MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 1

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011963	CGGAC	2	10	650	659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011963	AGAGG	2	10	689	698	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011963	CTGTC	2	10	1916	1925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011963	CCTTT	2	10	11815	11824	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011963	CACCC	2	10	16135	16144	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_011963	CGCAC	2	10	31474	31483	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011963	GGGAT	2	10	32024	32033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011963	TTGAC	2	10	37840	37849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011963	GAACC	2	10	41732	41741	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011963	CGCGG	2	10	43174	43183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011963	GCGGT	2	10	44661	44670	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011963	TCCCG	2	10	47102	47111	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_011963	GAAAG	2	10	52935	52944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011963	CGGCA	2	10	60041	60050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011963	GTCCT	2	10	61014	61023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011963	TTGCC	3	15	72663	72677	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011963	GGACC	2	10	86255	86264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011963	GTCGG	2	10	89493	89502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011963	CCGGG	2	10	90128	90137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011963	CGAAG	2	10	114518	114527	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011963	GCACC	2	10	115245	115254	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_011963	GCGTG	2	10	123776	123785	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011963	CCCGG	2	10	127546	127555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011963	GGCGC	2	10	130092	130101	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011963	GCAGG	2	10	132743	132752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011963	GCGCC	2	10	152079	152088	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_011963	AGGGC	2	10	161301	161310	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011963	GCGGG	2	10	177190	177199	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011963	CGCGG	2	10	199603	199612	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011963	ATTGC	2	10	200700	200709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011963	CCGCT	2	10	202197	202206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011963	GAGCC	2	10	203083	203092	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011963	CTGCC	2	10	219472	219481	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011963	AAGGA	2	10	221353	221362	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011963	CGGCC	2	10	221473	221482	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_011963	GGGCG	2	10	224261	224270	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011963	AATTG	2	10	227424	227433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011963	ACTGA	2	10	235172	235181	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011963	CGGCG	2	10	237070	237079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011963	ACCGG	2	10	237128	237137	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011963	TCATG	2	10	280941	280950	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011963	GCCGA	2	10	283735	283744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011963	AGGGC	2	10	283775	283784	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011963	CCTGG	2	10	290128	290137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011963	CGGGA	2	10	315987	315996	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011963	TTTCG	2	10	321251	321260	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011963	CGCCC	2	10	322785	322794	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_011963	CGGCG	2	10	326612	326621	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011963	GGGCC	2	10	328138	328147	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011963	CATGC	2	10	336226	336235	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011963	CTCGG	2	10	337273	337282	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011963	GGGCG	2	10	341142	341151	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011963	CCGGC	2	10	343521	343530	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_011963	GCTCA	2	10	356493	356502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011963	CGGAG	2	10	363053	363062	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011963	AAGCG	2	10	363630	363639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011963	GTCCT	2	10	365142	365151	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011963	GCCAA	2	10	367525	367534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011963	TCGGC	2	10	400282	400291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011963	TCGGA	2	10	400395	400404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011963	GCGCG	2	10	400481	400490	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011963	AGGGG	2	10	400495	400504	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011963	TCCGT	2	10	403383	403392	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011963	TGCCG	2	10	418945	418954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011963	CGGGG	2	10	421896	421905	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011963	GCCCC	2	10	421926	421935	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_011963	CCGGC	2	10	424741	424750	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_011963	TTCGG	2	10	436920	436929	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011963	GACGG	2	10	439799	439808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011963	CAGGA	2	10	443988	443997	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011963	CGGGC	2	10	461774	461783	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011963	GGCCG	2	10	462633	462642	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011963	CGGGG	2	10	463942	463951	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011963	GGAAG	2	10	470365	470374	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011963	CGGGG	3	15	476126	476140	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011963	CGCGC	2	10	478932	478941	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_011963	CGTCA	2	10	488589	488598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011963	GGGGA	2	10	494549	494558	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011963	CCGGG	2	10	494637	494646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011963	CCCTT	2	10	496021	496030	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_011963	TCCGG	2	10	496035	496044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011963	ACGTG	2	10	512604	512613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011963	GCAGG	2	10	531638	531647	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011963	CGGGA	2	10	540820	540829	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011963	CCGGT	2	10	540862	540871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011963	AGGGC	2	10	553501	553510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011963	CCGCC	2	10	562041	562050	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_011963	CGCGG	2	10	571363	571372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011963	TTCGG	2	10	583705	583714	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011963	CAGGG	2	10	606390	606399	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011963	TCCTG	2	10	612700	612709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011963	CCTTT	2	10	613635	613644	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_011963	AAGGG	2	10	622760	622769	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011963	GCGGG	2	10	624355	624364	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011963	CACGC	2	10	627770	627779	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_011963	TCCTG	2	10	649431	649440	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011963	GGGGA	2	10	649598	649607	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011963	CGACC	2	10	650850	650859	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_011963	GAGAG	2	10	663432	663441	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011963	ACAGC	2	10	670623	670632	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011963	GGGCC	2	10	674133	674142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011963	CGGAG	2	10	686889	686898	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011963	GGCCG	2	10	691027	691036	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011963	AGGAG	2	10	692312	692321	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011963	CGGAG	2	10	698463	698472	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011963	TCCGG	2	