MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011973	CATTC	2	10	1522	1531	20 %	40 %	0 %	40 %	221642093
2	NC_011973	ATTTC	2	10	3157	3166	20 %	60 %	0 %	20 %	221642095
3	NC_011973	TTTTC	2	10	5095	5104	0 %	80 %	0 %	20 %	221642098
4	NC_011973	GTGAA	2	10	6265	6274	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011973	TCATC	2	10	6497	6506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011973	GGAAG	2	10	10302	10311	40 %	0 %	60 %	0 %	221642104
7	NC_011973	ATTAT	2	10	11872	11881	40 %	60 %	0 %	0 %	221642106
8	NC_011973	CCATA	2	10	13834	13843	40 %	20 %	0 %	40 %	221642108
9	NC_011973	ATTAA	2	10	14573	14582	60 %	40 %	0 %	0 %	221642109
10	NC_011973	AAGCG	2	10	18736	18745	40 %	0 %	40 %	20 %	221642111
11	NC_011973	AAAGC	2	10	18817	18826	60 %	0 %	20 %	20 %	221642111
12	NC_011973	AAAGC	2	10	18898	18907	60 %	0 %	20 %	20 %	221642111
13	NC_011973	AAAGC	2	10	18979	18988	60 %	0 %	20 %	20 %	221642111
14	NC_011973	AAAGC	2	10	19059	19068	60 %	0 %	20 %	20 %	221642111
15	NC_011973	AAAGC	2	10	19140	19149	60 %	0 %	20 %	20 %	221642111
16	NC_011973	TAAAT	2	10	19258	19267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011973	CTCAT	2	10	19472	19481	20 %	40 %	0 %	40 %	221642112
18	NC_011973	TACAA	2	10	19967	19976	60 %	20 %	0 %	20 %	221642112
19	NC_011973	AAAAC	2	10	20955	20964	80 %	0 %	0 %	20 %	221642112
20	NC_011973	TCTTG	2	10	21645	21654	0 %	60 %	20 %	20 %	221642114
21	NC_011973	ACAAG	2	10	22561	22570	60 %	0 %	20 %	20 %	221642115
22	NC_011973	TGAAA	2	10	24816	24825	60 %	20 %	20 %	0 %	221642117
23	NC_011973	AAAGA	2	10	24882	24891	80 %	0 %	20 %	0 %	221642117
24	NC_011973	ATTAC	2	10	26406	26415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011973	TAATT	2	10	26889	26898	40 %	60 %	0 %	0 %	221642120
26	NC_011973	GATTA	2	10	27296	27305	40 %	40 %	20 %	0 %	221642120
27	NC_011973	ACTAA	2	10	29632	29641	60 %	20 %	0 %	20 %	221642121
28	NC_011973	TGATT	2	10	30339	30348	20 %	60 %	20 %	0 %	221642122
29	NC_011973	AAAGA	2	10	33139	33148	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011973	ACCAA	2	10	33342	33351	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011973	AATCG	2	10	33356	33365	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011973	TAACA	2	10	33459	33468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011973	TAATT	2	10	35145	35154	40 %	60 %	0 %	0 %	221642127
34	NC_011973	AAAGA	2	10	35442	35451	80 %	0 %	20 %	0 %	221642127
35	NC_011973	ATACT	2	10	36034	36043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011973	GATTA	2	10	37389	37398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011973	AATAC	2	10	40168	40177	60 %	20 %	0 %	20 %	221642133
38	NC_011973	ACTTC	2	10	41225	41234	20 %	40 %	0 %	40 %	221642134
39	NC_011973	GATGA	2	10	41563	41572	40 %	20 %	40 %	0 %	221642134
40	NC_011973	AAATT	2	10	46267	46276	60 %	40 %	0 %	0 %	221642140
41	NC_011973	GAAAA	2	10	46963	46972	80 %	0 %	20 %	0 %	221642140
42	NC_011973	TCATA	2	10	48321	48330	40 %	40 %	0 %	20 %	221642142
43	NC_011973	TCTGC	2	10	48773	48782	0 %	40 %	20 %	40 %	221642142
44	NC_011973	ATTGA	2	10	48785	48794	40 %	40 %	20 %	0 %	221642142
45	NC_011973	TGTAC	2	10	50568	50577	20 %	40 %	20 %	20 %	221642143
46	NC_011973	CCTTG	2	10	50838	50847	0 %	40 %	20 %	40 %	221642144
47	NC_011973	GAAAA	2	10	51050	51059	80 %	0 %	20 %	0 %	221642144
48	NC_011973	TCTGC	2	10	51558	51567	0 %	40 %	20 %	40 %	221642144
