MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011962	CTCGC	2	10	345	354	0 %	20 %	20 %	60 %	221218193
2	NC_011962	TGCGC	2	10	2121	2130	0 %	20 %	40 %	40 %	221218195
3	NC_011962	GGCGC	2	10	2537	2546	0 %	0 %	60 %	40 %	221218195
4	NC_011962	CGGGC	2	10	3128	3137	0 %	0 %	60 %	40 %	221218196
5	NC_011962	CGAGC	2	10	3815	3824	20 %	0 %	40 %	40 %	221218196
6	NC_011962	CGGGT	2	10	3969	3978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011962	CGGCG	2	10	4009	4018	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011962	CGCTG	2	10	4324	4333	0 %	20 %	40 %	40 %	221218197
9	NC_011962	CGGCG	2	10	5161	5170	0 %	0 %	60 %	40 %	221218198
10	NC_011962	GGACG	2	10	5705	5714	20 %	0 %	60 %	20 %	221218199
11	NC_011962	AAGGG	2	10	6484	6493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011962	GCCGC	2	10	8871	8880	0 %	0 %	40 %	60 %	221218201
13	NC_011962	CGGCG	2	10	9322	9331	0 %	0 %	60 %	40 %	221218201
14	NC_011962	GCCCC	2	10	9817	9826	0 %	0 %	20 %	80 %	221218202
15	NC_011962	AGCGC	2	10	10347	10356	20 %	0 %	40 %	40 %	221218203
16	NC_011962	CGAGG	2	10	10438	10447	20 %	0 %	60 %	20 %	221218203
17	NC_011962	GAGGC	2	10	11654	11663	20 %	0 %	60 %	20 %	221218204
18	NC_011962	CCCTT	2	10	15580	15589	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_011962	GGCGC	2	10	15718	15727	0 %	0 %	60 %	40 %	221218209
20	NC_011962	CCAGC	2	10	16192	16201	20 %	0 %	20 %	60 %	221218209
21	NC_011962	TGGCA	2	10	16710	16719	20 %	20 %	40 %	20 %	221218209
22	NC_011962	CGGCG	2	10	17185	17194	0 %	0 %	60 %	40 %	221218210
23	NC_011962	AGCCC	2	10	17590	17599	20 %	0 %	20 %	60 %	221218210
24	NC_011962	CCGCG	2	10	19901	19910	0 %	0 %	40 %	60 %	221218213
25	NC_011962	CAGCG	2	10	20445	20454	20 %	0 %	40 %	40 %	221218213
26	NC_011962	GCGGG	2	10	21931	21940	0 %	0 %	80 %	20 %	221218215
27	NC_011962	AGCGC	2	10	23227	23236	20 %	0 %	40 %	40 %	221218216
28	NC_011962	CGCGG	2	10	24698	24707	0 %	0 %	60 %	40 %	221218217
29	NC_011962	CCGCG	2	10	25033	25042	0 %	0 %	40 %	60 %	221218217
30	NC_011962	GCGCT	2	10	25892	25901	0 %	20 %	40 %	40 %	221218218
31	NC_011962	CCGCG	2	10	25951	25960	0 %	0 %	40 %	60 %	221218218
32	NC_011962	CGCGG	2	10	26091	26100	0 %	0 %	60 %	40 %	221218218
33	NC_011962	CGGGA	2	10	27025	27034	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011962	GGTCC	2	10	27279	27288	0 %	20 %	40 %	40 %	221218219
35	NC_011962	AGCCG	2	10	28619	28628	20 %	0 %	40 %	40 %	221218221
36	NC_011962	TGCGG	2	10	29841	29850	0 %	20 %	60 %	20 %	221218221
37	NC_011962	CCGGC	2	10	29963	29972	0 %	0 %	40 %	60 %	221218221
38	NC_011962	CCCGC	2	10	30985	30994	0 %	0 %	20 %	80 %	221218222
39	NC_011962	CGCGC	2	10	31247	31256	0 %	0 %	40 %	60 %	221218222
40	NC_011962	CGGCC	2	10	31331	31340	0 %	0 %	40 %	60 %	221218222
41	NC_011962	CAGCG	2	10	34353	34362	20 %	0 %	40 %	40 %	221218225
42	NC_011962	AGCGG	2	10	37173	37182	20 %	0 %	60 %	20 %	221218227
43	NC_011962	GCGAG	2	10	40466	40475	20 %	0 %	60 %	20 %	221218230
44	NC_011962	GCCGG	2	10	41253	41262	0 %	0 %	60 %	40 %	221218231
45	NC_011962	TGCGC	2	10	41318	41327	0 %	20 %	40 %	40 %	221218231
46	NC_011962	GATCT	2	10	42614	42623	20 %	40 %	20 %	20 %	221218232