10	704886	704895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011963	GTGGC	2	10	724771	724780	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011963	GCGGG	2	10	724797	724806	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011963	AGCGC	2	10	727672	727681	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011963	CCGGA	2	10	737440	737449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011963	GCAGA	2	10	752193	752202	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011963	CGTAG	2	10	752644	752653	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011963	TGCGG	2	10	757232	757241	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011963	CCCGG	2	10	759649	759658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_011963	GCCTC	2	10	801845	801854	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011963	CCGGC	2	10	811093	811102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011963	TGCAA	2	10	821954	821963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011963	TTCCG	2	10	821982	821991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011963	CCTTT	2	10	826408	826417	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011963	GCCGG	2	10	869483	869492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011963	GCGCC	2	10	871742	871751	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_011963	TGCGC	2	10	875589	875598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011963	GAGGG	2	10	881897	881906	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011963	TCCCA	2	10	882010	882019	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_011963	GGCGG	2	10	909796	909805	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011963	CGTCG	2	10	914831	914840	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011963	CAGGG	2	10	927529	927538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011963	CCGCG	2	10	933268	933277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_011963	GCAAG	2	10	933427	933436	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011963	TTTCA	2	10	942426	942435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011963	GGGGA	2	10	991040	991049	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011963	AGGGA	2	10	994975	994984	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011963	GTCCT	2	10	995837	995846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011963	CCGGG	2	10	996867	996876	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011963	GCCCG	2	10	998289	998298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_011963	CAAGA	2	10	1003867	1003876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011963	TTTCA	2	10	1003890	1003899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011963	CCGGC	2	10	1004368	1004377	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_011963	CCCGC	2	10	1004952	1004961	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_011963	GGCGG	2	10	1005087	1005096	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011963	CCTTT	2	10	1014141	1014150	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011963	ACGGA	2	10	1017591	1017600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011963	AGCGA	2	10	1019122	1019131	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011963	CACGC	2	10	1047842	1047851	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_011963	CGAGC	2	10	1049023	1049032	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011963	GACCG	2	10	1056521	1056530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_011963	GGGCA	2	10	1056698	1056707	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011963	GCGGA	2	10	1057871	1057880	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011963	TCGCG	2	10	1059684	1059693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_011963	GCGCC	2	10	1073588	1073597	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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156	NC_011963	GGCCC	2	10	1145114	1145123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_011963	CGGCA	2	10	1157915	1157924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_011963	GGGGC	2	10	1179369	1179378	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_011963	GGCCG	2	10	1331323	1331332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_011963	CCGGC	2	10	1337579	1337588	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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191	NC_011963	GCGCC	2	10	1447624	1447633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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193	NC_011963	GGCCC	2	10	1478124	1478133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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259	NC_011963	GCGCG	3	15	1912525	1912539	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
260	NC_011963	GGACG	2	10	1927521	1927530	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
261	NC_011963	GCCCT	2	10	1934442	1934451	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
262	NC_011963	CCGCC	2	10	1934479	1934488	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
263	NC_011963	GCCGG	2	10	1940580	1940589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
264	NC_011963	CGATG	2	10	1940608	1940617	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_011963	CCGGG	2	10	1941796	1941805	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
266	NC_011963	CCGGG	2	10	1962112	1962121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_011963	CGCGC	2	10	1964924	1964933	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
268	NC_011963	TGCCC	2	10	1966018	1966027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
269	NC_011963	CGCGC	2	10	1969704	1969713	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
270	NC_011963	GCCCT	2	10	1971828	1971837	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
271	NC_011963	CGGGC	2	10	1974691	1974700	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
272	NC_011963	GCCGA	2	10	1979034	1979043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
273	NC_011963	TTGGC	2	10	1982490	1982499	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_011963	ACAGG	2	10	1984871	1984880	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_011963	CGCCC	2	10	1996558	1996567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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281	NC_011963	CGCGG	2	10	2045531	2045540	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
282	NC_011963	CCAGA	2	10	2052912	2052921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_011963	CGGGA	2	10	2056863	2056872	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
284	NC_011963	CCGGG	2	10	2056901	2056910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_011963	CCCGG	2	10	2057233	2057242	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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412	NC_011963	CGGTC	2	10	2955004	2955013	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
413	NC_011963	GCCTT	2	10	2955043	2955052	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
414	NC_011963	GGACG	2	10	2971324	2971333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_011963	GCTCC	2	10	3046536	3046545	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
422	NC_011963	GGCCG	2	10	3061588	3061597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
423	NC_011963	CCTCC	2	10	3065158	3065167	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
424	NC_011963	GCCGG	2	10	3069923	3069932	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
425	NC_011963	CTGCT	2	10	3078371	3078380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
426	NC_011963	TCAAG	2	10	3083586	3083595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
427	NC_011963	TCTGA	2	10	3083911	3083920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
428	NC_011963	CGGCC	2	10	3088723	3088732	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
429	NC_011963	ACCGG	2	10	3088908	3088917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
430	NC_011963	CTCAT	2	10	3101822	3101831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
431	NC_011963	AAGCG	2	10	3108512	3108521	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
432	NC_011963	CCGGC	2	10	3109185	3109194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
433	NC_011963	TGTCT	2	10	3109864	3109873	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
434	NC_011963	CGGCG	2	10	3114309	3114318	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
435	NC_011963	GGCGG	2	10	3122563	3122572	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
436	NC_011963	GCCGT	2	10	3130602	3130611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
437	NC_011963	GCGCA	2	10	3132355	3132364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
438	NC_011963	GATGG	2	10	3132407	3132416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
439	NC_011963	GTCGG	2	10	3146317	3146326	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
440	NC_011963	GCCGG	2	10	3146437	3146446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.