MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 4772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011978	TTTG	2	8	63	70	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011978	ACTC	2	8	227	234	25 %	25 %	0 %	50 %	222098975
3	NC_011978	GAAC	2	8	249	256	50 %	0 %	25 %	25 %	222098975
4	NC_011978	CAGA	2	8	519	526	50 %	0 %	25 %	25 %	222098975
5	NC_011978	GATC	2	8	578	585	25 %	25 %	25 %	25 %	222098975
6	NC_011978	GAAG	2	8	614	621	50 %	0 %	50 %	0 %	222098975
7	NC_011978	GGGA	2	8	726	733	25 %	0 %	75 %	0 %	222098976
8	NC_011978	GATC	2	8	969	976	25 %	25 %	25 %	25 %	222098976
9	NC_011978	GGGC	2	8	1669	1676	0 %	0 %	75 %	25 %	222098977
10	NC_011978	GAAG	2	8	1720	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	222098977
11	NC_011978	GAAC	2	8	2078	2085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011978	GAAG	2	8	2173	2180	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
13	NC_011978	AAAG	2	8	2304	2311	75 %	0 %	25 %	0 %	222098978
14	NC_011978	GAAG	2	8	2917	2924	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
15	NC_011978	CTTT	2	8	3471	3478	0 %	75 %	0 %	25 %	222098979
16	NC_011978	TCGA	2	8	3531	3538	25 %	25 %	25 %	25 %	222098979
17	NC_011978	GAGG	2	8	4826	4833	25 %	0 %	75 %	0 %	222098980
18	NC_011978	GAAA	2	8	5179	5186	75 %	0 %	25 %	0 %	222098981
19	NC_011978	CGTT	2	8	5466	5473	0 %	50 %	25 %	25 %	222098981
20	NC_011978	AGGA	2	8	5716	5723	50 %	0 %	50 %	0 %	222098981
21	NC_011978	ATCT	3	12	6109	6120	25 %	50 %	0 %	25 %	222098983
22	NC_011978	TCCC	2	8	6162	6169	0 %	25 %	0 %	75 %	222098983
23	NC_011978	GATC	2	8	6209	6216	25 %	25 %	25 %	25 %	222098983
24	NC_011978	CCTT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	0 %	50 %	222098983
25	NC_011978	TTTC	2	8	6739	6746	0 %	75 %	0 %	25 %	222098984
26	NC_011978	TGTC	2	8	6945	6952	0 %	50 %	25 %	25 %	222098984
27	NC_011978	GAAA	2	8	7570	7577	75 %	0 %	25 %	0 %	222098986
28	NC_011978	TCCT	2	8	7719	7726	0 %	50 %	0 %	50 %	222098986
29	NC_011978	GATC	2	8	7803	7810	25 %	25 %	25 %	25 %	222098986
30	NC_011978	TTCC	2	8	7862	7869	0 %	50 %	0 %	50 %	222098986
31	NC_011978	AGGG	2	8	8427	8434	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011978	ATCT	2	8	8543	8550	25 %	50 %	0 %	25 %	222098987
33	NC_011978	TCGA	2	8	8627	8634	25 %	25 %	25 %	25 %	222098987
34	NC_011978	CAAA	2	8	8940	8947	75 %	0 %	0 %	25 %	222098987
35	NC_011978	ACAG	2	8	9115	9122	50 %	0 %	25 %	25 %	222098987
36	NC_011978	GAAA	2	8	9634	9641	75 %	0 %	25 %	0 %	222098987
37	NC_011978	GAGT	2	8	10008	10015	25 %	25 %	50 %	0 %	222098987
38	NC_011978	AAAC	2	8	10751	10758	75 %	0 %	0 %	25 %	222098988
39	NC_011978	ATTG	2	8	11198	11205	25 %	50 %	25 %	0 %	222098988
40	NC_011978	AAGG	2	8	11583	11590	50 %	0 %	50 %	0 %	222098988
41	NC_011978	AGAA	2	8	11603	11610	75 %	0 %	25 %	0 %	222098988
42	NC_011978	AGAA	2	8	11754	11761	75 %	0 %	25 %	0 %	222098988
43	NC_011978	CCAG	2	8	11838	11845	25 %	0 %	25 %	50 %	222098989
44	NC_011978	GGAA	2	8	12150	12157	50 %	0 %	50 %	0 %	222098989
45	NC_011978	GAAC	2	8	12307	12314	50 %	0 %	25 %	25 %	222098989
46	NC_011978	AGAA	2	8	12904	12911	75 %	0 %	25 %	0 %	222098989
47	NC_011978	TTCC	2	8	12925	12932	0 %	50 %	0 %	50 %	222098989
48	NC_011978	AGAT	2	8	13402	13409	50 %	25 %	25 %	0 %	222098990
