MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	ACCGGC	2	12	749	760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634494
2	NC_011960	CCGCTG	2	12	779	790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634494
3	NC_011960	GCCCTC	2	12	1319	1330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221634494
4	NC_011960	GACGAG	2	12	3863	3874	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221634498
5	NC_011960	CCCCAG	2	12	5223	5234	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221634499
6	NC_011960	GCCCGA	2	12	5481	5492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634499
7	NC_011960	CACGAG	2	12	5666	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221634500
8	NC_011960	GGGTCT	2	12	5737	5748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221634500
9	NC_011960	AGCGCC	2	12	6171	6182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634500
10	NC_011960	CGAGCG	2	12	6513	6524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221634501
11	NC_011960	CACGAG	2	12	6721	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221634501
12	NC_011960	CATGGG	2	12	10030	10041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221634506
13	NC_011960	GCGGTC	2	12	11204	11215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634507
14	NC_011960	TGGCCG	2	12	13035	13046	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634509
15	NC_011960	CGCGCC	2	12	20719	20730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634515
16	NC_011960	GCTGAT	2	12	24899	24910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221634520
17	NC_011960	GCGACA	2	12	25840	25851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221634520
18	NC_011960	GGGCCG	2	12	27798	27809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221634523
19	NC_011960	CGCCCG	2	12	28034	28045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634523
20	NC_011960	CGCAGG	2	12	30325	30336	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221634525
21	NC_011960	GATCCA	2	12	31305	31316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221634526
22	NC_011960	GGTCTT	2	12	38938	38949	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	221634533
23	NC_011960	GCCCGC	2	12	38965	38976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634533
24	NC_011960	TGTTCA	2	12	39282	39293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221634533
25	NC_011960	CGAGGC	2	12	39757	39768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221634533
26	NC_011960	CAGCAT	2	12	46170	46181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221634544
27	NC_011960	CCTCGG	2	12	48688	48699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634547
28	NC_011960	GCCGCA	2	12	48816	48827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634547
29	NC_011960	AGGAGC	2	12	49046	49057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221634548
30	NC_011960	CAGCGC	2	12	49608	49619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634549
31	NC_011960	GACGGT	2	12	50772	50783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221634552
32	NC_011960	CATAGG	2	12	58073	58084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221634559
33	NC_011960	GGGGCC	2	12	58809	58820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221634559
34	NC_011960	CGAGGG	2	12	58856	58867	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634559
35	NC_011960	GCCCCC	2	12	60515	60526	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	221634561
36	NC_011960	GCCCGC	2	12	60995	61006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634561
37	NC_011960	GCGGTC	2	12	61316	61327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634561
38	NC_011960	GGGACG	2	12	61796	61807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634562
39	NC_011960	CGCGGC	2	12	62751	62762	0 %	0 %	50 %	50 %	221634563
40	NC_011960	AGCTGC	2	12	63014	63025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221634563
41	NC_011960	CACCGC	2	12	67095	67106	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221634566
42	NC_011960	ATCACG	2	12	67981	67992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221634567
43	NC_011960	GCACCG	2	12	69963	69974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634568
44	NC_011960	GGGCGA	2	12	70961	70972	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634569
45	NC_011960	GCAGGG	2	12	71612	71623	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634570
46	NC_011960	CTCGGC	2	12	71713	71724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634570
47	NC_011960	CCAGCC	2	12	71805	71816	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221634570
48	NC_011960	GGCCGC	2	12	72046	72057	0 %	0 %	50 %	50 %	221634570
49	NC_011960	TCGAGC	2	12	72302	72313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221634570
50	NC_011960	GGCGCG	2	12	72413	72424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221634570
51	NC_011960	CGCTTG	2	12	72530	72541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221634570
52	NC_011960	CGCCAC	2	12	73634	73645	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221634571
53	NC_011960	CGGGCG	2	12	76425	76436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221634574
54	NC_011960	TCCTGA	2	12	76866	76877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221634575
55	NC_011960	GCTTCC	2	12	77766	77777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221634576
56	NC_011960	CTGGCC	2	12	79653	79664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634578
57	NC_011960	GCAGGA	2	12	80625	80636	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221634579
58	NC_011960	CCCGGC	2	12	81382	81393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634580
59	NC_011960	GCCAGC	2	12	83485	83496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634581
60	NC_011960	AGGGTC	2	12	83746	83757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221634581
61	NC_011960	GCCTCG	2	12	84423	84434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634582
62	NC_011960	GCCCGC	2	12	84677	84688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221634582
63	NC_011960	CGCTGG	2	12	85373	85384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634583
64	NC_011960	GGGCGA	2	12	85512	85523	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634583
65	NC_011960	GCCCGA	2	12	85690	85701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634583
66	NC_011960	AGCGCC	2	12	86012	86023	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634583
67	NC_011960	GATCAG	2	12	86839	86850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221634583
68	NC_011960	GCCAGC	2	12	87701	87712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634584
69	NC_011960	CGGCCT	2	12	88044	88055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634584
70	NC_011960	CTCGGC	2	12	88585	88596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221634584
71	NC_011960	CACCGG	2	12	94951	94962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634587
72	NC_011960	CACCGG	2	12	95608	95619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634587
73	NC_011960	CGGTGC	2	12	95775	95786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634587
74	NC_011960	CACCGG	2	12	96286	96297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634587
75	NC_011960	CGGTGC	2	12	96453	96464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221634587
76	NC_011960	GATCGC	2	12	97649	97660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221634588
77	NC_011960	GGGCGA	2	12	98795	98806	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634590
78	NC_011960	AGCGTG	2	12	99309	99320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221634591
79	NC_011960	CGAGGG	2	12	99322	99333	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221634591
80	NC_011960	CACCGC	2	12	99881	99892	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221634591
81	NC_011960	GGTGAG	2	12	99899	99910	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	221634591
82	NC_011960	AGCGCC	2	12	100779	100790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634592
83	NC_011960	GGCCCA	2	12	101457	101468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221634593

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.