49	NC_011973	TTGAT	2	10	51778	51787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011973	AAATA	2	10	52082	52091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011973	CATTT	2	10	52699	52708	20 %	60 %	0 %	20 %	221642145
52	NC_011973	GGAAT	2	10	54559	54568	40 %	20 %	40 %	0 %	221642147
53	NC_011973	TATTG	2	10	59553	59562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011973	GGAGC	2	10	61075	61084	20 %	0 %	60 %	20 %	221642154
55	NC_011973	TAATG	2	10	63685	63694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011973	TATTT	2	10	63731	63740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011973	CAACT	2	10	64869	64878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011973	TTACA	2	10	65706	65715	40 %	40 %	0 %	20 %	221642157
59	NC_011973	ACTTT	2	10	67589	67598	20 %	60 %	0 %	20 %	221642158
60	NC_011973	TATTT	2	10	67699	67708	20 %	80 %	0 %	0 %	221642158
61	NC_011973	CCTAC	2	10	68628	68637	20 %	20 %	0 %	60 %	221642159
62	NC_011973	ATGAG	2	10	69440	69449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011973	CATTC	2	10	73221	73230	20 %	40 %	0 %	40 %	221642163
64	NC_011973	AACAA	2	10	74408	74417	80 %	0 %	0 %	20 %	221642164
65	NC_011973	AGCTG	2	10	75771	75780	20 %	20 %	40 %	20 %	221642165
66	NC_011973	GAATA	2	10	77139	77148	60 %	20 %	20 %	0 %	221642165
67	NC_011973	AGTAC	2	10	77986	77995	40 %	20 %	20 %	20 %	221642165
68	NC_011973	ATTGG	2	10	79321	79330	20 %	40 %	40 %	0 %	221642165
69	NC_011973	GTATT	2	10	88214	88223	20 %	60 %	20 %	0 %	221642165
70	NC_011973	TGAAA	2	10	88630	88639	60 %	20 %	20 %	0 %	221642165
71	NC_011973	GAAAA	2	10	90774	90783	80 %	0 %	20 %	0 %	221642166
72	NC_011973	TAATT	2	10	91157	91166	40 %	60 %	0 %	0 %	221642167
73	NC_011973	ATGAA	2	10	92118	92127	60 %	20 %	20 %	0 %	221642168
74	NC_011973	GGAGA	2	10	95912	95921	40 %	0 %	60 %	0 %	221642172
75	NC_011973	GAATA	2	10	96699	96708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011973	ATCTT	2	10	98440	98449	20 %	60 %	0 %	20 %	221642175
77	NC_011973	TCAAG	2	10	98481	98490	40 %	20 %	20 %	20 %	221642175
78	NC_011973	AATTG	2	10	98975	98984	40 %	40 %	20 %	0 %	221642176
79	NC_011973	TAAAC	2	10	100268	100277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011973	ATTAT	2	10	100308	100317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011973	TAATT	2	10	101681	101690	40 %	60 %	0 %	0 %	221642179
82	NC_011973	CTTCA	2	10	102404	102413	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_011973	TTATA	2	10	102819	102828	40 %	60 %	0 %	0 %	221642181
84	NC_011973	TTACA	2	10	105159	105168	40 %	40 %	0 %	20 %	221642186
85	NC_011973	TTTTA	2	10	105317	105326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011973	TCCAT	2	10	105797	105806	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011973	CCTTT	2	10	106918	106927	0 %	60 %	0 %	40 %	221642188
88	NC_011973	TTAAC	2	10	108446	108455	40 %	40 %	0 %	20 %	221642190
89	NC_011973	AAATG	2	10	109055	109064	60 %	20 %	20 %	0 %	221642190
90	NC_011973	TTAAA	2	10	109313	109322	60 %	40 %	0 %	0 %	221642190
91	NC_011973	TCATC	2	10	109964	109973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011973	TTACA	2	10	110962	110971	40 %	40 %	0 %	20 %	221642191
93	NC_011973	TAATT	2	10	111486	111495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011973	TATTT	2	10	114072	114081	20 %	80 %	0 %	0 %	221642195
