MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011962	CCCG	2	8	812	819	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_011962	GGGC	2	8	2727	2734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011962	GTCC	2	8	5254	5261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011962	GGTC	2	8	10780	10787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011962	GTCT	2	8	12525	12532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011962	ACGC	2	8	24158	24165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011962	CGAC	3	12	24264	24275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011962	CGGG	2	8	27119	27126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011962	GAGG	2	8	38221	38228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011962	CCCG	2	8	43154	43161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_011962	CACG	2	8	43797	43804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011962	CCGG	2	8	43837	43844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011962	GGCC	2	8	45137	45144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011962	AGGG	2	8	45171	45178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011962	GCCG	2	8	46542	46549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011962	GCCC	2	8	50417	50424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_011962	GCCT	2	8	54847	54854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011962	CATT	2	8	64058	64065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011962	GGTG	2	8	68023	68030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011962	GGTC	2	8	68419	68426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011962	GGAG	2	8	77124	77131	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011962	GCAC	2	8	77147	77154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011962	TTCA	2	8	77175	77182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011962	ATGA	2	8	77202	77209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011962	GCCC	2	8	85497	85504	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_011962	CCGG	2	8	88670	88677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011962	TCGC	2	8	88808	88815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011962	GGGC	2	8	88963	88970	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011962	CCGG	2	8	90709	90716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011962	GCGT	2	8	90784	90791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011962	CCCG	2	8	100284	100291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_011962	CTGC	2	8	100303	100310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011962	CTGC	2	8	100378	100385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011962	CGCC	2	8	100430	100437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_011962	CGGG	2	8	103910	103917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011962	TCGA	2	8	104093	104100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011962	CGCT	2	8	105307	105314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011962	AGGC	2	8	107257	107264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011962	CGGA	2	8	110953	110960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011962	TGCC	2	8	112726	112733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011962	CTCC	2	8	120280	120287	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_011962	ATCG	2	8	120360	120367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011962	CCTC	2	8	125826	125833	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_011962	TCGA	2	8	131541	131548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011962	AGGA	2	8	132436	132443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011962	CGCC	2	8	133196	133203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_011962	CGCC	2	8	133205	133212	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_011962	CCCA	2	8	142832	142839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.