47	NC_011962	GGCCG	2	10	43421	43430	0 %	0 %	60 %	40 %	221218233
48	NC_011962	TCCCC	2	10	44024	44033	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
49	NC_011962	GCCGC	2	10	44065	44074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_011962	GAAAC	2	10	44168	44177	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011962	TGCCG	2	10	45220	45229	0 %	20 %	40 %	40 %	221218235
52	NC_011962	CGCAG	2	10	45232	45241	20 %	0 %	40 %	40 %	221218235
53	NC_011962	GGCGA	2	10	45521	45530	20 %	0 %	60 %	20 %	221218235
54	NC_011962	GGGCC	2	10	46024	46033	0 %	0 %	60 %	40 %	221218235
55	NC_011962	CCCTC	2	10	46553	46562	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
56	NC_011962	CTCGC	2	10	47023	47032	0 %	20 %	20 %	60 %	221218236
57	NC_011962	CTCGG	2	10	47401	47410	0 %	20 %	40 %	40 %	221218236
58	NC_011962	GCCCC	2	10	48267	48276	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_011962	TCTCG	2	10	49615	49624	0 %	40 %	20 %	40 %	221218239
60	NC_011962	CGGGC	2	10	50088	50097	0 %	0 %	60 %	40 %	221218239
61	NC_011962	GCCTG	2	10	51029	51038	0 %	20 %	40 %	40 %	221218240
62	NC_011962	CGCGG	2	10	52580	52589	0 %	0 %	60 %	40 %	221218241
63	NC_011962	TCGCC	2	10	53655	53664	0 %	20 %	20 %	60 %	221218242
64	NC_011962	GTTCA	2	10	55082	55091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011962	GCGCC	2	10	56343	56352	0 %	0 %	40 %	60 %	221218245
66	NC_011962	ACGCG	2	10	56398	56407	20 %	0 %	40 %	40 %	221218245
67	NC_011962	GGCCC	2	10	57735	57744	0 %	0 %	40 %	60 %	221218245
68	NC_011962	ACGGC	2	10	57879	57888	20 %	0 %	40 %	40 %	221218245
69	NC_011962	CGGCG	2	10	58693	58702	0 %	0 %	60 %	40 %	221218246
70	NC_011962	CGCAG	2	10	59446	59455	20 %	0 %	40 %	40 %	221218247
71	NC_011962	CCCCG	2	10	60075	60084	0 %	0 %	20 %	80 %	221218247
72	NC_011962	CCGGC	2	10	60156	60165	0 %	0 %	40 %	60 %	221218247
73	NC_011962	TGCAT	2	10	60346	60355	20 %	40 %	20 %	20 %	221218247
74	NC_011962	GCCGA	2	10	61557	61566	20 %	0 %	40 %	40 %	221218248
75	NC_011962	GGCGC	2	10	62155	62164	0 %	0 %	60 %	40 %	221218249
76	NC_011962	GCCGG	2	10	64425	64434	0 %	0 %	60 %	40 %	221218252
77	NC_011962	GATGT	2	10	64939	64948	20 %	40 %	40 %	0 %	221218252
78	NC_011962	GACAT	2	10	66305	66314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011962	GCATG	2	10	66692	66701	20 %	20 %	40 %	20 %	221218254
80	NC_011962	GGCGC	2	10	66755	66764	0 %	0 %	60 %	40 %	221218254
81	NC_011962	GCAGG	2	10	68501	68510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011962	GGGGC	2	10	69617	69626	0 %	0 %	80 %	20 %	221218255
83	NC_011962	GGGGC	2	10	71254	71263	0 %	0 %	80 %	20 %	221218256
84	NC_011962	GGAGC	2	10	72466	72475	20 %	0 %	60 %	20 %	221218257
85	NC_011962	TGCGG	2	10	73487	73496	0 %	20 %	60 %	20 %	221218258
86	NC_011962	TGCGG	2	10	73625	73634	0 %	20 %	60 %	20 %	221218258
87	NC_011962	GGAAC	2	10	77911	77920	40 %	0 %	40 %	20 %	221218261
88	NC_011962	AGCCC	2	10	78138	78147	20 %	0 %	20 %	60 %	221218261
89	NC_011962	GGGCC	2	10	78892	78901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011962	GGGCG	2	10	79524	79533	0 %	0 %	80 %	20 %	221218262
91	NC_011962	GGGGC	2	10	80203	80212	0 %	0 %	80 %	20 %	221218262
