MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter sp. FRC-32 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011979	CGGCAT	2	12	19337	19348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011979	CGCCCC	2	12	106445	106456	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_011979	TGCCGA	2	12	180504	180515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011979	AAGCTG	2	12	218091	218102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011979	AGGACA	2	12	229945	229956	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011979	TGGCTT	2	12	242022	242033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011979	AACCAC	2	12	244199	244210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011979	CCCCTT	2	12	275064	275075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011979	TTCATT	2	12	289915	289926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011979	CAATGA	2	12	315019	315030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011979	TTTTAT	2	12	413187	413198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011979	TAAAAT	2	12	436042	436053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011979	TAATTT	2	12	459241	459252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011979	AAAACA	2	12	522952	522963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011979	TCCCCC	2	12	602907	602918	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_011979	GCAAAA	2	12	643521	643532	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011979	CCGGCG	2	12	750972	750983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011979	TACTTT	2	12	767158	767169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011979	TAACTA	2	12	806936	806947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011979	CTTCGG	2	12	873500	873511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011979	AAAAAT	2	12	912856	912867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011979	AGCAAC	2	12	950771	950782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011979	TTGCAA	2	12	980275	980286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011979	TCATTA	2	12	999088	999099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011979	TGGAAA	2	12	1004150	1004161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011979	AAAAAG	2	12	1012257	1012268	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011979	CGGCAG	2	12	1021424	1021435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011979	GGGGAG	2	12	1084369	1084380	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011979	AAAAAG	2	12	1124127	1124138	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011979	TGAAAT	2	12	1135193	1135204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011979	CAGACC	2	12	1251159	1251170	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011979	GATAGA	2	12	1338919	1338930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011979	AAATTG	2	12	1373585	1373596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011979	TAAACT	2	12	1415680	1415691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011979	CTCCCT	2	12	1463087	1463098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011979	AAGCAG	2	12	1517460	1517471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011979	TGCAGT	2	12	1552941	1552952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011979	GTAAAA	2	12	1582490	1582501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011979	CGCCTC	2	12	1645518	1645529	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011979	GCGTGC	2	12	1661813	1661824	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011979	CCATGA	2	12	1704799	1704810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011979	TCCCAA	2	12	1733629	1733640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011979	TGCATA	2	12	1754469	1754480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011979	AACAGG	2	12	1758762	1758773	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011979	TTTTAC	2	12	1787422	1787433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011979	AGGGGG	2	12	1809040	1809051	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011979	AAAACC	2	12	1854793	1854804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011979	GTTAGA	2	12	1868719	1868730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011979	TGGTGC	2	12	1913197	1913208	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011979	GAAAAT	2	12	1935274	1935285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011979	GGGGCA	2	12	1961000	1961011	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011979	AATTTA	2	12	1977840	1977851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011979	CTTTTT	2	12	2067278	2067289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011979	TAAAAT	2	12	2068535	2068546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011979	CATCAG	2	12	2097341	2097352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011979	TTTAAA	2	12	2111691	2111702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011979	AAGCGA	2	12	2114658	2114669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011979	CCAACT	2	12	2204438	2204449	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011979	AAAGGA	2	12	2243989	2244000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011979	TGAAAG	2	12	2245852	2245863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011979	TTCCCT	2	12	2266690	2266701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011979	CTTTAT	2	12	2284590	2284601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011979	TTTGCT	2	12	2288476	2288487	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011979	CCTTCC	2	12	2307580	2307591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011979	TAAACG	2	12	2424015	2424026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011979	TTTATA	2	12	2428398	2428409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011979	GGCCGG	2	12	2448461	2448472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011979	AACAAA	2	12	2455615	2455626	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011979	GTTCAT	2	12	2509863	2509874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011979	ATCCCC	2	12	2573007	2573018	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011979	ATATTA	2	12	2583983	2583994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011979	TGTTTT	2	12	2595057	2595068	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011979	TTGAAA	2	12	2660850	2660861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011979	GCGAAA	2	12	2723102	2723113	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011979	TTTGAA	2	12	2736565	2736576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011979	CGTCCC	2	12	2757686	2757697	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011979	TTTCAA	2	12	2762101	2762112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011979	CCGTCC	2	12	2772058	2772069	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011979	CCCGTC	2	12	2772075	2772086	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011979	TTCCTT	2	12	2840259	2840270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011979	GATGGG	2	12	2861763	2861774	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011979	GAACAT	2	12	2938268	2938279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011979	GAACAT	2	12	2938931	2938942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011979	CGGTGA	2	12	2993439	2993450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011979	CAGCGG	2	12	3009417	3009428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011979	CTCGGC	2	12	3009599	3009610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011979	CCTCAC	2	12	3086851	3086862	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011979	ATTATC	2	12	3089366	3089377	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011979	TTGCTT	2	12	3105032	3105043	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011979	CGTAAT	2	12	3133914	3133925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011979	AACGTA	2	12	3155251	3155262	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011979	GGAACC	2	12	3162543	3162554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011979	CGATGC	2	12	3162740	3162751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011979	GGAAAA	2	12	3163986	3163997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011979	TTTATG	2	12	3291131	3291142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011979	TTTGCT	2	12	3300389	3300400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011979	AAGGCA	2	12	3335834	3335845	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011979	ATAAAA	2	12	3339258	3339269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011979	CGTTAT	2	12	3356673	3356684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011979	CCCGAT	2	12	3408083	3408094	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011979	AAACCA	2	12	3410760	3410771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011979	AAATGG	2	12	3425617	3425628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011979	CAGCTG	2	12	3443866	3443877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011979	AAATAA	2	12	3509795	3509806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011979	AAGGAG	2	12	3538422	3538433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011979	TGTTTT	2	12	3545380	3545391	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011979	GTATAA	2	12	3657529	3657540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011979	TCAAAG	2	12	3755010	3755021	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011979	ATTATA	2	12	3756938	3756949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011979	CTGACA	2	12	3766063	3766074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011979	TGGGGA	2	12	3778634	3778645	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011979	GGCAGG	2	12	3849829	3849840	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011979	ATATTA	2	12	3873458	3873469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011979	TTTACA	2	12	3913534	3913545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011979	CCCCAT	2	12	3977850	3977861	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011979	TCGCTT	2	12	3987824	3987835	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011979	TTTAAA	2	12	3990791	3990802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011979	CTTTAA	2	12	4010228	4010239	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011979	CTATGA	2	12	4050396	4050407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011979	GTTGAC	2	12	4051549	4051560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011979	AGGTGA	2	12	4078779	4078790	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011979	GTAACC	2	12	4141238	4141249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011979	ATAAAA	2	12	4149347	4149358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011979	TTAAAA	2	12	4210989	4211000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011979	ATGGTC	2	12	4220602	4220613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011979	CCCTGC	2	12	4232360	4232371	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011979	GCAAGT	2	12	4232482	4232493	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.