MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011962	TCC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011962	GGC	2	6	1658	1663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011962	GGA	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011962	GAG	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011962	CAG	2	6	2742	2747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011962	CGT	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011962	GTC	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011962	CGG	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011962	GCC	2	6	5378	5383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011962	CGG	2	6	10793	10798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011962	CTG	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011962	CGT	2	6	12509	12514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011962	CAA	2	6	12608	12613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011962	ATC	2	6	12650	12655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011962	CAT	2	6	12664	12669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011962	AGC	2	6	12672	12677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011962	AGG	3	9	12708	12716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011962	TGT	2	6	21881	21886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011962	CTT	2	6	21891	21896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011962	GCC	2	6	22895	22900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011962	GCG	2	6	22901	22906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011962	CGG	2	6	22971	22976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011962	CAC	2	6	24140	24145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011962	GAT	2	6	24183	24188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011962	ACC	2	6	24217	24222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011962	GCC	2	6	24230	24235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011962	GCT	2	6	24252	24257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011962	GCC	2	6	25772	25777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011962	TAT	2	6	25829	25834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011962	GCG	2	6	26857	26862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011962	CGG	2	6	26950	26955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011962	GTG	2	6	26961	26966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011962	CCG	2	6	27003	27008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011962	AGA	2	6	27053	27058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011962	GCG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011962	GCT	2	6	38013	38018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011962	GCG	2	6	38110	38115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011962	ATT	2	6	38119	38124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011962	CAA	2	6	41173	41178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011962	GGA	3	9	41180	41188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011962	GCT	2	6	42291	42296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011962	GGC	2	6	42303	42308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011962	CCT	2	6	43178	43183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011962	CGG	2	6	43203	43208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011962	CTT	2	6	43218	43223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011962	CGC	2	6	43252	43257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011962	GCA	2	6	43285	43290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011962	AGA	2	6	43296	43301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011962	CTT	2	6	43679	43684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011962	GCC	2	6	43691	43696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011962	GAG	2	6	43722	43727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011962	GCC	2	6	43877	43882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011962	CCG	2	6	43887	43892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011962	GAG	2	6	43903	43908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011962	GCC	2	6	43951	43956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011962	TCC	2	6	43961	43966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011962	GAG	2	6	43970	43975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011962	GCC	2	6	44006	44011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011962	CCG	2	6	44016	44021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011962	GAG	2	6	44038	44043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011962	CGA	2	6	44151	44156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011962	TTC	2	6	44160	44165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011962	AAT	2	6	45053	45058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011962	GAG	2	6	45101	45106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011962	CGG	2	6	46475	46480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011962	CCG	2	6	46527	46532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011962	CAG	2	6	46606	46611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011962	GAC	2	6	49364	49369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011962	CGG	2	6	53880	53885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011962	GAG	2	6	54836	54841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011962	TCC	2	6	54858	54863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011962	GCC	2	6	54910	54915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011962	CGC	2	6	54930	54935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011962	GCT	2	6	55008	55013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011962	CCT	2	6	55114	55119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011962	GAT	2	6	55185	55190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011962	GCC	2	6	59338	59343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011962	GCC	2	6	60576	60581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011962	CTC	2	6	60644	60649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011962	GGC	2	6	60700	60705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011962	GCC	2	6	60726	60731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011962	GCC	2	6	63069	63074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011962	TCC	2	6	63075	63080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011962	GCT	2	6	63177	63182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011962	CGC	3	9	63247	63255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011962	CAC	2	6	64010	64015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011962	CGG	2	6	64106	64111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011962	GAG	2	6	67803	67808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011962	GGC	2	6	67831	67836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011962	GCG	2	6	67925	67930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011962	GCT	2	6	67991	67996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011962	TCG	2	6	68009	68014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011962	ACG	2	6	68096	68101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011962	TTG	2	6	68107	68112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011962	GTG	2	6	68161	68166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011962	GAG	2	6	68267	68272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011962	GCT	2	6	68365	68370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011962	CAG	2	6	68376	68381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011962	AGC	2	6	68481	68486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011962	GCG	2	6	68534	68539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011962	AGC	2	6	68565	68570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011962	GCC	2	6	68829	68834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011962	GCC	2	6	68874	68879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011962	GCG	2	6	68898	68903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011962	CGT	2	6	69000	69005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011962	GCG	2	6	69039	69044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011962	CGC	2	6	69063	69068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011962	CCG	2	6	69099	69104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011962	AGG	2	6	69944	69949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011962	GGA	2	6	72073	72078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011962	GGC	2	6	77070	77075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011962	CGG	2	6	77094	77099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011962	TCC	2	6	77104	77109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011962	AGA	2	6	77155	77160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011962	GGC	2	6	84500	84505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011962	GCC	2	6	85521	85526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011962	GCA	2	6	85626	85631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011962	GCC	2	6	88698	88703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011962	GCC	3	9	88767	88775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011962	TGC	2	6	88835	88840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011962	TCG	2	6	88844	88849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011962	AGG	2	6	88977	88982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011962	CAT	2	6	88987	88992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011962	CCG	3	9	89007	89015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011962	CCG	2	6	89037	89042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011962	AGG	2	6	89052	89057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011962	GCC	2	6	89075	89080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011962	CCG	3	9	89199	89207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011962	GCC	2	6	89222	89227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011962	CCG	2	6	89235	89240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011962	GAG	2	6	89267	89272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011962	CGG	2	6	89301	89306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011962	GGC	2	6	90696	90701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011962	GGC	2	6	90747	90752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011962	CGG	2	6	90795	90800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011962	GGC	2	6	90820	90825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011962	TCG	2	6	90853	90858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011962	GCG	2	6	90871	90876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011962	GCG	3	9	90930	90938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011962	GCC	2	6	91025	91030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011962	GCG	2	6	91053	91058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011962	GAC	2	6	92072	92077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011962	GTC	2	6	93635	93640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011962	GCC	2	6	93662	93667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011962	GCC	2	6	100468	100473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_011962	CGG	2	6	110901	110906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.