MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 1

Total Repeats: 3031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011963	AGGCG	2	10	412	421	20 %	0 %	60 %	20 %	221638100
2	NC_011963	CGGAC	2	10	650	659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011963	AGAGG	2	10	689	698	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011963	CTCGG	2	10	1114	1123	0 %	20 %	40 %	40 %	221638101
5	NC_011963	GACCT	2	10	1831	1840	20 %	20 %	20 %	40 %	221638102
6	NC_011963	CTGTC	2	10	1916	1925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011963	TCGTG	2	10	2502	2511	0 %	40 %	40 %	20 %	221638103
8	NC_011963	GAAGA	2	10	2843	2852	60 %	0 %	40 %	0 %	221638104
9	NC_011963	GCCGC	2	10	3591	3600	0 %	0 %	40 %	60 %	221638105
10	NC_011963	GACCA	2	10	4908	4917	40 %	0 %	20 %	40 %	221638105
11	NC_011963	CGGGC	2	10	4961	4970	0 %	0 %	60 %	40 %	221638105
12	NC_011963	GACGC	2	10	5544	5553	20 %	0 %	40 %	40 %	221638105
13	NC_011963	CGCGG	2	10	5873	5882	0 %	0 %	60 %	40 %	221638105
14	NC_011963	TGGGC	2	10	6748	6757	0 %	20 %	60 %	20 %	221638105
15	NC_011963	GCCGG	2	10	6997	7006	0 %	0 %	60 %	40 %	221638105
16	NC_011963	AAGGC	2	10	8854	8863	40 %	0 %	40 %	20 %	221638106
17	NC_011963	TCTCG	2	10	10622	10631	0 %	40 %	20 %	40 %	221638106
18	NC_011963	CCTTT	2	10	11815	11824	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011963	GCTGG	2	10	12319	12328	0 %	20 %	60 %	20 %	221638107
20	NC_011963	GGGGA	2	10	12651	12660	20 %	0 %	80 %	0 %	221638107
21	NC_011963	ACCTG	2	10	12878	12887	20 %	20 %	20 %	40 %	221638107
22	NC_011963	GCGGT	2	10	15605	15614	0 %	20 %	60 %	20 %	221638110
23	NC_011963	TCGCG	2	10	15764	15773	0 %	20 %	40 %	40 %	221638110
24	NC_011963	GACCT	2	10	15880	15889	20 %	20 %	20 %	40 %	221638110
25	NC_011963	CGCGG	2	10	15890	15899	0 %	0 %	60 %	40 %	221638110
26	NC_011963	CGGGC	2	10	16004	16013	0 %	0 %	60 %	40 %	221638110
27	NC_011963	CACCC	2	10	16135	16144	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_011963	GGCTC	2	10	16668	16677	0 %	20 %	40 %	40 %	221638111
29	NC_011963	ACTCG	2	10	17823	17832	20 %	20 %	20 %	40 %	221638113
30	NC_011963	GCGCA	2	10	17845	17854	20 %	0 %	40 %	40 %	221638113
31	NC_011963	ACCGC	2	10	19741	19750	20 %	0 %	20 %	60 %	221638116
32	NC_011963	CCGCA	2	10	21167	21176	20 %	0 %	20 %	60 %	221638119
33	NC_011963	GCCGG	2	10	22014	22023	0 %	0 %	60 %	40 %	221638120
34	NC_011963	GACCA	2	10	23589	23598	40 %	0 %	20 %	40 %	221638125
35	NC_011963	GCTCG	2	10	26222	26231	0 %	20 %	40 %	40 %	221638130
36	NC_011963	GCTCG	2	10	28437	28446	0 %	20 %	40 %	40 %	221638133
37	NC_011963	GCGCC	2	10	28822	28831	0 %	0 %	40 %	60 %	221638134
38	NC_011963	CGCAC	2	10	31474	31483	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011963	GGGAT	2	10	32024	32033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011963	CCGCG	2	10	33758	33767	0 %	0 %	40 %	60 %	221638140
41	NC_011963	AGGGC	2	10	34381	34390	20 %	0 %	60 %	20 %	221638141
42	NC_011963	TTGAC	2	10	37840	37849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011963	GCTGG	2	10	39725	39734	0 %	20 %	60 %	20 %	221638146
44	NC_011963	GAACC	2	10	41732	41741	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011963	CGCGG	2	10	43174	43183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011963	CGGGC	2	10	43762	43771	0 %	0 %	60 %	40 %	221638150
