MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc53

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011971	AATTG	2	10	1491	1500	40 %	40 %	20 %	0 %	221316924
2	NC_011971	ATTAA	2	10	1853	1862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011971	ATTCT	2	10	2515	2524	20 %	60 %	0 %	20 %	221316925
4	NC_011971	AAGAA	2	10	5820	5829	80 %	0 %	20 %	0 %	221316930
5	NC_011971	CCAAG	2	10	6424	6433	40 %	0 %	20 %	40 %	221316931
6	NC_011971	TAAAA	2	10	6747	6756	80 %	20 %	0 %	0 %	221316931
7	NC_011971	ATTTT	2	10	7990	7999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011971	AACAG	2	10	8450	8459	60 %	0 %	20 %	20 %	221316935
9	NC_011971	TCTTT	2	10	10486	10495	0 %	80 %	0 %	20 %	221316938
10	NC_011971	CAAAT	2	10	10825	10834	60 %	20 %	0 %	20 %	221316938
11	NC_011971	ATACA	2	10	11370	11379	60 %	20 %	0 %	20 %	221316939
12	NC_011971	CAACT	2	10	12164	12173	40 %	20 %	0 %	40 %	221316939
13	NC_011971	TTTGG	2	10	14097	14106	0 %	60 %	40 %	0 %	221316939
14	NC_011971	AGTTT	2	10	14331	14340	20 %	60 %	20 %	0 %	221316939
15	NC_011971	TTTCA	2	10	16441	16450	20 %	60 %	0 %	20 %	221316940
16	NC_011971	TAATT	2	10	16657	16666	40 %	60 %	0 %	0 %	221316940
17	NC_011971	AGGAT	2	10	19464	19473	40 %	20 %	40 %	0 %	221316942
18	NC_011971	GTAAT	2	10	19793	19802	40 %	40 %	20 %	0 %	221316942
19	NC_011971	TTCAT	2	10	21011	21020	20 %	60 %	0 %	20 %	221316944
20	NC_011971	AAACT	2	10	22370	22379	60 %	20 %	0 %	20 %	221316946
21	NC_011971	TACCA	2	10	22881	22890	40 %	20 %	0 %	40 %	221316946
22	NC_011971	TCTCT	2	10	23018	23027	0 %	60 %	0 %	40 %	221316946
23	NC_011971	AATTA	2	10	23038	23047	60 %	40 %	0 %	0 %	221316946
24	NC_011971	TTTTC	2	10	23938	23947	0 %	80 %	0 %	20 %	221316948
25	NC_011971	CATCC	2	10	25147	25156	20 %	20 %	0 %	60 %	221316948
26	NC_011971	CATTT	2	10	26129	26138	20 %	60 %	0 %	20 %	221316948
27	NC_011971	TCTTT	2	10	29483	29492	0 %	80 %	0 %	20 %	221316954
28	NC_011971	GCCAA	2	10	29918	29927	40 %	0 %	20 %	40 %	221316955
29	NC_011971	TTGTA	2	10	30979	30988	20 %	60 %	20 %	0 %	221316957
30	NC_011971	TTCAC	2	10	31922	31931	20 %	40 %	0 %	40 %	221316958
31	NC_011971	CGATA	2	10	33718	33727	40 %	20 %	20 %	20 %	221316960
32	NC_011971	GATTT	2	10	35712	35721	20 %	60 %	20 %	0 %	221316961
33	NC_011971	GTTTT	2	10	38140	38149	0 %	80 %	20 %	0 %	221316964
34	NC_011971	ATGTT	2	10	40973	40982	20 %	60 %	20 %	0 %	221316969
35	NC_011971	CACCT	2	10	41809	41818	20 %	20 %	0 %	60 %	221316972
36	NC_011971	TTCTT	2	10	42948	42957	0 %	80 %	0 %	20 %	221316975
37	NC_011971	TATTG	2	10	43155	43164	20 %	60 %	20 %	0 %	221316975
38	NC_011971	ATTCA	2	10	43202	43211	40 %	40 %	0 %	20 %	221316975
39	NC_011971	TTTAA	2	10	45628	45637	40 %	60 %	0 %	0 %	221316980
40	NC_011971	TTATC	2	10	48550	48559	20 %	60 %	0 %	20 %	221316985
41	NC_011971	TTTTA	2	10	50983	50992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011971	CGTAT	2	10	51504	51513	20 %	40 %	20 %	20 %	221316990
43	NC_011971	TAAAT	2	10	52555	52564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.