MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011981	A	7	7	10973	10979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011981	T	6	6	13122	13127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011981	A	6	6	13265	13270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011981	T	6	6	30197	30202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011981	T	6	6	30475	30480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011981	A	6	6	33520	33525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011981	A	6	6	62190	62195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011981	A	6	6	68810	68815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011981	T	6	6	77598	77603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011981	A	6	6	77750	77755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011981	A	6	6	87345	87350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011981	T	6	6	87535	87540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011981	T	7	7	88845	88851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011981	T	6	6	102035	102040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011981	T	6	6	113647	113652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011981	T	7	7	114285	114291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011981	A	8	8	115660	115667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011981	T	6	6	119838	119843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011981	A	6	6	121865	121870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011981	T	6	6	144509	144514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011981	T	6	6	148861	148866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011981	T	6	6	168126	168131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011981	T	7	7	173386	173392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011981	C	6	6	174903	174908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_011981	T	6	6	176111	176116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011981	A	7	7	181149	181155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011981	G	6	6	187341	187346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011981	A	6	6	187528	187533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011981	T	6	6	187615	187620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011981	T	6	6	187911	187916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011981	A	6	6	193245	193250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011981	T	7	7	199033	199039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011981	A	6	6	201015	201020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011981	T	6	6	217690	217695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011981	C	6	6	249679	249684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_011981	A	7	7	252279	252285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011981	T	7	7	293530	293536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011981	A	6	6	294852	294857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011981	A	7	7	295359	295365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011981	A	6	6	298845	298850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011981	A	6	6	307279	307284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011981	A	6	6	307411	307416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011981	A	6	6	307601	307606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011981	T	7	7	331879	331885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011981	T	6	6	338670	338675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011981	T	6	6	359351	359356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011981	A	6	6	365606	365611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011981	A	7	7	367588	367594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011981	A	7	7	379784	379790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011981	A	7	7	382355	382361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011981	T	8	8	387287	387294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011981	C	6	6	398152	398157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_011981	T	7	7	400501	400507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011981	A	6	6	412499	412504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011981	T	6	6	425678	425683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011981	G	7	7	426108	426114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011981	A	6	6	431674	431679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011981	A	6	6	449287	449292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011981	A	6	6	462071	462076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011981	A	6	6	462215	462220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011981	A	6	6	474238	474243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011981	C	9	9	486511	486519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_011981	T	6	6	501573	501578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011981	A	6	6	501712	501717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011981	A	7	7	513786	513792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011981	T	6	6	539643	539648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011981	T	6	6	539695	539700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011981	A	6	6	547842	547847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011981	T	6	6	548044	548049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011981	T	6	6	548082	548087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011981	T	6	6	553302	553307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011981	A	6	6	553370	553375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011981	A	7	7	558451	558457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011981	T	6	6	574411	574416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011981	T	7	7	574888	574894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011981	T	7	7	578826	578832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011981	A	6	6	608369	608374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011981	G	6	6	609966	609971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011981	T	8	8	626962	626969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011981	A	6	6	627005	627010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.