95	NC_011973	TTCTC	2	10	114407	114416	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011973	AAAGA	2	10	116219	116228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011973	ATATG	2	10	116719	116728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011973	GAAAT	2	10	116957	116966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011973	CTATT	2	10	119588	119597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011973	TATAA	2	10	119978	119987	60 %	40 %	0 %	0 %	221642202
101	NC_011973	TAAAA	2	10	120526	120535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011973	ATGAT	2	10	120927	120936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011973	CGGAA	2	10	121181	121190	40 %	0 %	40 %	20 %	221642203
104	NC_011973	ATCCA	2	10	121279	121288	40 %	20 %	0 %	40 %	221642203
105	NC_011973	AAGAA	2	10	121585	121594	80 %	0 %	20 %	0 %	221642204
106	NC_011973	CATAC	2	10	121603	121612	40 %	20 %	0 %	40 %	221642204
107	NC_011973	ATTTC	2	10	122901	122910	20 %	60 %	0 %	20 %	221642206
108	NC_011973	GCATT	2	10	125051	125060	20 %	40 %	20 %	20 %	221642208
109	NC_011973	TCCAT	2	10	126420	126429	20 %	40 %	0 %	40 %	221642209
110	NC_011973	AACTC	2	10	126903	126912	40 %	20 %	0 %	40 %	221642209
111	NC_011973	ACCAA	2	10	128096	128105	60 %	0 %	0 %	40 %	221642210
112	NC_011973	CATTC	2	10	128513	128522	20 %	40 %	0 %	40 %	221642210
113	NC_011973	TTTGT	2	10	128852	128861	0 %	80 %	20 %	0 %	221642211
114	NC_011973	TAAAA	2	10	132985	132994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011973	TTCCT	2	10	133279	133288	0 %	60 %	0 %	40 %	221642214
116	NC_011973	TTTTC	2	10	134474	134483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011973	TTGTT	2	10	135333	135342	0 %	80 %	20 %	0 %	221642215
118	NC_011973	CGTTC	2	10	136725	136734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011973	CACAA	2	10	138136	138145	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011973	AAAAG	2	10	138466	138475	80 %	0 %	20 %	0 %	221642219
121	NC_011973	ATTCT	2	10	139705	139714	20 %	60 %	0 %	20 %	221642220
122	NC_011973	ATTTT	2	10	140583	140592	20 %	80 %	0 %	0 %	221642220
123	NC_011973	CTAAA	2	10	146217	146226	60 %	20 %	0 %	20 %	221642226
124	NC_011973	TAACT	2	10	146687	146696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011973	GTAAT	2	10	149341	149350	40 %	40 %	20 %	0 %	221642229
126	NC_011973	TAAAA	2	10	149389	149398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011973	CATAT	2	10	149923	149932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011973	ATTTT	2	10	151808	151817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011973	ATTCA	2	10	154178	154187	40 %	40 %	0 %	20 %	221642235
130	NC_011973	CTTCT	2	10	156461	156470	0 %	60 %	0 %	40 %	221642238
131	NC_011973	AATAC	2	10	157350	157359	60 %	20 %	0 %	20 %	221642240
132	NC_011973	TAAAA	2	10	157615	157624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011973	TTCTT	2	10	158192	158201	0 %	80 %	0 %	20 %	221642242
134	NC_011973	ACAAA	2	10	162467	162476	80 %	0 %	0 %	20 %	221642246
135	NC_011973	CTTAT	2	10	164093	164102	20 %	60 %	0 %	20 %	221642246
136	NC_011973	TATAA	2	10	164965	164974	60 %	40 %	0 %	0 %	221642247
137	NC_011973	ATTTT	2	10	165382	165391	20 %	80 %	0 %	0 %	221642247
138	NC_011973	TAAAA	2	10	165405	165414	80 %	20 %	0 %	0 %	221642247
139	NC_011973	TTTCT	2	10	166685	166694	0 %	80 %	0 %	20 %	221642248
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197	NC_011973	AAAAT	2	10	233622	233631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.