 %	0 %	0 %	222080301
109	NC_011982	T	6	6	239877	239882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011982	G	6	6	242054	242059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011982	A	6	6	255293	255298	100 %	0 %	0 %	0 %	222080317
112	NC_011982	A	6	6	258745	258750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.