92	NC_011962	CCTCG	2	10	80618	80627	0 %	20 %	20 %	60 %	221218263
93	NC_011962	ATCCG	2	10	81708	81717	20 %	20 %	20 %	40 %	221218264
94	NC_011962	CGGGG	2	10	83147	83156	0 %	0 %	80 %	20 %	221218265
95	NC_011962	CGGGG	2	10	88244	88253	0 %	0 %	80 %	20 %	221218268
96	NC_011962	TGGGG	2	10	90906	90915	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011962	GCCGC	2	10	90957	90966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_011962	GGTCG	2	10	90994	91003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011962	TGCGC	2	10	91492	91501	0 %	20 %	40 %	40 %	221218270
100	NC_011962	CGCTG	2	10	91887	91896	0 %	20 %	40 %	40 %	221218270
101	NC_011962	CATCG	2	10	92828	92837	20 %	20 %	20 %	40 %	221218271
102	NC_011962	GGCGC	2	10	92864	92873	0 %	0 %	60 %	40 %	221218271
103	NC_011962	CGCGG	2	10	93223	93232	0 %	0 %	60 %	40 %	221218271
104	NC_011962	CCCGT	2	10	94692	94701	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_011962	GCTGG	2	10	95103	95112	0 %	20 %	60 %	20 %	221218273
106	NC_011962	CGGGC	2	10	95700	95709	0 %	0 %	60 %	40 %	221218273
107	NC_011962	GCCGC	2	10	95962	95971	0 %	0 %	40 %	60 %	221218273
108	NC_011962	CCCGG	2	10	97043	97052	0 %	0 %	40 %	60 %	221218274
109	NC_011962	CCGCG	2	10	97727	97736	0 %	0 %	40 %	60 %	221218275
110	NC_011962	TGCGC	2	10	98108	98117	0 %	20 %	40 %	40 %	221218275
111	NC_011962	TCGTC	2	10	99661	99670	0 %	40 %	20 %	40 %	221218276
112	NC_011962	CCGGC	3	15	100259	100273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_011962	CGGGG	2	10	100347	100356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011962	GGCGC	2	10	100541	100550	0 %	0 %	60 %	40 %	221218277
115	NC_011962	CTGAG	2	10	101534	101543	20 %	20 %	40 %	20 %	221218277
116	NC_011962	GACGG	2	10	101870	101879	20 %	0 %	60 %	20 %	221218278
117	NC_011962	GGCCG	2	10	101936	101945	0 %	0 %	60 %	40 %	221218278
118	NC_011962	GGGCG	2	10	101992	102001	0 %	0 %	80 %	20 %	221218278
119	NC_011962	CCTCG	2	10	102340	102349	0 %	20 %	20 %	60 %	221218278
120	NC_011962	GCCGC	2	10	103463	103472	0 %	0 %	40 %	60 %	221218280
121	NC_011962	CCTCG	2	10	103783	103792	0 %	20 %	20 %	60 %	221218281
122	NC_011962	CAGCG	2	10	104936	104945	20 %	0 %	40 %	40 %	221218282
123	NC_011962	GGCGG	2	10	106037	106046	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011962	GCCGG	2	10	107709	107718	0 %	0 %	60 %	40 %	221218286
125	NC_011962	GTCGA	2	10	108091	108100	20 %	20 %	40 %	20 %	221218286
126	NC_011962	TCCGC	2	10	108817	108826	0 %	20 %	20 %	60 %	221218286
127	NC_011962	CGCGC	2	10	111700	111709	0 %	0 %	40 %	60 %	221218289
128	NC_011962	AGGCG	2	10	112789	112798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011962	CGGGC	2	10	113253	113262	0 %	0 %	60 %	40 %	221218290
130	NC_011962	CGCCC	2	10	113392	113401	0 %	0 %	20 %	80 %	221218290
131	NC_011962	GCCGG	2	10	113512	113521	0 %	0 %	60 %	40 %	221218290
132	NC_011962	CGGCC	2	10	114334	114343	0 %	0 %	40 %	60 %	221218291
133	NC_011962	GCGCG	2	10	115388	115397	0 %	0 %	60 %	40 %	221218292
134	NC_011962	GGGCC	2	10	116439	116448	0 %	0 %	60 %	40 %	221218293
135	NC_011962	GGCGG	2	10	116481	116490	0 %	0 %	80 %	20 %	221218293
136	NC_011962	TCGTC	2	10	117877	117886	0 %	40 %	20 %	40 %	221218294