47	NC_011963	CGGCG	2	10	44133	44142	0 %	0 %	60 %	40 %	221638150
48	NC_011963	GCGGT	2	10	44661	44670	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011963	GCGCC	2	10	45982	45991	0 %	0 %	40 %	60 %	221638151
50	NC_011963	TCCCG	2	10	47102	47111	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_011963	CACGG	2	10	47959	47968	20 %	0 %	40 %	40 %	221638152
52	NC_011963	GCCGG	2	10	48322	48331	0 %	0 %	60 %	40 %	221638153
53	NC_011963	GGGGC	2	10	48542	48551	0 %	0 %	80 %	20 %	221638153
54	NC_011963	CGGCG	2	10	51773	51782	0 %	0 %	60 %	40 %	221638156
55	NC_011963	ACCTC	2	10	52545	52554	20 %	20 %	0 %	60 %	221638158
56	NC_011963	GCCGA	2	10	52562	52571	20 %	0 %	40 %	40 %	221638158
57	NC_011963	GAAAG	2	10	52935	52944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011963	GAGCA	2	10	55028	55037	40 %	0 %	40 %	20 %	221638159
59	NC_011963	TTCGA	2	10	55043	55052	20 %	40 %	20 %	20 %	221638159
60	NC_011963	CCGAG	2	10	56762	56771	20 %	0 %	40 %	40 %	221638162
61	NC_011963	GCCGG	2	10	57176	57185	0 %	0 %	60 %	40 %	221638162
62	NC_011963	CGGCA	2	10	60041	60050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011963	GTCCT	2	10	61014	61023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011963	GCCGC	2	10	61802	61811	0 %	0 %	40 %	60 %	221638167
65	NC_011963	CGCCC	2	10	62800	62809	0 %	0 %	20 %	80 %	221638168
66	NC_011963	CTTCG	2	10	63864	63873	0 %	40 %	20 %	40 %	221638169
67	NC_011963	CGGCC	2	10	68271	68280	0 %	0 %	40 %	60 %	221638175
68	NC_011963	TCCGA	2	10	68313	68322	20 %	20 %	20 %	40 %	221638175
69	NC_011963	GTGCG	2	10	69293	69302	0 %	20 %	60 %	20 %	221638176
70	NC_011963	GCGCG	2	10	69593	69602	0 %	0 %	60 %	40 %	221638176
71	NC_011963	GCATC	2	10	69920	69929	20 %	20 %	20 %	40 %	221638176
72	NC_011963	GGGGC	2	10	71013	71022	0 %	0 %	80 %	20 %	221638179
73	NC_011963	TGTCG	2	10	71297	71306	0 %	40 %	40 %	20 %	221638179
74	NC_011963	GCCCG	2	10	71459	71468	0 %	0 %	40 %	60 %	221638179
75	NC_011963	GCCGG	2	10	71642	71651	0 %	0 %	60 %	40 %	221638179
76	NC_011963	GTCCT	2	10	72303	72312	0 %	40 %	20 %	40 %	221638179
77	NC_011963	TTGCC	3	15	72663	72677	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011963	TGCGC	2	10	73283	73292	0 %	20 %	40 %	40 %	221638180
79	NC_011963	CGATC	2	10	74207	74216	20 %	20 %	20 %	40 %	221638180
80	NC_011963	CCCGT	2	10	76089	76098	0 %	20 %	20 %	60 %	221638183
81	NC_011963	TGCGC	2	10	77995	78004	0 %	20 %	40 %	40 %	221638185
82	NC_011963	CGGGG	2	10	78169	78178	0 %	0 %	80 %	20 %	221638185
83	NC_011963	GGGCG	2	10	80172	80181	0 %	0 %	80 %	20 %	221638187
84	NC_011963	GCACG	2	10	81178	81187	20 %	0 %	40 %	40 %	221638188
85	NC_011963	TGGAA	2	10	81249	81258	40 %	20 %	40 %	0 %	221638188
86	NC_011963	GCCCG	2	10	81509	81518	0 %	0 %	40 %	60 %	221638188
87	NC_011963	GCGAT	2	10	81636	81645	20 %	20 %	40 %	20 %	221638188
88	NC_011963	CTCGC	2	10	82061	82070	0 %	20 %	20 %	60 %	221638188
89	NC_011963	GCGCG	2	10	82870	82879	0 %	0 %	60 %	40 %	221638188
90	NC_011963	CGGCG	2	10	83314	83323	0 %	0 %	60 %	40 %	221638188
91	NC_011963	GGGCT	2	10	83409	83418	0 %	20 %	60 %	20 %	221638188
92	NC_011963	GGGCT	2	10	83857	83866	0 %	20 %	60 %	20 %	221638189
93	NC_011963	GCGCG	2	10	83961	83970	0 %	0 %	60 %	40 %	221638189
94	NC_011963	TCGTC	2	10	84182	84191	0 %	40 %	20 %	40 %	221638189
95	NC_011963	CGGGG	2	10	84243	84252	0 %	0 %	80 %	20 %	221638189
