MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011962	GCCC	2	8	128	135	0 %	0 %	25 %	75 %	221218193
2	NC_011962	CCCG	2	8	197	204	0 %	0 %	25 %	75 %	221218193
3	NC_011962	CCGG	2	8	337	344	0 %	0 %	50 %	50 %	221218193
4	NC_011962	ATGG	2	8	380	387	25 %	25 %	50 %	0 %	221218193
5	NC_011962	GCCT	2	8	576	583	0 %	25 %	25 %	50 %	221218193
6	NC_011962	CGGG	2	8	1891	1898	0 %	0 %	75 %	25 %	221218195
7	NC_011962	GCCG	2	8	2017	2024	0 %	0 %	50 %	50 %	221218195
8	NC_011962	CCGC	2	8	2460	2467	0 %	0 %	25 %	75 %	221218195
9	NC_011962	CGGC	2	8	3007	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	221218196
10	NC_011962	GCTC	2	8	3199	3206	0 %	25 %	25 %	50 %	221218196
11	NC_011962	CGGC	2	8	3300	3307	0 %	0 %	50 %	50 %	221218196
12	NC_011962	GGCG	2	8	3692	3699	0 %	0 %	75 %	25 %	221218196
13	NC_011962	CGCC	2	8	3709	3716	0 %	0 %	25 %	75 %	221218196
14	NC_011962	GCGG	2	8	4112	4119	0 %	0 %	75 %	25 %	221218197
15	NC_011962	CGGC	2	8	4396	4403	0 %	0 %	50 %	50 %	221218197
16	NC_011962	GGGC	2	8	4432	4439	0 %	0 %	75 %	25 %	221218197
17	NC_011962	GGCG	2	8	4474	4481	0 %	0 %	75 %	25 %	221218197
18	NC_011962	GCCC	2	8	4585	4592	0 %	0 %	25 %	75 %	221218197
19	NC_011962	CGGT	2	8	5572	5579	0 %	25 %	50 %	25 %	221218199
20	NC_011962	CGCC	2	8	6308	6315	0 %	0 %	25 %	75 %	221218199
21	NC_011962	ATCC	2	8	6686	6693	25 %	25 %	0 %	50 %	221218200
22	NC_011962	CGGC	2	8	7327	7334	0 %	0 %	50 %	50 %	221218200
23	NC_011962	GGTG	2	8	7525	7532	0 %	25 %	75 %	0 %	221218200
24	NC_011962	AGCC	2	8	7686	7693	25 %	0 %	25 %	50 %	221218200
25	NC_011962	CGGT	2	8	8015	8022	0 %	25 %	50 %	25 %	221218201
26	NC_011962	AGGC	2	8	8132	8139	25 %	0 %	50 %	25 %	221218201
27	NC_011962	GCAG	2	8	8628	8635	25 %	0 %	50 %	25 %	221218201
28	NC_011962	GCCC	2	8	8926	8933	0 %	0 %	25 %	75 %	221218201
29	NC_011962	GGCG	2	8	9183	9190	0 %	0 %	75 %	25 %	221218201
30	NC_011962	CATC	2	8	9366	9373	25 %	25 %	0 %	50 %	221218201
31	NC_011962	GCCC	2	8	9476	9483	0 %	0 %	25 %	75 %	221218202
32	NC_011962	GCGG	2	8	10626	10633	0 %	0 %	75 %	25 %	221218203
33	NC_011962	CGGC	2	8	10890	10897	0 %	0 %	50 %	50 %	221218204
34	NC_011962	CGGC	2	8	11268	11275	0 %	0 %	50 %	50 %	221218204
35	NC_011962	GGGC	2	8	11524	11531	0 %	0 %	75 %	25 %	221218204
36	NC_011962	CTGA	2	8	11760	11767	25 %	25 %	25 %	25 %	221218205
37	NC_011962	AGCG	2	8	12022	12029	25 %	0 %	50 %	25 %	221218205
38	NC_011962	GCTC	2	8	13023	13030	0 %	25 %	25 %	50 %	221218206
39	NC_011962	CCGA	2	8	13832	13839	25 %	0 %	25 %	50 %	221218207
40	NC_011962	ACGA	2	8	15478	15485	50 %	0 %	25 %	25 %	221218208
41	NC_011962	CCGG	2	8	15634	15641	0 %	0 %	50 %	50 %	221218209
42	NC_011962	CCGG	2	8	16050	16057	0 %	0 %	50 %	50 %	221218209
43	NC_011962	CGCC	2	8	16124	16131	0 %	0 %	25 %	75 %	221218209
44	NC_011962	GCCC	2	8	16318	16325	0 %	0 %	25 %	75 %	221218209
45	NC_011962	CGCC	2	8	16560	16567	0 %	0 %	25 %	75 %	221218209
46	NC_011962	AGCC	2	8	16631	16638	25 %	0 %	25 %	50 %	221218209
47	NC_011962	GCAG	2	8	17134	17141	25 %	0 %	50 %	25 %	221218210
48	NC_011962	CGGA	2	8	17392	17399	25 %	0 %	50 %	25 %	221218210
