MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	TAA	2	6	13	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011981	AGT	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011981	CGT	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011981	CTG	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011981	TCC	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011981	AGG	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011981	TGG	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011981	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011981	GCG	2	6	3857	3862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011981	ATC	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011981	ATA	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011981	CAC	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011981	GGC	2	6	3975	3980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011981	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011981	ATT	2	6	5380	5385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011981	GTC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011981	TCT	2	6	5464	5469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011981	ATG	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011981	AAC	2	6	5612	5617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011981	GGA	2	6	5634	5639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011981	AGC	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011981	CCG	2	6	7588	7593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011981	TCA	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011981	CAG	2	6	7813	7818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011981	AAC	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011981	ATT	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011981	TTG	2	6	9192	9197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011981	AAT	2	6	9344	9349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011981	CTG	2	6	9426	9431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011981	TTC	2	6	9513	9518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011981	GAA	2	6	9537	9542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011981	TGC	2	6	9676	9681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011981	TCT	2	6	9743	9748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011981	TGG	3	9	10098	10106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011981	CTT	2	6	10226	10231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011981	TTC	3	9	10311	10319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011981	CAT	2	6	10396	10401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011981	CAG	2	6	10466	10471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011981	TCC	2	6	10749	10754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011981	CGA	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011981	GAT	2	6	11028	11033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011981	GCA	2	6	11108	11113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011981	ATG	2	6	13030	13035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011981	ATT	2	6	13049	13054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011981	AGT	2	6	13131	13136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011981	GTT	2	6	14885	14890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011981	CGT	2	6	14930	14935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011981	CCA	2	6	22648	22653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011981	GTT	2	6	23731	23736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011981	GCG	2	6	23851	23856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011981	TGG	2	6	23911	23916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011981	CGT	2	6	24028	24033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011981	TGA	2	6	24043	24048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011981	TGC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011981	ATC	2	6	24148	24153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011981	GCG	2	6	24158	24163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011981	GCG	2	6	24219	24224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011981	TGA	2	6	24302	24307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011981	TGA	2	6	24413	24418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011981	GAT	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011981	CAG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011981	CGA	2	6	24530	24535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011981	GCC	2	6	24628	24633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011981	CCG	2	6	24653	24658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011981	GGC	3	9	24677	24685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011981	GCA	2	6	28542	28547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011981	TGC	2	6	28555	28560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011981	GAT	2	6	30323	30328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011981	TTG	2	6	30350	30355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011981	CGC	2	6	30397	30402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011981	TAG	2	6	31247	31252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011981	TCA	2	6	31725	31730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011981	CGA	2	6	33338	33343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011981	ATG	2	6	33557	33562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011981	GCC	2	6	33685	33690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011981	AGA	2	6	33725	33730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011981	GAG	2	6	33732	33737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011981	CGC	2	6	35521	35526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011981	CGG	2	6	35537	35542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011981	GCA	2	6	36319	36324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011981	CGG	2	6	36338	36343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011981	GAC	2	6	36352	36357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011981	CGG	2	6	36567	36572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011981	CAT	2	6	36601	36606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011981	TGC	2	6	36650	36655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011981	GAG	2	6	39449	39454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011981	GCC	2	6	40017	40022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011981	GAA	2	6	40025	40030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011981	CGA	2	6	40070	40075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011981	CGG	2	6	40189	40194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011981	CGA	2	6	43433	43438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011981	CGG	2	6	43673	43678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011981	CGC	2	6	43796	43801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011981	CCG	2	6	43802	43807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011981	ACC	2	6	43881	43886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011981	TGG	2	6	43906	43911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011981	CTC	2	6	44484	44489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011981	GCA	2	6	52032	52037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011981	TTG	2	6	52060	52065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011981	TCG	2	6	52182	52187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011981	GCC	2	6	52913	52918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011981	CGT	2	6	52976	52981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011981	ATG	2	6	53077	53082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011981	GGC	2	6	53084	53089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011981	GGC	2	6	53180	53185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011981	CGT	2	6	55837	55842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011981	CCG	2	6	55939	55944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011981	CGT	2	6	56019	56024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011981	GTC	2	6	56028	56033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011981	CGA	2	6	56039	56044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011981	CGG	2	6	59379	59384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011981	GCT	2	6	61861	61866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011981	CCA	2	6	61889	61894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011981	GCG	2	6	61900	61905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011981	TTG	2	6	62045	62050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011981	AAT	2	6	62293	62298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011981	TAT	2	6	62305	62310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011981	AAT	2	6	62345	62350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011981	TCT	2	6	62400	62405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011981	ATT	2	6	64523	64528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011981	CTG	2	6	64563	64568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011981	TCC	2	6	64571	64576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011981	TAT	2	6	64703	64708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011981	AAC	2	6	64911	64916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011981	GGA	2	6	64917	64922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011981	GAT	2	6	65423	65428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011981	CGC	2	6	65511	65516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011981	CGC	2	6	66264	66269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011981	ATG	2	6	66356	66361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011981	CAT	2	6	66400	66405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011981	CAT	2	6	66429	66434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011981	AGA	2	6	67685	67690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011981	CAT	2	6	68830	68835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011981	GAC	2	6	69011	69016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011981	CCA	2	6	69019	69024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011981	GAG	2	6	69025	69030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011981	CCA	2	6	69059	69064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011981	TCC	2	6	69918	69923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011981	TGG	2	6	69935	69940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011981	GCA	2	6	70933	70938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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