MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	CT	3	6	617	622	0 %	50 %	0 %	50 %	222102413
2	NC_011981	AT	3	6	681	686	50 %	50 %	0 %	0 %	222102413
3	NC_011981	TC	3	6	2122	2127	0 %	50 %	0 %	50 %	222102414
4	NC_011981	CG	3	6	2841	2846	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
5	NC_011981	CG	3	6	2904	2909	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
6	NC_011981	GC	3	6	3038	3043	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
7	NC_011981	TC	4	8	3077	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	222102415
8	NC_011981	AG	3	6	3155	3160	50 %	0 %	50 %	0 %	222102415
9	NC_011981	GC	3	6	4100	4105	0 %	0 %	50 %	50 %	222102416
10	NC_011981	CT	3	6	4140	4145	0 %	50 %	0 %	50 %	222102416
11	NC_011981	GC	3	6	8094	8099	0 %	0 %	50 %	50 %	222102418
12	NC_011981	GA	3	6	8974	8979	50 %	0 %	50 %	0 %	222102418
13	NC_011981	TC	3	6	11975	11980	0 %	50 %	0 %	50 %	222102420
14	NC_011981	GA	3	6	12058	12063	50 %	0 %	50 %	0 %	222102420
15	NC_011981	CG	4	8	12382	12389	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
16	NC_011981	GC	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
17	NC_011981	GC	3	6	12651	12656	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
18	NC_011981	GC	3	6	12829	12834	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
19	NC_011981	TC	3	6	14089	14094	0 %	50 %	0 %	50 %	222102421
20	NC_011981	CG	3	6	15281	15286	0 %	0 %	50 %	50 %	222102422
21	NC_011981	CT	3	6	17224	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	222102423
22	NC_011981	TC	3	6	19277	19282	0 %	50 %	0 %	50 %	222102424
23	NC_011981	CG	3	6	19297	19302	0 %	0 %	50 %	50 %	222102424
24	NC_011981	GC	3	6	19708	19713	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
25	NC_011981	GC	3	6	20211	20216	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
26	NC_011981	GC	3	6	20284	20289	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
27	NC_011981	GC	3	6	20701	20706	0 %	0 %	50 %	50 %	222102426
28	NC_011981	GC	3	6	21988	21993	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
29	NC_011981	CG	3	6	22152	22157	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
30	NC_011981	AG	3	6	22256	22261	50 %	0 %	50 %	0 %	222102427
31	NC_011981	GC	3	6	22549	22554	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
32	NC_011981	CG	3	6	22894	22899	0 %	0 %	50 %	50 %	222102428
33	NC_011981	CG	3	6	23374	23379	0 %	0 %	50 %	50 %	222102428
34	NC_011981	CT	3	6	23561	23566	0 %	50 %	0 %	50 %	222102428
35	NC_011981	AC	3	6	24818	24823	50 %	0 %	0 %	50 %	222102429
36	NC_011981	AG	3	6	24918	24923	50 %	0 %	50 %	0 %	222102429
37	NC_011981	GC	3	6	25899	25904	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
38	NC_011981	GC	4	8	26396	26403	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
39	NC_011981	GC	3	6	26486	26491	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
40	NC_011981	AG	3	6	26633	26638	50 %	0 %	50 %	0 %	222102430
41	NC_011981	CT	3	6	26863	26868	0 %	50 %	0 %	50 %	222102431
42	NC_011981	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	222102431
43	NC_011981	GC	3	6	30659	30664	0 %	0 %	50 %	50 %	222102434
44	NC_011981	AC	3	6	31536	31541	50 %	0 %	0 %	50 %	222102435
45	NC_011981	GC	3	6	32201	32206	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
46	NC_011981	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
47	NC_011981	AT	3	6	32546	32551	50 %	50 %	0 %	0 %	222102436
48	NC_011981	CG	3	6	32601	32606	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
49	NC_011981	TC	3	6	32839	32844	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
50	NC_011981	GC	3	6	34236	34241	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
51	NC_011981	CG	3	6	34664	34669	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
52	NC_011981	CG	3	6	34856	34861	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
53	NC_011981	GC	3	6	35046	35051	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
54	NC_011981	CG	3	6	35108	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
55	NC_011981	CG	3	6	35256	35261	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