49	NC_011962	GGGC	2	8	17903	17910	0 %	0 %	75 %	25 %	221218211
50	NC_011962	GCAG	2	8	18297	18304	25 %	0 %	50 %	25 %	221218211
51	NC_011962	CGCC	2	8	18561	18568	0 %	0 %	25 %	75 %	221218211
52	NC_011962	GGCG	2	8	18732	18739	0 %	0 %	75 %	25 %	221218211
53	NC_011962	TTCC	2	8	18764	18771	0 %	50 %	0 %	50 %	221218212
54	NC_011962	CGGC	2	8	19002	19009	0 %	0 %	50 %	50 %	221218212
55	NC_011962	CGGG	2	8	19573	19580	0 %	0 %	75 %	25 %	221218212
56	NC_011962	GCCC	2	8	19886	19893	0 %	0 %	25 %	75 %	221218213
57	NC_011962	CGCC	2	8	20162	20169	0 %	0 %	25 %	75 %	221218213
58	NC_011962	CCCT	2	8	20491	20498	0 %	25 %	0 %	75 %	221218213
59	NC_011962	CGAG	2	8	21141	21148	25 %	0 %	50 %	25 %	221218214
60	NC_011962	CCGC	2	8	21519	21526	0 %	0 %	25 %	75 %	221218214
61	NC_011962	CGGT	2	8	22062	22069	0 %	25 %	50 %	25 %	221218215
62	NC_011962	CCCG	2	8	22268	22275	0 %	0 %	25 %	75 %	221218215
63	NC_011962	CTCC	2	8	24838	24845	0 %	25 %	0 %	75 %	221218217
64	NC_011962	CCGC	2	8	25311	25318	0 %	0 %	25 %	75 %	221218217
65	NC_011962	GCCC	2	8	25546	25553	0 %	0 %	25 %	75 %	221218217
66	NC_011962	GGGC	2	8	25641	25648	0 %	0 %	75 %	25 %	221218217
67	NC_011962	CGGC	2	8	25969	25976	0 %	0 %	50 %	50 %	221218218
68	NC_011962	GCGG	2	8	27441	27448	0 %	0 %	75 %	25 %	221218219
69	NC_011962	GCTG	2	8	28502	28509	0 %	25 %	50 %	25 %	221218221
70	NC_011962	TCGA	2	8	29005	29012	25 %	25 %	25 %	25 %	221218221
71	NC_011962	GGCG	2	8	29289	29296	0 %	0 %	75 %	25 %	221218221
72	NC_011962	CCGG	2	8	29363	29370	0 %	0 %	50 %	50 %	221218221
73	NC_011962	CGGC	2	8	29510	29517	0 %	0 %	50 %	50 %	221218221
74	NC_011962	GGCC	2	8	29554	29561	0 %	0 %	50 %	50 %	221218221
75	NC_011962	CGCC	2	8	29657	29664	0 %	0 %	25 %	75 %	221218221
76	NC_011962	AGCC	2	8	30226	30233	25 %	0 %	25 %	50 %	221218221
77	NC_011962	AGGA	2	8	31496	31503	50 %	0 %	50 %	0 %	221218222
78	NC_011962	CCCA	2	8	31593	31600	25 %	0 %	0 %	75 %	221218222
79	NC_011962	GGCG	2	8	31711	31718	0 %	0 %	75 %	25 %	221218222
80	NC_011962	GCGG	2	8	32077	32084	0 %	0 %	75 %	25 %	221218223
81	NC_011962	GCCA	2	8	32135	32142	25 %	0 %	25 %	50 %	221218223
82	NC_011962	GGTC	2	8	32445	32452	0 %	25 %	50 %	25 %	221218223
83	NC_011962	GCAG	2	8	32673	32680	25 %	0 %	50 %	25 %	221218223
84	NC_011962	ACGG	2	8	32822	32829	25 %	0 %	50 %	25 %	221218223
85	NC_011962	GCCG	2	8	33211	33218	0 %	0 %	50 %	50 %	221218223
86	NC_011962	GGCA	2	8	33601	33608	25 %	0 %	50 %	25 %	221218224
87	NC_011962	CAGG	2	8	33705	33712	25 %	0 %	50 %	25 %	221218224
88	NC_011962	CGCC	2	8	35479	35486	0 %	0 %	25 %	75 %	221218226
89	NC_011962	GCCC	2	8	36004	36011	0 %	0 %	25 %	75 %	221218226
90	NC_011962	CGGC	2	8	36286	36293	0 %	0 %	50 %	50 %	221218226
91	NC_011962	GCCC	2	8	36706	36713	0 %	0 %	25 %	75 %	221218227
92	NC_011962	TCCG	2	8	37041	37048	0 %	25 %	25 %	50 %	221218227
93	NC_011962	GCGG	2	8	37240	37247	0 %	0 %	75 %	25 %	221218228
94	NC_011962	CCCA	2	8	38525	38532	25 %	0 %	0 %	75 %	221218229
95	NC_011962	GATC	2	8	39492	39499	25 %	25 %	25 %	25 %	221218230
