MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 1

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011963	TAAGGC	2	12	65	76	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011963	CTTTTT	2	12	31982	31993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011963	AGGGGC	2	12	77766	77777	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011963	CGGGTT	2	12	77908	77919	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011963	GGAGCC	2	12	126295	126306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011963	GGGGGC	2	12	144913	144924	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011963	GGCCCC	2	12	146824	146835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011963	GGGCGC	2	12	149075	149086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011963	GCCCTT	2	12	152151	152162	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011963	CGGTGC	2	12	171270	171281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011963	CGGGGA	2	12	205697	205708	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011963	CGGCCG	2	12	242018	242029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011963	CCGGTT	2	12	263160	263171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011963	GCAGGC	2	12	282017	282028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011963	GCGGTC	2	12	289533	289544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011963	GGTTCC	2	12	294811	294822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011963	GCTCCG	2	12	314444	314455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011963	GGCGCG	2	12	316113	316124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011963	GCATGC	2	12	326060	326071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011963	CGAGAA	2	12	326318	326329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011963	CTCTCC	2	12	403316	403327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011963	GGGCGC	2	12	422982	422993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011963	CTCGGG	2	12	470420	470431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011963	CCTCGC	2	12	476032	476043	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011963	TTTTCG	2	12	496547	496558	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011963	CCGGCC	2	12	498951	498962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011963	GCAAGA	2	12	499010	499021	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011963	CCCGCG	2	12	499097	499108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011963	TTGACG	2	12	512589	512600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011963	GCGGGG	2	12	531716	531727	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011963	CGTCCG	2	12	540784	540795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011963	GCCGGA	2	12	561978	561989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011963	GCGCGG	2	12	582496	582507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011963	CGGGCG	2	12	602252	602263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011963	CCCGTT	2	12	602393	602404	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011963	CCTTTT	2	12	619664	619675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011963	CAAGGC	2	12	643752	643763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011963	TGCCGG	2	12	649578	649589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011963	CCGGCG	2	12	784830	784841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011963	CCCTGG	2	12	801917	801928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011963	CGCGGA	2	12	806865	806876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011963	TCACCC	2	12	867052	867063	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011963	GGGAAG	2	12	882261	882272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011963	TCCCGG	2	12	901490	901501	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011963	CCGGCA	2	12	957632	957643	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011963	GAACGG	2	12	991212	991223	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011963	TGCCAC	2	12	991680	991691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011963	GCACCG	2	12	994918	994929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011963	GTTCCG	2	12	997782	997793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011963	CCCGGG	2	12	998265	998276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011963	CAGCCG	2	12	1003810	1003821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011963	GAAGCC	2	12	1050631	1050642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011963	CGGCCG	2	12	1075100	1075111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011963	GCGCGG	2	12	1080292	1080303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011963	CCCGGC	2	12	1080390	1080401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011963	GCCGAT	2	12	1119137	1119148	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011963	CCGGCC	2	12	1141932	1141943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011963	GCCGGG	2	12	1173328	1173339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011963	CCGGCC	2	12	1176687	1176698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011963	CCGCTC	2	12	1217913	1217924	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011963	CCTGTC	2	12	1225429	1225440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011963	CCCTCT	2	12	1231428	1231439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011963	GGCAGG	2	12	1260021	1260032	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011963	CATGAG	2	12	1263972	1263983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011963	GCACCT	2	12	1267355	1267366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011963	GCCCGC	2	12	1326521	1326532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011963	CCGGTC	2	12	1337514	1337525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011963	CAAAAG	2	12	1344380	1344391	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011963	GGTGCG	2	12	1368284	1368295	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011963	AGCCGC	2	12	1375811	1375822	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011963	GAGCCG	2	12	1404035	1404046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011963	CCCGAG	2	12	1409092	1409103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011963	GCCCCT	2	12	1447302	1447313	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011963	CGCGGA	3	18	1502369	