MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc53

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011971	TTTG	2	8	67	74	0 %	75 %	25 %	0 %	221316923
2	NC_011971	ATCT	2	8	590	597	25 %	50 %	0 %	25 %	221316923
3	NC_011971	AGAT	2	8	707	714	50 %	25 %	25 %	0 %	221316923
4	NC_011971	TAAA	2	8	1013	1020	75 %	25 %	0 %	0 %	221316923
5	NC_011971	TACA	2	8	1329	1336	50 %	25 %	0 %	25 %	221316924
6	NC_011971	ATTA	2	8	1624	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	221316924
7	NC_011971	AATT	2	8	2254	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	221316925
8	NC_011971	ATTT	2	8	2782	2789	25 %	75 %	0 %	0 %	221316926
9	NC_011971	ACAG	2	8	4537	4544	50 %	0 %	25 %	25 %	221316929
10	NC_011971	GAAA	2	8	4857	4864	75 %	0 %	25 %	0 %	221316929
11	NC_011971	GATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	50 %	0 %	221316929
12	NC_011971	ATTT	2	8	5153	5160	25 %	75 %	0 %	0 %	221316930
13	NC_011971	ATTG	2	8	5175	5182	25 %	50 %	25 %	0 %	221316930
14	NC_011971	AGAA	2	8	5595	5602	75 %	0 %	25 %	0 %	221316930
15	NC_011971	TATT	2	8	5650	5657	25 %	75 %	0 %	0 %	221316930
16	NC_011971	ATTC	2	8	6173	6180	25 %	50 %	0 %	25 %	221316931
17	NC_011971	GAAA	2	8	7277	7284	75 %	0 %	25 %	0 %	221316932
18	NC_011971	TAGG	2	8	7296	7303	25 %	25 %	50 %	0 %	221316932
19	NC_011971	AATG	2	8	7539	7546	50 %	25 %	25 %	0 %	221316933
20	NC_011971	GGAA	2	8	8423	8430	50 %	0 %	50 %	0 %	221316935
21	NC_011971	TTAA	2	8	8442	8449	50 %	50 %	0 %	0 %	221316935
22	NC_011971	GATC	2	8	9139	9146	25 %	25 %	25 %	25 %	221316936
23	NC_011971	TTAG	2	8	9223	9230	25 %	50 %	25 %	0 %	221316936
24	NC_011971	TTTA	2	8	9326	9333	25 %	75 %	0 %	0 %	221316937
25	NC_011971	GTAA	2	8	9919	9926	50 %	25 %	25 %	0 %	221316937
26	NC_011971	CGAA	2	8	10326	10333	50 %	0 %	25 %	25 %	221316937
27	NC_011971	ATAA	2	8	10352	10359	75 %	25 %	0 %	0 %	221316937
28	NC_011971	ATTA	2	8	10854	10861	50 %	50 %	0 %	0 %	221316938
29	NC_011971	CCAC	2	8	10888	10895	25 %	0 %	0 %	75 %	221316938
30	NC_011971	AAAT	2	8	11052	11059	75 %	25 %	0 %	0 %	221316939
31	NC_011971	TACG	2	8	11692	11699	25 %	25 %	25 %	25 %	221316939
32	NC_011971	CCAT	2	8	11758	11765	25 %	25 %	0 %	50 %	221316939
33	NC_011971	ACTT	2	8	11786	11793	25 %	50 %	0 %	25 %	221316939
34	NC_011971	ATCA	2	8	11918	11925	50 %	25 %	0 %	25 %	221316939
35	NC_011971	CTTT	2	8	12060	12067	0 %	75 %	0 %	25 %	221316939
36	NC_011971	ATCT	2	8	12266	12273	25 %	50 %	0 %	25 %	221316939
37	NC_011971	GTTT	2	8	12821	12828	0 %	75 %	25 %	0 %	221316939
38	NC_011971	GGGA	2	8	13679	13686	25 %	0 %	75 %	0 %	221316939
39	NC_011971	AAAG	2	8	13944	13951	75 %	0 %	25 %	0 %	221316939
40	NC_011971	TAAC	2	8	14517	14524	50 %	25 %	0 %	25 %	221316939