49	NC_011978	TTCT	2	8	13650	13657	0 %	75 %	0 %	25 %	222098990
50	NC_011978	ATCC	2	8	14414	14421	25 %	25 %	0 %	50 %	222098991
51	NC_011978	CTCC	2	8	14466	14473	0 %	25 %	0 %	75 %	222098991
52	NC_011978	AACG	2	8	14806	14813	50 %	0 %	25 %	25 %	222098991
53	NC_011978	CTCC	2	8	14999	15006	0 %	25 %	0 %	75 %	222098991
54	NC_011978	TGCT	2	8	15277	15284	0 %	50 %	25 %	25 %	222098992
55	NC_011978	CCTG	2	8	15543	15550	0 %	25 %	25 %	50 %	222098992
56	NC_011978	TCCA	2	8	16196	16203	25 %	25 %	0 %	50 %	222098992
57	NC_011978	TCTT	2	8	17822	17829	0 %	75 %	0 %	25 %	222098992
58	NC_011978	CAAA	2	8	18026	18033	75 %	0 %	0 %	25 %	222098993
59	NC_011978	CAGA	2	8	18105	18112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011978	AGGG	2	8	18693	18700	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011978	GATC	2	8	19179	19186	25 %	25 %	25 %	25 %	222098997
62	NC_011978	CTTT	2	8	19315	19322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011978	GGAT	2	8	19398	19405	25 %	25 %	50 %	0 %	222098998
64	NC_011978	CTGG	2	8	19440	19447	0 %	25 %	50 %	25 %	222098998
65	NC_011978	AGAA	3	12	19639	19650	75 %	0 %	25 %	0 %	222098998
66	NC_011978	TTAA	2	8	19751	19758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011978	CTTT	3	12	19873	19884	0 %	75 %	0 %	25 %	222098999
68	NC_011978	GAAA	2	8	20157	20164	75 %	0 %	25 %	0 %	222098999
69	NC_011978	AAAG	2	8	21093	21100	75 %	0 %	25 %	0 %	222099000
70	NC_011978	GTTT	2	8	21836	21843	0 %	75 %	25 %	0 %	222099001
71	NC_011978	GTTC	2	8	22288	22295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011978	CTTA	2	8	22405	22412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011978	AGAC	2	8	23090	23097	50 %	0 %	25 %	25 %	222099002
74	NC_011978	CCTT	2	8	23287	23294	0 %	50 %	0 %	50 %	222099002
75	NC_011978	AATA	2	8	23396	23403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011978	TATG	2	8	23846	23853	25 %	50 %	25 %	0 %	222099003
77	NC_011978	ATCT	2	8	23937	23944	25 %	50 %	0 %	25 %	222099003
78	NC_011978	AAAT	2	8	24002	24009	75 %	25 %	0 %	0 %	222099003
79	NC_011978	TAGT	2	8	24191	24198	25 %	50 %	25 %	0 %	222099003
80	NC_011978	AATA	2	8	24557	24564	75 %	25 %	0 %	0 %	222099003
81	NC_011978	GCTG	2	8	25661	25668	0 %	25 %	50 %	25 %	222099005
82	NC_011978	GAAG	2	8	27858	27865	50 %	0 %	50 %	0 %	222099007
83	NC_011978	AGGA	2	8	27896	27903	50 %	0 %	50 %	0 %	222099007
84	NC_011978	AATA	2	8	28013	28020	75 %	25 %	0 %	0 %	222099007
85	NC_011978	TGTT	2	8	28234	28241	0 %	75 %	25 %	0 %	222099008
86	NC_011978	GAAA	2	8	29138	29145	75 %	0 %	25 %	0 %	222099009
87	NC_011978	TATT	2	8	29849	29856	25 %	75 %	0 %	0 %	222099010
88	NC_011978	GGAG	2	8	29865	29872	25 %	0 %	75 %	0 %	222099010
89	NC_011978	GCTT	2	8	30109	30116	0 %	50 %	25 %	25 %	222099010
90	NC_011978	GAAA	2	8	30699	30706	75 %	0 %	25 %	0 %	222099010
91	NC_011978	TTTC	2	8	30739	30746	0 %	75 %	0 %	25 %	222099010
92	NC_011978	CTAT	2	8	30765	30772	25 %	50 %	0 %	25 %	222099010
93	NC_011978	ATTG	2	8	31013	31020	25 %	50 %	25 %	0 %	222099010
94	NC_011978	AAGT	2	8	31166	31173	50 %	25 %	25 %	0 %	222099011
95	NC_011978	AAAG	2	8	31692	31699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011978	AGGA	2	8	32822	32829	50 %	0 %	50 %	0 %	222099012