56	NC_011981	CT	3	6	35800	35805	0 %	50 %	0 %	50 %	222102438
57	NC_011981	GC	3	6	36692	36697	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
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59	NC_011981	CG	3	6	37222	37227	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
60	NC_011981	GC	3	6	42544	42549	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
61	NC_011981	GC	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
62	NC_011981	GC	3	6	42852	42857	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
63	NC_011981	CG	3	6	43576	43581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102448
64	NC_011981	GC	4	8	43599	43606	0 %	0 %	50 %	50 %	222102448
65	NC_011981	GA	3	6	45246	45251	50 %	0 %	50 %	0 %	222102451
66	NC_011981	TC	3	6	45454	45459	0 %	50 %	0 %	50 %	222102451
67	NC_011981	GA	3	6	46303	46308	50 %	0 %	50 %	0 %	222102452
68	NC_011981	TC	3	6	46511	46516	0 %	50 %	0 %	50 %	222102452
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71	NC_011981	GC	3	6	48387	48392	0 %	0 %	50 %	50 %	222102453
72	NC_011981	GC	3	6	48674	48679	0 %	0 %	50 %	50 %	222102454
73	NC_011981	GC	3	6	49349	49354	0 %	0 %	50 %	50 %	222102454
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81	NC_011981	GA	3	6	54228	54233	50 %	0 %	50 %	0 %	222102458
82	NC_011981	GC	3	6	54362	54367	0 %	0 %	50 %	50 %	222102458
83	NC_011981	CG	3	6	55472	55477	0 %	0 %	50 %	50 %	222102459
84	NC_011981	GC	3	6	55488	55493	0 %	0 %	50 %	50 %	222102459
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88	NC_011981	GC	3	6	57007	57012	0 %	0 %	50 %	50 %	222102461
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90	NC_011981	AC	3	6	59207	59212	50 %	0 %	0 %	50 %	222102461
91	NC_011981	TG	3	6	59611	59616	0 %	50 %	50 %	0 %	222102462
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108	NC_011981	CG	3	6	70358	70363	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
109	NC_011981	GC	3	6	70621	70626	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
110	NC_011981	GT	3	6	70773	70778	0 %	50 %	50 %	0 %	222102472
111	NC_011981	CG	3	6	71236	71241	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
112	NC_011981	CA	3	6	71458	71463	50 %	0 %	0 %	50 %	222102473
113	NC_011981	CG	3	6	71576	71581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
114	NC_011981	CG	3	6	71749	71754	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
115	NC_011981	GC	3	6	73205	73210	0 %	0 %	50 %	50 %	222102475
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118	NC_011981	GC	3	6	75576	75581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102477
119	NC_011981	GC	3	6	76303	76308	0 %	0 %	50 %	50 %	222102478
120	NC_011981	AG	3	6	77331	77336	50 %	0 %	50 %	0 %	222102479
121	NC_011981	CG	3	6	79574	79579	0 %	0 %	50 %	50 %	222102481
122	NC_011981	CT	3	6	80095	80100	0 %	50 %	0 %	50 %	222102482
123	NC_011981	GC	3	6	80399	80404	0 %	0 %	50 %	50 %	222102482
124	NC_011981	GT	3	6	80405	80410	0 %	50 %	50 %	0 %	222102482
125	NC_011981	GA	3	6	80494	80499	50 %	0 %	50 %	0 %	222102482
126	NC_011981	CG	3	6	80798	80803	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
127	NC_011981	CG	3	6	81031	81036	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
128	NC_011981	GC	3	6	81039	81044	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
129	NC_011981	AT	3	6	81455	81460	50 %	50 %	0 %	0 %	222102484
130	NC_011981	CT	3	6	81483	81488	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
131	NC_011981	CT	4	8	82304	82311	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
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134	NC_011981	CG	3	6	83320	83325	0 %	0 %	50 %	50 %	222102485
135	NC_011981	AC	3	6	83328	83333	50 %	0 %	0 %	50 %	222102485
136	NC_011981	AG	3	6	86152	86157	50 %	0 %	50 %	0 %	222102490
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138	NC_011981	GT	3	6	86670	86675	0 %	50 %	50 %	0 %	222102490
139	NC_011981	AT	3	6	86687	86692	50 %	50 %	0 %	0 %	222102490
140	NC_011981	GC	3	6	87980	87985	0 %	0 %	50 %	50 %	222102491
141	NC_011981	GC	4	8	88409	88416	0 %	0 %	50 %	50 %	222102492
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