96	NC_011962	CTCG	2	8	39576	39583	0 %	25 %	25 %	50 %	221218230
97	NC_011962	CTGT	2	8	39615	39622	0 %	50 %	25 %	25 %	221218230
98	NC_011962	GCCC	2	8	40288	40295	0 %	0 %	25 %	75 %	221218230
99	NC_011962	GCAA	2	8	43053	43060	50 %	0 %	25 %	25 %	221218232
100	NC_011962	CGGC	2	8	43652	43659	0 %	0 %	50 %	50 %	221218233
101	NC_011962	CGGG	2	8	44339	44346	0 %	0 %	75 %	25 %	221218234
102	NC_011962	ACGC	2	8	44794	44801	25 %	0 %	25 %	50 %	221218234
103	NC_011962	GACC	2	8	44888	44895	25 %	0 %	25 %	50 %	221218234
104	NC_011962	CGAG	2	8	45426	45433	25 %	0 %	50 %	25 %	221218235
105	NC_011962	CTGC	2	8	45850	45857	0 %	25 %	25 %	50 %	221218235
106	NC_011962	CGAA	2	8	45993	46000	50 %	0 %	25 %	25 %	221218235
107	NC_011962	GACG	2	8	46441	46448	25 %	0 %	50 %	25 %	221218235
108	NC_011962	ATCT	2	8	46690	46697	25 %	50 %	0 %	25 %	221218236
109	NC_011962	GCCC	2	8	47124	47131	0 %	0 %	25 %	75 %	221218236
110	NC_011962	CGGA	2	8	47631	47638	25 %	0 %	50 %	25 %	221218237
111	NC_011962	GGCG	2	8	47837	47844	0 %	0 %	75 %	25 %	221218237
112	NC_011962	CCCG	2	8	49022	49029	0 %	0 %	25 %	75 %	221218238
113	NC_011962	GACC	2	8	49423	49430	25 %	0 %	25 %	50 %	221218239
114	NC_011962	ACCC	2	8	50395	50402	25 %	0 %	0 %	75 %	221218239
115	NC_011962	GCTC	2	8	50697	50704	0 %	25 %	25 %	50 %	221218240
116	NC_011962	GCCA	2	8	51007	51014	25 %	0 %	25 %	50 %	221218240
117	NC_011962	CGGC	2	8	51548	51555	0 %	0 %	50 %	50 %	221218240
118	NC_011962	CGAC	2	8	51590	51597	25 %	0 %	25 %	50 %	221218240
119	NC_011962	CGAC	2	8	51689	51696	25 %	0 %	25 %	50 %	221218240
120	NC_011962	GCGG	3	12	52332	52343	0 %	0 %	75 %	25 %	221218241
121	NC_011962	GACC	2	8	52652	52659	25 %	0 %	25 %	50 %	221218241
122	NC_011962	CGGC	2	8	52846	52853	0 %	0 %	50 %	50 %	221218241
123	NC_011962	CGAC	2	8	52933	52940	25 %	0 %	25 %	50 %	221218241
124	NC_011962	GGCG	2	8	53230	53237	0 %	0 %	75 %	25 %	221218242
125	NC_011962	GTGG	2	8	53665	53672	0 %	25 %	75 %	0 %	221218242
126	NC_011962	GGGC	2	8	54053	54060	0 %	0 %	75 %	25 %	221218243
127	NC_011962	GGGC	2	8	54281	54288	0 %	0 %	75 %	25 %	221218243
128	NC_011962	CTCC	2	8	54584	54591	0 %	25 %	0 %	75 %	221218243
129	NC_011962	CGGG	2	8	55369	55376	0 %	0 %	75 %	25 %	221218244
130	NC_011962	GTCG	2	8	55548	55555	0 %	25 %	50 %	25 %	221218244
131	NC_011962	CTTC	2	8	55815	55822	0 %	50 %	0 %	50 %	221218244
132	NC_011962	GAGC	2	8	55833	55840	25 %	0 %	50 %	25 %	221218244
133	NC_011962	ATCT	2	8	56300	56307	25 %	50 %	0 %	25 %	221218245
134	NC_011962	CCCG	2	8	56606	56613	0 %	0 %	25 %	75 %	221218245
135	NC_011962	GTCG	2	8	56866	56873	0 %	25 %	50 %	25 %	221218245
136	NC_011962	CGGC	2	8	57309	57316	0 %	0 %	50 %	50 %	221218245
137	NC_011962	GCTC	2	8	57507	57514	0 %	25 %	25 %	50 %	221218245
138	NC_011962	GCCA	2	8	57530	57537	25 %	0 %	25 %	50 %	221218245
139	NC_011962	ATCT	2	8	57758	57765	25 %	50 %	0 %	25 %	221218245
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141	NC_011962	GACC	2	8	57976	57983	25 %	0 %	25 %	50 %	221218245
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.