MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	222102413
2	NC_011981	A	6	6	1270	1275	100 %	0 %	0 %	0 %	222102413
3	NC_011981	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	222102414
4	NC_011981	A	7	7	3197	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	222102415
5	NC_011981	T	6	6	4988	4993	0 %	100 %	0 %	0 %	222102416
6	NC_011981	T	6	6	5241	5246	0 %	100 %	0 %	0 %	222102416
7	NC_011981	G	6	6	8811	8816	0 %	0 %	100 %	0 %	222102418
8	NC_011981	G	6	6	19059	19064	0 %	0 %	100 %	0 %	222102424
9	NC_011981	T	6	6	21392	21397	0 %	100 %	0 %	0 %	222102426
10	NC_011981	C	6	6	21496	21501	0 %	0 %	0 %	100 %	222102426
11	NC_011981	G	6	6	23577	23582	0 %	0 %	100 %	0 %	222102428
12	NC_011981	C	6	6	26810	26815	0 %	0 %	0 %	100 %	222102431
13	NC_011981	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	222102433
14	NC_011981	A	6	6	30601	30606	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
15	NC_011981	A	6	6	30808	30813	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
16	NC_011981	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	222102436
17	NC_011981	T	6	6	40284	40289	0 %	100 %	0 %	0 %	222102443
18	NC_011981	A	6	6	42536	42541	100 %	0 %	0 %	0 %	222102446
19	NC_011981	T	7	7	47142	47148	0 %	100 %	0 %	0 %	222102452
20	NC_011981	A	6	6	49042	49047	100 %	0 %	0 %	0 %	222102454
21	NC_011981	T	6	6	49610	49615	0 %	100 %	0 %	0 %	222102454
22	NC_011981	A	7	7	58478	58484	100 %	0 %	0 %	0 %	222102461
23	NC_011981	A	6	6	58660	58665	100 %	0 %	0 %	0 %	222102461
24	NC_011981	A	8	8	63324	63331	100 %	0 %	0 %	0 %	222102465
25	NC_011981	T	6	6	64226	64231	0 %	100 %	0 %	0 %	222102466
26	NC_011981	C	6	6	66702	66707	0 %	0 %	0 %	100 %	222102469
27	NC_011981	A	6	6	67445	67450	100 %	0 %	0 %	0 %	222102469
28	NC_011981	T	6	6	81440	81445	0 %	100 %	0 %	0 %	222102484
29	NC_011981	G	6	6	81794	81799	0 %	0 %	100 %	0 %	222102484
30	NC_011981	T	6	6	86320	86325	0 %	100 %	0 %	0 %	222102490
31	NC_011981	G	6	6	88021	88026	0 %	0 %	100 %	0 %	222102491
32	NC_011981	G	6	6	91716	91721	0 %	0 %	100 %	0 %	222102495
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39	NC_011981	A	6	6	115999	116004	100 %	0 %	0 %	0 %	222102521
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.