137	NC_011962	GCGCG	2	10	118169	118178	0 %	0 %	60 %	40 %	221218294
138	NC_011962	CGCGC	2	10	118844	118853	0 %	0 %	40 %	60 %	221218294
139	NC_011962	ATCGC	2	10	120266	120275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011962	CCTCG	2	10	120564	120573	0 %	20 %	20 %	60 %	221218296
141	NC_011962	CCGCG	2	10	121470	121479	0 %	0 %	40 %	60 %	221218296
142	NC_011962	CTCCG	2	10	121850	121859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_011962	GAAGA	2	10	122362	122371	60 %	0 %	40 %	0 %	221218297
144	NC_011962	CGATG	2	10	122868	122877	20 %	20 %	40 %	20 %	221218297
145	NC_011962	GGGCG	2	10	123513	123522	0 %	0 %	80 %	20 %	221218297
146	NC_011962	GGCCG	2	10	125584	125593	0 %	0 %	60 %	40 %	221218300
147	NC_011962	GCGCC	2	10	125637	125646	0 %	0 %	40 %	60 %	221218300
148	NC_011962	GCCGC	2	10	125741	125750	0 %	0 %	40 %	60 %	221218300
149	NC_011962	GAAGG	2	10	127973	127982	40 %	0 %	60 %	0 %	221218303
150	NC_011962	CGCGG	2	10	127992	128001	0 %	0 %	60 %	40 %	221218303
151	NC_011962	ACGCG	2	10	130141	130150	20 %	0 %	40 %	40 %	221218305
152	NC_011962	AGCGC	2	10	130762	130771	20 %	0 %	40 %	40 %	221218305
153	NC_011962	CAGGG	2	10	130799	130808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_011962	CATGG	2	10	131347	131356	20 %	20 %	40 %	20 %	221218306
155	NC_011962	CCGCC	2	10	133398	133407	0 %	0 %	20 %	80 %	221218309
156	NC_011962	GCCTC	2	10	135860	135869	0 %	20 %	20 %	60 %	221218311
157	NC_011962	GGCGC	2	10	136397	136406	0 %	0 %	60 %	40 %	221218312
158	NC_011962	GGGGC	2	10	136445	136454	0 %	0 %	80 %	20 %	221218312
159	NC_011962	CGATC	2	10	137599	137608	20 %	20 %	20 %	40 %	221218312
160	NC_011962	CGGCC	2	10	140241	140250	0 %	0 %	40 %	60 %	221218314
161	NC_011962	CGGGT	2	10	142100	142109	0 %	20 %	60 %	20 %	221218317
162	NC_011962	AGGGC	2	10	142520	142529	20 %	0 %	60 %	20 %	221218317
163	NC_011962	GATCG	2	10	143614	143623	20 %	20 %	40 %	20 %	221218319
164	NC_011962	CGGCG	2	10	144499	144508	0 %	0 %	60 %	40 %	221218320
165	NC_011962	GCGCC	2	10	144597	144606	0 %	0 %	40 %	60 %	221218320
166	NC_011962	GCGCA	2	10	144682	144691	20 %	0 %	40 %	40 %	221218320
167	NC_011962	TGCGC	2	10	144984	144993	0 %	20 %	40 %	40 %	221218320
168	NC_011962	TCGCC	2	10	145199	145208	0 %	20 %	20 %	60 %	221218320
169	NC_011962	CATGC	2	10	145654	145663	20 %	20 %	20 %	40 %	221218322
170	NC_011962	GCGGT	2	10	146186	146195	0 %	20 %	60 %	20 %	221218322
171	NC_011962	CGGCG	2	10	146904	146913	0 %	0 %	60 %	40 %	221218322
172	NC_011962	CCGCG	2	10	147420	147429	0 %	0 %	40 %	60 %	221218322
173	NC_011962	CTGGC	2	10	147628	147637	0 %	20 %	40 %	40 %	221218322
174	NC_011962	CAGAC	2	10	147817	147826	40 %	0 %	20 %	40 %	221218323
175	NC_011962	CGAGG	2	10	148381	148390	20 %	0 %	60 %	20 %	221218324
176	NC_011962	GCCTC	2	10	150624	150633	0 %	20 %	20 %	60 %	221218327
177	NC_011962	GCGCT	2	10	150671	150680	0 %	20 %	40 %	40 %	221218327
178	NC_011962	CAGAC	2	10	151131	151140	40 %	0 %	20 %	40 %	221218328
179	NC_011962	CCGCG	2	10	152946	152955	0 %	0 %	40 %	60 %	221218329
180	NC_011962	GCACC	2	10	153689	153698	20 %	0 %	20 %	60 %	221218330

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.