41	NC_011971	ACCA	2	8	14578	14585	50 %	0 %	0 %	50 %	221316939
42	NC_011971	AAAT	2	8	15370	15377	75 %	25 %	0 %	0 %	221316940
43	NC_011971	CTGT	2	8	15761	15768	0 %	50 %	25 %	25 %	221316940
44	NC_011971	TAAT	2	8	15780	15787	50 %	50 %	0 %	0 %	221316940
45	NC_011971	CAAA	2	8	16263	16270	75 %	0 %	0 %	25 %	221316940
46	NC_011971	TTCT	2	8	16342	16349	0 %	75 %	0 %	25 %	221316940
47	NC_011971	TGCT	2	8	17593	17600	0 %	50 %	25 %	25 %	221316941
48	NC_011971	TTGA	2	8	17796	17803	25 %	50 %	25 %	0 %	221316941
49	NC_011971	TAAA	2	8	18501	18508	75 %	25 %	0 %	0 %	221316941
50	NC_011971	CTTT	2	8	18708	18715	0 %	75 %	0 %	25 %	221316941
51	NC_011971	CGTT	2	8	18907	18914	0 %	50 %	25 %	25 %	221316941
52	NC_011971	CTAA	2	8	19732	19739	50 %	25 %	0 %	25 %	221316942
53	NC_011971	ATTT	2	8	20353	20360	25 %	75 %	0 %	0 %	221316942
54	NC_011971	AATA	2	8	21849	21856	75 %	25 %	0 %	0 %	221316946
55	NC_011971	CATG	2	8	23366	23373	25 %	25 %	25 %	25 %	221316947
56	NC_011971	TTTG	2	8	23413	23420	0 %	75 %	25 %	0 %	221316947
57	NC_011971	TTGT	2	8	23522	23529	0 %	75 %	25 %	0 %	221316947
58	NC_011971	ATTT	2	8	23621	23628	25 %	75 %	0 %	0 %	221316947
59	NC_011971	TTTA	2	8	24074	24081	25 %	75 %	0 %	0 %	221316948
60	NC_011971	TACT	2	8	24430	24437	25 %	50 %	0 %	25 %	221316948
61	NC_011971	TGAA	2	8	24567	24574	50 %	25 %	25 %	0 %	221316948
62	NC_011971	CATT	2	8	24586	24593	25 %	50 %	0 %	25 %	221316948
63	NC_011971	TCCA	2	8	24820	24827	25 %	25 %	0 %	50 %	221316948
64	NC_011971	TCCA	2	8	24952	24959	25 %	25 %	0 %	50 %	221316948
65	NC_011971	ACAT	2	8	25163	25170	50 %	25 %	0 %	25 %	221316948
66	NC_011971	GCTT	2	8	25188	25195	0 %	50 %	25 %	25 %	221316948
67	NC_011971	ATCC	2	8	26380	26387	25 %	25 %	0 %	50 %	221316948
68	NC_011971	AAAT	2	8	27013	27020	75 %	25 %	0 %	0 %	221316949
69	NC_011971	GCTT	2	8	27436	27443	0 %	50 %	25 %	25 %	221316950
70	NC_011971	ATGA	2	8	28389	28396	50 %	25 %	25 %	0 %	221316952
71	NC_011971	TCTA	2	8	28476	28483	25 %	50 %	0 %	25 %	221316952
72	NC_011971	TTGT	2	8	29611	29618	0 %	75 %	25 %	0 %	221316955
73	NC_011971	GAAA	2	8	29910	29917	75 %	0 %	25 %	0 %	221316955
74	NC_011971	TTTC	2	8	29945	29952	0 %	75 %	0 %	25 %	221316955
75	NC_011971	TCTT	2	8	30099	30106	0 %	75 %	0 %	25 %	221316956
76	NC_011971	TTTG	2	8	30659	30666	0 %	75 %	25 %	0 %	221316957
77	NC_011971	AACC	2	8	30795	30802	50 %	0 %	0 %	50 %	221316957
78	NC_011971	ACCA	2	8	31966	31973	50 %	0 %	0 %	50 %	221316958
79	NC_011971	ATCT	2	8	32948	32955	25 %	50 %	0 %	25 %	221316959
80	NC_011971	GAAT	2	8	34524	34531	50 %	25 %	25 %	0 %	221316960
81	NC_011971	TTTG	2	8	34630	34637	0 %	75 %	25 %	0 %	221316960