96	NC_011963	GCCTC	2	10	84269	84278	0 %	20 %	20 %	60 %	221638189
97	NC_011963	CCGCG	2	10	84435	84444	0 %	0 %	40 %	60 %	221638189
98	NC_011963	CCGGC	2	10	85406	85415	0 %	0 %	40 %	60 %	221638190
99	NC_011963	GGACC	2	10	86255	86264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011963	GCCGC	2	10	86376	86385	0 %	0 %	40 %	60 %	221638191
101	NC_011963	AGCCG	2	10	87500	87509	20 %	0 %	40 %	40 %	221638193
102	NC_011963	CGGCG	2	10	87746	87755	0 %	0 %	60 %	40 %	221638193
103	NC_011963	GTCGG	2	10	89493	89502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011963	CCGGG	2	10	90128	90137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011963	GGGCG	2	10	90695	90704	0 %	0 %	80 %	20 %	221638195
106	NC_011963	GCGCC	2	10	91174	91183	0 %	0 %	40 %	60 %	221638196
107	NC_011963	GCCCG	2	10	92457	92466	0 %	0 %	40 %	60 %	221638197
108	NC_011963	CGCAT	2	10	92651	92660	20 %	20 %	20 %	40 %	221638197
109	NC_011963	GAACA	2	10	92726	92735	60 %	0 %	20 %	20 %	221638197
110	NC_011963	GATCG	2	10	93543	93552	20 %	20 %	40 %	20 %	221638199
111	NC_011963	TCGGC	2	10	94227	94236	0 %	20 %	40 %	40 %	221638200
112	NC_011963	GCCGG	2	10	95090	95099	0 %	0 %	60 %	40 %	221638200
113	NC_011963	GCGGG	2	10	97893	97902	0 %	0 %	80 %	20 %	221638204
114	NC_011963	GCATG	2	10	98858	98867	20 %	20 %	40 %	20 %	221638205
115	NC_011963	GGCGC	2	10	98959	98968	0 %	0 %	60 %	40 %	221638206
116	NC_011963	CCGCC	2	10	99519	99528	0 %	0 %	20 %	80 %	221638207
117	NC_011963	CGAGG	2	10	99765	99774	20 %	0 %	60 %	20 %	221638208
118	NC_011963	GCCGC	2	10	100305	100314	0 %	0 %	40 %	60 %	221638208
119	NC_011963	AGGTC	2	10	100730	100739	20 %	20 %	40 %	20 %	221638208
120	NC_011963	CGGGC	2	10	102175	102184	0 %	0 %	60 %	40 %	221638208
121	NC_011963	ACCGC	2	10	108834	108843	20 %	0 %	20 %	60 %	221638214
122	NC_011963	GTGGC	2	10	109628	109637	0 %	20 %	60 %	20 %	221638214
123	NC_011963	CGGCC	2	10	110301	110310	0 %	0 %	40 %	60 %	221638214
124	NC_011963	CGCGG	2	10	110697	110706	0 %	0 %	60 %	40 %	221638215
125	NC_011963	GCCAC	2	10	111258	111267	20 %	0 %	20 %	60 %	221638215
126	NC_011963	AGCCG	2	10	111944	111953	20 %	0 %	40 %	40 %	221638216
127	NC_011963	GATCG	2	10	113258	113267	20 %	20 %	40 %	20 %	221638218
128	NC_011963	CGAAG	2	10	114518	114527	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011963	GCACC	2	10	115245	115254	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_011963	GCCCG	3	15	116142	116156	0 %	0 %	40 %	60 %	221638220
131	NC_011963	AGGGC	2	10	116825	116834	20 %	0 %	60 %	20 %	221638220
132	NC_011963	GCGCG	2	10	119041	119050	0 %	0 %	60 %	40 %	221638222
133	NC_011963	AGCCG	2	10	119226	119235	20 %	0 %	40 %	40 %	221638222
134	NC_011963	GGCAG	2	10	122230	122239	20 %	0 %	60 %	20 %	221638226
135	NC_011963	GCGTG	2	10	123776	123785	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011963	CCGGC	2	10	126982	126991	0 %	0 %	40 %	60 %	221638229
137	NC_011963	CGGCG	2	10	127042	127051	0 %	0 %	60 %	40 %	221638229
138	NC_011963	CCCGG	2	10	127546	127555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_011963	GCCGG	2	10	129857	129866	0 %	0 %	60 %	40 %	221638231
140	NC_011963	GGCGC	2	10	130092	130101	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011963	CTGCT	2	10	132277	132286	0 %	40 %	20 %	40 %	221638235
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