97	NC_011978	CCTT	2	8	33620	33627	0 %	50 %	0 %	50 %	222099013
98	NC_011978	ATAG	2	8	33666	33673	50 %	25 %	25 %	0 %	222099013
99	NC_011978	TTTG	2	8	33866	33873	0 %	75 %	25 %	0 %	222099013
100	NC_011978	ATCT	2	8	34218	34225	25 %	50 %	0 %	25 %	222099013
101	NC_011978	TGCT	2	8	34312	34319	0 %	50 %	25 %	25 %	222099013
102	NC_011978	TCTT	2	8	34666	34673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011978	CAAG	2	8	36138	36145	50 %	0 %	25 %	25 %	222099015
104	NC_011978	GGAG	2	8	37119	37126	25 %	0 %	75 %	0 %	222099016
105	NC_011978	AAGG	2	8	37930	37937	50 %	0 %	50 %	0 %	222099016
106	NC_011978	TGTC	2	8	37999	38006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011978	GGAA	2	8	38435	38442	50 %	0 %	50 %	0 %	222099018
108	NC_011978	AAGT	2	8	38631	38638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011978	CTGC	2	8	38852	38859	0 %	25 %	25 %	50 %	222099019
110	NC_011978	TGTT	2	8	38888	38895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011978	TTAA	2	8	38974	38981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011978	GAAG	2	8	39082	39089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011978	GAAT	2	8	39423	39430	50 %	25 %	25 %	0 %	222099020
114	NC_011978	AGCA	2	8	39709	39716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011978	GTTT	2	8	39807	39814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011978	AGGG	2	8	40043	40050	25 %	0 %	75 %	0 %	222099021
117	NC_011978	TTGC	2	8	40200	40207	0 %	50 %	25 %	25 %	222099021
118	NC_011978	CAGA	2	8	40285	40292	50 %	0 %	25 %	25 %	222099021
119	NC_011978	GAAA	2	8	40395	40402	75 %	0 %	25 %	0 %	222099021
120	NC_011978	CAAT	2	8	40757	40764	50 %	25 %	0 %	25 %	222099021
121	NC_011978	AGAA	2	8	40827	40834	75 %	0 %	25 %	0 %	222099021
122	NC_011978	AAAG	2	8	41434	41441	75 %	0 %	25 %	0 %	222099022
123	NC_011978	CAAA	2	8	41559	41566	75 %	0 %	0 %	25 %	222099022
124	NC_011978	ATTC	2	8	41786	41793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011978	TTTG	2	8	42534	42541	0 %	75 %	25 %	0 %	222099023
126	NC_011978	TCAC	2	8	42580	42587	25 %	25 %	0 %	50 %	222099023
127	NC_011978	CCCA	2	8	42685	42692	25 %	0 %	0 %	75 %	222099023
128	NC_011978	CTTG	2	8	43321	43328	0 %	50 %	25 %	25 %	222099024
129	NC_011978	TAAC	2	8	44428	44435	50 %	25 %	0 %	25 %	222099025
130	NC_011978	GAAA	2	8	44675	44682	75 %	0 %	25 %	0 %	222099025
131	NC_011978	CTTT	2	8	44762	44769	0 %	75 %	0 %	25 %	222099025
132	NC_011978	GTAT	2	8	45193	45200	25 %	50 %	25 %	0 %	222099025
133	NC_011978	TTCG	2	8	45237	45244	0 %	50 %	25 %	25 %	222099025
134	NC_011978	GAAG	2	8	45713	45720	50 %	0 %	50 %	0 %	222099026
135	NC_011978	GAAA	2	8	46063	46070	75 %	0 %	25 %	0 %	222099026
136	NC_011978	GTAC	2	8	46189	46196	25 %	25 %	25 %	25 %	222099027
137	NC_011978	CCTC	2	8	47673	47680	0 %	25 %	0 %	75 %	222099030
138	NC_011978	CCTT	2	8	47889	47896	0 %	50 %	0 %	50 %	222099031
139	NC_011978	CTTT	2	8	48148	48155	0 %	75 %	0 %	25 %	222099033
140	NC_011978	TCTT	2	8	48419	48426	0 %	75 %	0 %	25 %	222099033
141	NC_011978	CCTC	2	8	48500	48507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_011978	TTCT	2	8	48807	48814	0 %	75 %	0 %	25 %	222099034
143	NC_011978	TCGG	2	8	49006	49013	0 %	25 %	50 %	25 %	222099034
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