82	NC_011971	AACG	2	8	35166	35173	50 %	0 %	25 %	25 %	221316961
83	NC_011971	CAAT	2	8	35277	35284	50 %	25 %	0 %	25 %	221316961
84	NC_011971	CTTT	2	8	35790	35797	0 %	75 %	0 %	25 %	221316961
85	NC_011971	AAAT	2	8	35804	35811	75 %	25 %	0 %	0 %	221316961
86	NC_011971	ACAA	2	8	35978	35985	75 %	0 %	0 %	25 %	221316961
87	NC_011971	CTTG	2	8	36274	36281	0 %	50 %	25 %	25 %	221316962
88	NC_011971	ATGA	2	8	36399	36406	50 %	25 %	25 %	0 %	221316962
89	NC_011971	TCTT	2	8	36676	36683	0 %	75 %	0 %	25 %	221316962
90	NC_011971	GTTC	2	8	36778	36785	0 %	50 %	25 %	25 %	221316962
91	NC_011971	ATTA	2	8	37638	37645	50 %	50 %	0 %	0 %	221316963
92	NC_011971	CTTT	2	8	37891	37898	0 %	75 %	0 %	25 %	221316963
93	NC_011971	TAAT	2	8	38201	38208	50 %	50 %	0 %	0 %	221316964
94	NC_011971	GTTT	2	8	38402	38409	0 %	75 %	25 %	0 %	221316965
95	NC_011971	TAAT	2	8	39894	39901	50 %	50 %	0 %	0 %	221316967
96	NC_011971	ATTT	2	8	40350	40357	25 %	75 %	0 %	0 %	221316968
97	NC_011971	TTCT	2	8	40559	40566	0 %	75 %	0 %	25 %	221316969
98	NC_011971	ATTC	2	8	41339	41346	25 %	50 %	0 %	25 %	221316971
99	NC_011971	ATTC	2	8	41435	41442	25 %	50 %	0 %	25 %	221316971
100	NC_011971	GTTT	2	8	42134	42141	0 %	75 %	25 %	0 %	221316973
101	NC_011971	TCTT	2	8	42161	42168	0 %	75 %	0 %	25 %	221316973
102	NC_011971	TTTA	2	8	42395	42402	25 %	75 %	0 %	0 %	221316974
103	NC_011971	CATC	2	8	42551	42558	25 %	25 %	0 %	50 %	221316974
104	NC_011971	ATTC	2	8	44181	44188	25 %	50 %	0 %	25 %	221316977
105	NC_011971	TCAA	2	8	44338	44345	50 %	25 %	0 %	25 %	221316977
106	NC_011971	CGAA	2	8	44577	44584	50 %	0 %	25 %	25 %	221316978
107	NC_011971	AAAT	2	8	44937	44944	75 %	25 %	0 %	0 %	221316979
108	NC_011971	TTTC	2	8	45515	45522	0 %	75 %	0 %	25 %	221316980
109	NC_011971	TCAT	2	8	45766	45773	25 %	50 %	0 %	25 %	221316980
110	NC_011971	AAAT	2	8	46467	46474	75 %	25 %	0 %	0 %	221316982
111	NC_011971	TTAG	2	8	47053	47060	25 %	50 %	25 %	0 %	221316983
112	NC_011971	TTCC	2	8	48381	48388	0 %	50 %	0 %	50 %	221316985
113	NC_011971	TGAT	2	8	49086	49093	25 %	50 %	25 %	0 %	221316986
114	NC_011971	ATCA	2	8	49105	49112	50 %	25 %	0 %	25 %	221316987
115	NC_011971	CATT	2	8	49258	49265	25 %	50 %	0 %	25 %	221316987
116	NC_011971	ATAA	2	8	49977	49984	75 %	25 %	0 %	0 %	221316989
117	NC_011971	AAAG	2	8	50059	50066	75 %	0 %	25 %	0 %	221316989
118	NC_011971	TCAT	2	8	50225	50232	25 %	50 %	0 %	25 %	221316989
119	NC_011971	TAAG	2	8	50340	50347	50 %	25 %	25 %	0 %	221316989
120	NC_011971	TTTA	2	8	50422	50429	25 %	75 %	0 %	0 %	221316989
121	NC_011971	TTTA	2	8	50599	50606	25 %	75 %	0 %	0 %	221316989
122	NC_011971	GAAT	2	8	52086	52093	50 %	25 %	25 %	0 %	221316991

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.