MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	222102413
2	NC_011981	A	6	6	1270	1275	100 %	0 %	0 %	0 %	222102413
3	NC_011981	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	222102414
4	NC_011981	A	7	7	3197	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	222102415
5	NC_011981	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011981	T	6	6	4988	4993	0 %	100 %	0 %	0 %	222102416
7	NC_011981	T	6	6	5241	5246	0 %	100 %	0 %	0 %	222102416
8	NC_011981	G	6	6	8811	8816	0 %	0 %	100 %	0 %	222102418
9	NC_011981	A	7	7	10973	10979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011981	T	6	6	13122	13127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011981	A	6	6	13265	13270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011981	G	6	6	19059	19064	0 %	0 %	100 %	0 %	222102424
13	NC_011981	T	6	6	21392	21397	0 %	100 %	0 %	0 %	222102426
14	NC_011981	C	6	6	21496	21501	0 %	0 %	0 %	100 %	222102426
15	NC_011981	G	6	6	23577	23582	0 %	0 %	100 %	0 %	222102428
16	NC_011981	C	6	6	26810	26815	0 %	0 %	0 %	100 %	222102431
17	NC_011981	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	222102433
18	NC_011981	T	6	6	30197	30202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011981	T	6	6	30475	30480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011981	A	6	6	30601	30606	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
21	NC_011981	A	6	6	30808	30813	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
22	NC_011981	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	222102436
23	NC_011981	A	6	6	33520	33525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011981	T	6	6	40284	40289	0 %	100 %	0 %	0 %	222102443
25	NC_011981	A	6	6	42536	42541	100 %	0 %	0 %	0 %	222102446
26	NC_011981	T	7	7	47142	47148	0 %	100 %	0 %	0 %	222102452
27	NC_011981	A	6	6	49042	49047	100 %	0 %	0 %	0 %	222102454
28	NC_011981	T	6	6	49610	49615	0 %	100 %	0 %	0 %	222102454
29	NC_011981	A	7	7	58478	58484	100 %	0 %	0 %	0 %	222102461
30	NC_011981	A	6	6	58660	58665	100 %	0 %	0 %	0 %	222102461
31	NC_011981	A	6	6	62190	62195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011981	A	8	8	63324	63331	100 %	0 %	0 %	0 %	222102465
33	NC_011981	T	6	6	64226	64231	0 %	100 %	0 %	0 %	222102466
34	NC_011981	C	6	6	66702	66707	0 %	0 %	0 %	100 %	222102469
35	NC_011981	A	6	6	67445	67450	100 %	0 %	0 %	0 %	222102469
36	NC_011981	A	6	6	68810	68815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011981	T	6	6	77598	77603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011981	A	6	6	77750	77755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011981	T	6	6	81440	81445	0 %	100 %	0 %	0 %	222102484
40	NC_011981	G	6	6	81794	81799	0 %	0 %	100 %	0 %	222102484
41	NC_011981	T	6	6	86320	86325	0 %	100 %	0 %	0 %	222102490
42	NC_011981	A	6	6	87345	87350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011981	T	6	6	87535	87540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011981	G	6	6	88021	88026	0 %	0 %	100 %	0 %	222102491
45	NC_011981	T	7	7	88845	88851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011981	G	6	6	91716	91721	0 %	0 %	100 %	0 %	222102495
47	NC_011981	C	6	6	92669	92674	0 %	0 %	0 %	100 %	222102496
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49	NC_011981	T	6	6	99506	99511	0 %	100 %	0 %	0 %	222102504
50	NC_011981	T	6	6	102035	102040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011981	A	6	6	104932	104937	100 %	0 %	0 %	0 %	222102509
52	NC_011981	G	6	6	108535	108540	0 %	0 %	100 %	0 %	222102513
53	NC_011981	T	6	6	108863	108868	0 %	100 %	0 %	0 %	222102513
54	NC_011981	T	6	6	113647	113652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011981	T	7	7	114285	114291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011981	A	8	8	115660	115667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011981	A	6	6	115999	116004	100 %	0 %	0 %	0 %	222102521
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59	NC_011981	T	6	6	117122	117127	0 %	100 %	0 %	0 %	222102521
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61	NC_011981	T	6	6	119838	119843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_011981	A	6	6	121865	121870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72	NC_011981	T	8	8	145016	145023	0 %	100 %	0 %	0 %	222102547
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92	NC_011981	T	6	6	187615	187620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011981	T	6	6	187911	187916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96	NC_011981	A	6	6	193245	193250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_011981	T	6	6	212727	212732	0 %	100 %	0 %	0 %	222102605
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110	NC_011981	A	6	6	222891	222896	100 %	0 %	0 %	0 %	222102616
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112	NC_011981	T	6	6	227318	227323	0 %	100 %	0 %	0 %	222102620
113	NC_011981	G	6	6	232056	232061	0 %	0 %	100 %	0 %	222102622
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115	NC_011981	A	6	6	239760	239765	100 %	0 %	0 %	0 %	222102630
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125	NC_011981	A	7	7	252279	252285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_011981	A	6	6	267587	267592	100 %	0 %	0 %	0 %	222102643
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142	NC_011981	A	6	6	307279	307284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011981	A	6	6	307411	307416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.