MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc53

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011971	AATTAC	2	12	44	55	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221316923
2	NC_011971	CCAAGT	2	12	3313	3324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221316927
3	NC_011971	AGAATT	2	12	7842	7853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	221316934
4	NC_011971	TTCGGT	2	12	11285	11296	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	221316939
5	NC_011971	TTTAAA	2	12	13211	13222	50 %	50 %	0 %	0 %	221316939
6	NC_011971	TTGCTT	2	12	17301	17312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	221316941
7	NC_011971	AATTTT	2	12	18271	18282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221316941
8	NC_011971	ATCCCA	2	12	21880	21891	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	221316946
9	NC_011971	ATTTGT	2	12	22828	22839	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	221316946
10	NC_011971	CTTTTA	2	12	27308	27319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	221316950
11	NC_011971	TTTCTT	2	12	27759	27770	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221316951
12	NC_011971	CTTCAC	2	12	28676	28687	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	221316952
13	NC_011971	TCGTCA	2	12	29528	29539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221316954
14	NC_011971	TTTGCT	2	12	30711	30722	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	221316957
15	NC_011971	CTTCTG	2	12	33176	33187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011971	CTTTAT	2	12	34240	34251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	221316960
17	NC_011971	TTATCT	2	12	34881	34892	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	221316961
18	NC_011971	ATACAC	2	12	37248	37259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011971	TATTTA	2	12	41199	41210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221316971
20	NC_011971	CAAATT	2	12	42358	42369	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011971	ATTCGA	2	12	48280	48291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.