1502386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011963	GGCAAG	2	12	1545889	1545900	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011963	GCCCCC	2	12	1565364	1565375	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_011963	AGGGAG	2	12	1576448	1576459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011963	AGCGCC	2	12	1580407	1580418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011963	CGCGGG	3	18	1580540	1580557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011963	TCGGAA	2	12	1642583	1642594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011963	CCTGCC	2	12	1650630	1650641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011963	CAGCCG	2	12	1657400	1657411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011963	GGCGCG	2	12	1661169	1661180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011963	TAGCGG	2	12	1668932	1668943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011963	CCGCCC	2	12	1710890	1710901	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_011963	CGCGGG	2	12	1715295	1715306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011963	CCCTTT	2	12	1720884	1720895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011963	CGGCCA	2	12	1820748	1820759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011963	CCTGCC	2	12	1838856	1838867	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011963	CGGGCG	2	12	1851240	1851251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011963	CTTCCA	2	12	1868828	1868839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011963	TGCGGC	2	12	1873070	1873081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011963	CCCCGC	2	12	1928771	1928782	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_011963	TCCCCC	2	12	1956955	1956966	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_011963	CGGGGC	2	12	1962024	1962035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011963	ACGTCA	2	12	1995007	1995018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011963	GGTTCA	2	12	2040552	2040563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011963	AGCCCG	2	12	2052877	2052888	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011963	CCGGGC	2	12	2078059	2078070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011963	TCTGCC	2	12	2093279	2093290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011963	GCCACC	2	12	2134188	2134199	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011963	CGCGCC	2	12	2216715	2216726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011963	TGCGAT	2	12	2220673	2220684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011963	GCGCGG	2	12	2254825	2254836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011963	GGGCGC	2	12	2261177	2261188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011963	GAAGGG	2	12	2262707	2262718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011963	GCAGGA	2	12	2264923	2264934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011963	CTTTGC	2	12	2271616	2271627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011963	CGGGCG	2	12	2280330	2280341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011963	ACTCGA	2	12	2280356	2280367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011963	CCCGAG	2	12	2286546	2286557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011963	GGGCGC	2	12	2289550	2289561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011963	CCTTTC	2	12	2313939	2313950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011963	GCCGAG	2	12	2342355	2342366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011963	CGGCCA	2	12	2349327	2349338	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011963	TGCGCC	2	12	2351786	2351797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011963	GCAATC	2	12	2352475	2352486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011963	GGCGCG	2	12	2363928	2363939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011963	CCGCGC	2	12	2363947	2363958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011963	TTTCCG	2	12	2378404	2378415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011963	AGGCCG	2	12	2506312	2506323	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011963	TTGATA	2	12	2507704	2507715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011963	GGGGCG	2	12	2554020	2554031	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011963	AAGCGC	2	12	2600947	2600958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011963	GCAGCT	2	12	2603406	2603417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011963	GATCGT	2	12	2603578	2603589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011963	GCCGGG	2	12	2606427	2606438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011963	CCGAGG	2	12	2630484	2630495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011963	GCGGCA	2	12	2756032	2756043	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011963	CCGGTG	2	12	2821421	2821432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011963	GGTGCC	2	12	2821522	2821533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011963	GGCGCG	2	12	2821924	2821935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011963	GACGGG	2	12	2829557	2829568	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011963	ACGGAA	2	12	2835641	2835652	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_011963	GCGGGA	2	12	2848796	2848807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_011963	TCCGGG	2	12	2866703	2866714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011963	GCCGCG	2	12	2908084	2908095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011963	AGGCGA	2	12	2950045	2950056	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011963	CCGGAA	2	12	3004338	3004349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011963	GCCCGC	2	12	3051296	3051307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011963	GTGCCG	2	12	3051315	3051326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011963	CGGCCC	2	12	3058068	3058079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_011963	GAAAGG	2	12	3061522	3061533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011963	GCGCCG	2	12	3097225	3097236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011963	TCTCGA	2	12	3102273	3102284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011963	GTGGAA	2	12	3105570	3105581	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011963	CCCCTG	2	12	3152405	3152416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.