MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011961	TG	3	6	88	93	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011961	CG	3	6	103	108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011961	AC	3	6	133	138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011961	CA	3	6	152	157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011961	GC	3	6	9662	9667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011961	GC	3	6	9898	9903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011961	CG	3	6	9933	9938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011961	GC	3	6	12858	12863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011961	CG	3	6	13956	13961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011961	GA	3	6	20812	20817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011961	GC	3	6	20857	20862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011961	GC	3	6	24585	24590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011961	GC	3	6	35360	35365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011961	AG	3	6	43466	43471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011961	AG	3	6	54238	54243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011961	TC	3	6	54802	54807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011961	CT	3	6	54812	54817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011961	GC	3	6	55071	55076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011961	CG	3	6	55536	55541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011961	CG	3	6	55551	55556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011961	GC	3	6	55744	55749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011961	TG	3	6	56065	56070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011961	AG	3	6	73750	73755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011961	CG	3	6	74215	74220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011961	GC	3	6	75605	75610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011961	TC	3	6	78990	78995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011961	CG	3	6	80767	80772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011961	GC	3	6	83202	83207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011961	TC	3	6	94552	94557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011961	GA	3	6	95347	95352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011961	CT	3	6	106117	106122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011961	AG	3	6	121324	121329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011961	GC	3	6	123773	123778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011961	GC	3	6	124229	124234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011961	TC	3	6	133461	133466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011961	CG	3	6	133547	133552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011961	GC	3	6	133756	133761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011961	CG	4	8	136408	136415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011961	CG	3	6	136474	136479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011961	CG	3	6	136616	136621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011961	GC	4	8	136671	136678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011961	GC	3	6	136786	136791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011961	CT	3	6	136850	136855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011961	GA	3	6	137485	137490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011961	GT	3	6	137607	137612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011961	GC	3	6	137653	137658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011961	CG	3	6	137776	137781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011961	AG	3	6	138405	138410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011961	GC	3	6	142731	142736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011961	GA	3	6	147727	147732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011961	CG	3	6	147796	147801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011961	GT	3	6	149277	149282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011961	GC	3	6	151904	151909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011961	GC	3	6	153280	153285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011961	CG	3	6	153536	153541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011961	CG	3	6	157716	157721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011961	GC	3	6	169349	169354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011961	CG	3	6	170115	170120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011961	GT	3	6	171572	171577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011961	GC	3	6	186732	186737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011961	GA	3	6	189551	189556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011961	TC	3	6	189942	189947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011961	TC	4	8	191200	191207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011961	GC	3	6	198630	198635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011961	TC	3	6	198753	198758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011961	CG	3	6	199552	199557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011961	GC	4	8	204949	204956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011961	GC	3	6	211601	211606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011961	GC	3	6	212764	212769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011961	CG	3	6	212793	212798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011961	AG	3	6	214644	214649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011961	GC	3	6	215397	215402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011961	GC	3	6	215509	215514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011961	GT	3	6	224998	225003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011961	GC	3	6	225597	225602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011961	GC	3	6	226406	226411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011961	CG	3	6	228876	228881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011961	CG	3	6	229132	229137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011961	CG	3	6	229610	229615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011961	CG	3	6	231978	231983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011961	AG	3	6	232014	232019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011961	CG	3	6	232786	232791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011961	CG	3	6	233131	233136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011961	TC	3	6	239499	239504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011961	CG	3	6	241091	241096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011961	GA	4	8	250628	250635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011961	GC	3	6	250719	250724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011961	CG	3	6	253579	253584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011961	GA	3	6	255279	255284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011961	GA	3	6	255294	255299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011961	GC	3	6	258101	258106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011961	GC	3	6	259839	259844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011961	CT	3	6	276219	276224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011961	CG	3	6	276399	276404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011961	GC	3	6	299853	299858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011961	AC	3	6	299903	299908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011961	GT	3	6	307059	307064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011961	GA	4	8	308563	308570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011961	GC	3	6	312704	312709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011961	AC	4	8	331564	331571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011961	CG	3	6	331801	331806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011961	CT	3	6	331858	331863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011961	GC	3	6	332016	332021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011961	CG	3	6	333205	333210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011961	GC	3	6	333249	333254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011961	GC	4	8	339990	339997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011961	TG	3	6	340182	340187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011961	TC	3	6	340191	340196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011961	GA	3	6	345110	345115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011961	CG	3	6	350051	350056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011961	GA	3	6	362652	362657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011961	CG	3	6	368189	368194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011961	AG	3	6	368243	368248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011961	TG	3	6	368325	368330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011961	TG	3	6	368351	368356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011961	CG	3	6	370019	370024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011961	CG	3	6	370815	370820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011961	CG	3	6	372133	372138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011961	GC	3	6	374286	374291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011961	GA	3	6	374528	374533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011961	TC	3	6	378608	378613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011961	CG	3	6	384692	384697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011961	CT	3	6	384764	384769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011961	TC	5	10	391273	391282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011961	GC	3	6	392682	392687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011961	GC	3	6	394601	394606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011961	GA	3	6	404944	404949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011961	CG	3	6	406399	406404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011961	AG	4	8	407930	407937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011961	CG	3	6	409706	409711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011961	GT	3	6	417716	417721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011961	GA	3	6	423325	423330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011961	GC	3	6	430984	430989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011961	GC	3	6	438094	438099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011961	CG	3	6	439942	439947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011961	GC	3	6	440067	440072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011961	CG	3	6	440336	440341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011961	CG	3	6	447654	447659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011961	TG	3	6	451337	451342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011961	CG	3	6	452907	452912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011961	GC	3	6	455610	455615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011961	CG	3	6	457511	457516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011961	CG	3	6	461356	461361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011961	CG	3	6	462697	462702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011961	GC	3	6	463358	463363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011961	AG	3	6	465899	465904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011961	TC	3	6	471222	471227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011961	CG	3	6	476304	476309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011961	GC	3	6	476533	476538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011961	TC	3	6	478711	478716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011961	AG	3	6	479376	479381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011961	GC	3	6	481861	481866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_011961	GC	3	6	482050	482055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011961	GT	3	6	482152	482157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_011961	GC	3	6	883831	883836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
310	NC_011961	AG	3	6	883953	883958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_011961	CG	3	6	884029	884034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
312	NC_011961	GA	3	6	887808	887813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011961	CG	4	8	889294	889301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
314	NC_011961	GA	3	6	904268	904273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.