MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011962	CGGGT	2	10	3969	3978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011962	CGGCG	2	10	4009	4018	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011962	AAGGG	2	10	6484	6493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011962	CCCTT	2	10	15580	15589	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011962	CGGGA	2	10	27025	27034	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011962	TCCCC	2	10	44024	44033	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_011962	GCCGC	2	10	44065	44074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011962	GAAAC	2	10	44168	44177	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011962	CCCTC	2	10	46553	46562	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_011962	GCCCC	2	10	48267	48276	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_011962	GTTCA	2	10	55082	55091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011962	GACAT	2	10	66305	66314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011962	GCAGG	2	10	68501	68510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011962	GGGCC	2	10	78892	78901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011962	TGGGG	2	10	90906	90915	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011962	GCCGC	2	10	90957	90966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011962	GGTCG	2	10	90994	91003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011962	CCCGT	2	10	94692	94701	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_011962	CCGGC	3	15	100259	100273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011962	CGGGG	2	10	100347	100356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011962	GGCGG	2	10	106037	106046	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011962	AGGCG	2	10	112789	112798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011962	ATCGC	2	10	120266	120275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011962	CTCCG	2	10	121850	121859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011962	CAGGG	2	10	130799	130808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.